“喂，别哭了。”柯南听着身边的抽泣声，感觉头都大了，“你家在这附近吧？”
柯南感觉今天简直就是他的受难日。先是少年侦探团被同学俊也委托寻找失踪的哥哥，新来的转校生灰原哀也跟着侦探团一起行动。在调查中，柯南怀疑对方是被组织绑架了，因为都是像乌鸦一样一身黑。柯南担心这些孩子被卷进去，所以想要甩开他们独自调查，却没想到被新同学识破了。
柯南没办法，只能把他们带在身边。偏偏今天七月请假没有来，不能帮他照顾这些孩子，结果他们就趁着柯南用新一的声音报警的时候，溜进了犯人的老巢。如果不是柯南救援及时，侦探团就真的要在这里打出GG了。
结果，尽管柯南正因没找到组织的下落沮丧不已，却还是不得不护送因目暮警官的一声怒火而哭哭啼啼的新同学回家。
看着已经来到了2丁目，柯南摆了摆手：“再见了，接下来你自己会走了吧？”
“APTX-4869……”声音透着一丝寒意，柯南疑惑地转过头，看向灰原。
“你知道这是什么吗？就是你被灌下之药物的名称。”
柯南勉强笑道：“你在说什么？我不知道什么药呀。”
灰原背对柯南，头微转，表情有些阴森：“药名应该没错，因为那药是组织命令我做的。”
“组……组织？你做的？”柯南感觉浑身发冷，瞳孔微缩，冰冷的汗水顺着脸颊缓缓流下，“哈哈，你一个孩子，怎么……”
“跟你一样……我也喝了那药。因为细胞自我破坏程序的突发性作用，除了神经组织以外，骨骼、肌肉、内脏、体毛等所有的细胞都退化到儿童时期。它是一种神秘的毒药。”
“灰原……难道你……”
“我不叫灰原。”灰原将头发撩到耳边，冰冷的声音毫不留情地打破了柯南最后的一丝期望，“雪莉，这就是我的代号。如何？吃惊吗？工藤新一？”
“你是黑衣男子的同伙？”
灰原没有回答，继续说道：“你没时间惊讶了，迟钝的侦探。”
“什么？”
“我告诉过你，我住在米花町2丁目22番地，就在你家附近。你应该知道在哪吧？”
“难道会是……阿笠博士他家？”柯南拿出阿笠博士给他发明的耳环型手机，紧张地呼叫着，却一直占线。
灰原冷笑着看着徒劳的柯南：“没用的，听筒已经被拿了起来，所以打再多次电话也是通话中，而且他再也无法接电话了……因为他已经……不在这个世间了，和你那个小助手一起。”
“小助手？”柯南愣了下，瞬间想起一个名字，“越水七月？！”
“没错。真没想到他竟然察觉到了异常，还想通知你。没办法，我们只好让他提前在阴间等你了，连同他的那个小姐妹和监护人一起。”
“可恶……七月，有子，还有……诶？”柯南突然想起，好像他们的监护人叫……
“哼，明白了吧？这就是和组织对抗的下场。”阴森森的话语打断了柯南的思考，柯南狠狠地瞪了一眼灰原，扭头向阿笠家跑去。
“打扰了！”七月敲了敲阿笠博士家的大门示意自己的到来，然后掏出钥匙打开了门，就看到柯南对着灰原大吼：“开什么玩笑！我怎么可能了解一个制作毒药来杀害人类的人！”
“没办法……我本来……也不是想打算……做什么毒药呀。”
七月皱皱眉，总感觉这一点都不像柯南能说出的话，忍不住开口道：“失眠患者离不开安眠药，但许多案件都有安眠药的参与；对核裂变的研究极大缓解了日本资源缺乏的情况，但原子弹却给日本带来极大的伤痛。任何事物都有两面性，它的利弊取决于使用者而不是发明者不是吗？正如砒霜虽是毒药，但在医生手里就成了诸如肿瘤、急性脊髓白血病等疑难杂症的良药。我们总不能因为有人被电死就去责怪法拉第和特斯拉等科学家吧？”
“切。”柯南还是有些耿耿于怀的样子。
“柯南，你还是有着变回高中生的想法吧？博士擅长的可不是生物化学和细胞领域，与其让博士研究这些，还不如去拜托发明者呢！”
会心一击。
柯南一脸不情愿地说：“七月都这么为你说话了，而且如果你的事被揭穿，我迟早也会被他们发现。虽然对博士不太好意思，不过你还是继续呆在这当小学生吧。随便乱跑被发现反而麻烦。”
说罢，柯南扭头看向七月：“之前我就想问了，你今天去哪里了？而且看样子，这家伙把事情都告诉你了？”言语中还有一丝对七月的担忧和对灰原的责备。
七月心中暖暖的，回答道：“柯南，我知道你是担心我，不想让我接触这些。不过，其实从我有记忆开始，我就不可能脱身了。”七月将孤儿院的事情娓娓道来，“抱歉，一直都没有告诉你。”
“冰酒……有代号的都是高层吧？灰原她是药物的主要研发人员，那你又做过什么？”
七月镇定自若的回答道：“帮组织偷过一些企业的情报，指挥追捕过‘银色子弹’，就这些了。得到称号的原因是后者吧？虽然失败了，不过毕竟是组织里公认可以威胁到组织生存的人物啊。”
柯南还想说些什么，却被徽章里传来的声音打断了。七月拿出徽章，爱丽丝的声音急切中透着自责：“小七，你交给我的那个软盘打开后突然爆发出了病毒，现在里面的内容全部被销毁了。”
“诶？”七月一呆，赶忙安慰爱丽丝。
挂掉后，柯南有些疑惑：“软盘？你今天请假就是为了这个吗？”
“目的之一吧。”七月点点头，“昨天小姐姐说，她有可能将APTX-4869的资料无意中寄到了广田教授家，所以我就去了一趟。可惜，没想到软盘上竟然还带着病毒。”