洛克菲勒于1882年建立托拉斯之后，事业一直处于上升状态。因托拉斯为他带来大量的财富，其他各行各业的业主亦纷纷效法，使得各行各业均被少数人垄断，为害民间经济。于是在政府默许下而成立的纽约州参议员调查小组，正式干涉托拉斯问题。
1888年2月，洛克菲勒在纽约州最高法院出庭为他组成的托拉斯辩护。当他由“标准石油公司”的席位上缓缓起身答辩时，旁听席上的群众霎时肃然，大家都想一睹这位托拉斯之父，商场之王，油业之沙皇的真面目。在答辩时，洛克菲勒只是重复了一些调查小组早已清楚的内情。他仅说出托拉斯是由“标准石油公司”股东的受托人所组成，由八人担任（因为已有一人退休）此职。他接着宣布托拉斯已有七百个股东，他承认这些受托人每三个月开会一次，并且每次都有报账的习惯，而这些账是没有利息的。洛克菲勒也交出1882年托拉斯成立时内部所写的条约书。最后，他提出为了美国在海外的市场与俄国竞争的情形，并说明在国内尚有111家独立油厂存在，所以否认他个人垄断市场。亚格博也随后出庭作证，说明托拉斯中执行委员会的工作情况。他们两人前后都没有透露太多内情，但交出了托拉斯所属的41家公司名单。
这次的调查很散漫，开了几次庭就不了了之了。到5月才硬发表一篇没有结论的报告，认为暂时无须成立法规来约束托拉斯。于是一场雷声大雨点小的调查就这样草草结束，使得关心此事的民众大失所望。
在纽约州立的调查报告还未公布之前，美国中央政府参议院的数个调查委员会也派人员来调查托拉斯的内幕。开庭时，传来许多洛克菲勒在商场上的对手，请他们一一作证，指出托拉斯有垄断市场之嫌。除此之外，费尔杰公布托拉斯的财政问题：他估计在1888年3月，托拉斯的市场价格已达一亿五千四百万美元，他于是算出自从托拉斯成立以来每年净赚百分之十三，百分之七以现款方式分给股东，百分之三变成股息，另外百分之三存于国库。
洛克菲勒再度出庭辩论，这次除了重复人们已知的内情外，便不肯多讲。他从头到尾都在装糊涂。当调查小组询问他国内外售油的情况时，他均推说记不清楚了。这使得调查人员大为光火，洛克菲勒却很怜悯地看着此人说：“我的企业太大、太复杂，无法对小节一一弄清。”他甚至推说当俄亥俄州的“标准石油公司”并入托拉斯时，股票对换的情形也弄不清了。
调查小组在无可奈何之下，只好把注意力集中在独立公司、产油业主及小销售商的控诉上，对此一一加以细读和整理，发现也不过说明了“标准公司”拿回扣、控制市场，与铁路公司勾结抵制他人公司运货等众人皆知的旧事。唯一不同的是调查小组这次搜集了充足的资料，并有充分的人证与物证来指责“标准公司”的说法。虽然到了8月，调查小组呈与国会之后，国会并没有下令更改法律以约束托拉斯，但调查过程曾一度公布于众人之前，早已使托拉斯受到各方面的攻击。
在此调查结束之后，各从政人士均认为此风不可长，在竞选时均纷纷提出要结束托拉斯的建议。俄亥俄州的舒曼首先提议，他主张法律应制止托拉斯或任何破坏商业及垄断市场团结的行为。在经过多人商讨和研究的结果，议员们终于拟好了一个条例并命名为“舒曼法案”——禁止托拉斯的成立。此一法案在国会提出时，似乎全数通过，获得当时总统哈里森的同意，并于1890年夏天签署。此一法案的简要内容为：一、任何破坏州际或国际贸易市场的商业集团，合约或阴谋都是非法的。
二、任何造反者，均需罚钱五千美金、判刑一年或二者兼具。
因此法律一旦实行，标准石油公司自然成为罪魁祸首。
其实在国会尚未通过“舒曼法案”之际，俄亥俄州的检察官在忍无可忍之下，向俄亥俄州的最高法院告了“标准公司”一状。他指出，俄亥俄州“标准公司”的股票曾转到托拉斯的委托人名下，然后这些委托人间接选择公司的行政人员并且控制业务。他还慎重地指出这些人都早已不是俄亥俄州的居民，却仍协助该州的洛克菲勒组织公司、垄断市场，破坏商业行为。“标准公司”只好强词夺理，硬说“标准公司”本身与托拉斯扯不上关系，股票委托完全是私人行为，与公司无关。还强调托拉斯并不干涉公司内部的行政或业务问题。
虽然“标准公司”表面上理直气壮，但私下心中有数，知道这样是站不住脚的。终于在1892年3月2日败诉，控诉中指责托拉斯间接控制公司、实行垄断市场及控制价格等罪行，并命托拉斯解散，停止持换股票（即由公司转至托拉斯），并指出托拉斯永远不可干涉“标准公司”的作业。除此之外，“标准公司”还要负责这次官司的所有费用。这次惩罚虽然不重，但也使愤愤不平的一般人民大感快慰。
宣判结束两日之后（1892年3月4日）“标准石油公司”的托拉斯组织虽告瓦解，然而“标准公司”的各大分公司仍为此采取行动，增资增产。最先行动的是新泽西的“标准石油公司”，由三百万美元的资金增到一千万，增添了七万份一百美元的股份。大股东计有洛克菲勒兄弟、费尔杰、布希奈尔、亚历山大、希贝克，他们拥有三分之二的股份。他们在开股东大会时决定增产，计划不但生产石油及其副产品，还要制造一切生产石油所需用的机器及装载石油所需的运输工具等。总之，凡是与石油有关的东西，他们都要制造出售。
他们并不就此满足，更提出要继续扩充的计划，买下大小共五个公司。随即又向托拉斯置办大量的股票，再度召开股东大会，增设六万股，共计六百万元，以支付新增加的工厂及股票的黄金。一切安排就绪之后，费尔杰被选为总经理，波克二世为副总经理。至此，纽西的“标准石油公司”本身就已是一个惊人的大企业了。
纽约的“标准石油公司”也同时增资增产，他们前后合并了十个新的大小公司，把五百万美元的资金增至七百五十万美元。
纽约公司的董事会中的董事与新泽西的董事大致相仿，由威廉·洛克菲勒任总经理。此后，各州的“标准公司”均由托拉斯中解散出来而各自为政，分布于纽约州、新泽西州、宾夕法尼亚州、俄亥俄州及印第安纳州等。表面上虽然各公司均独立作业，事实上他们是团结一致，采取一贯作业。
那么被瓦解的托拉斯的股票又如何处置呢？董事会强调各股东仍持有相同的利益，各公司仍将照常营业，分股息、红利的制度仍将延续不变。拥有大批托拉斯证券的人（即受托人）都将托拉斯时代的证券交出来，按比例换回相等的各分公司发行的股票。大股东都按此方法兑换。但有一千六百名小股东，坚持不肯将托拉斯所发行的证券换成刚成立的各分公司的股票。这些人顽固地坚持了三四年，一直不肯妥协。他们非常反对托拉斯瓦解，因为托拉斯所发行的证券是有市场的，可以随时兑现，然而刚成立的各分公司的股票却仍未有直接的市场。
托拉斯表面上虽已被解散，但其精神仍在。各个“标准石油公司”仍然步调一致，与昔日一样地有规律，各公司的高级职员仍如期地在纽约百老汇办公室相聚开会。如今各公司的收入，仍由以前的几位受托人管理，只是因为托拉斯的解散，他们不再用受托人的名义而是用清算财务的名义来管理。总而言之，托拉斯这个名词只是在法律上消失了，实际上它还是存在的。
洛克菲勒对分公司各自为政的制度不是很满意，因为它们在精神上虽是统一的，但在法律上是个别的。尤其当时已有三十个分公司，要同心协力，最好仍有法律上的牵制。当时，其他的大企业在托拉斯瓦解之后，都将公司改组成立所谓的“股权公司”，即由一总公司来控制附属公司的股份。不幸的是，在19世纪末，只有新泽西州的法律允许一个公司控制其他公司的股份，所以大企业纷纷在新泽西州改组，由托拉斯发展到“股权公司”。
洛克菲勒对此一理想也很赞同，只是他仍保持小心谨慎的一贯作风，先观察研究他人的成败，再自己实行。商讨结果发现组成股权公司是一切办法中的最优方案，它最能扩展营业，增大资产。于是，“标准石油公司”也于1899年6月改组，将新泽西州的“标准石油公司”重新登记，令其有权交换属下二十个公司的股份，资金由一千万美元增至一亿一千万，发行一千万股的普通股票和十万份的优先股。6月19日，董事会宣布，所有下属的二十家公司与托拉斯已废除的股票都应该换成新泽西公司的股票。于是，分散独立的公司又再度组合为一了，股票集中之后，“标准石油公司”变成世界上最大最富裕的公司。在1906年，公司总资金是三亿六千万，而每年的净收入是八千三百一十二万。这种庞大的企业是当初谁也无法想象的，也许只有洛克菲勒曾梦想过，而今却是千真万确的就在眼前。
当所有的“标准石油公司”的财产集中到新泽西的公司，国家的经济也渐渐步入正轨之时，洛克菲勒已萌退意。三十年的商场竞争，损耗了他的健康，1890年他开始抱怨消化系统方面的毛病及神经紧张，所以，他准备逐渐退出商场，不再着手管理业务诸事了。1893年，他得了一个神经性的疾病，须髭脱落，身体紧张，同时身体开始发胖。他慢慢一步一步地退出他的企业王国，至1896年就很少去上班了，但偶尔还替手下管管账。到1897年就完全不管事了，算是正式退休。这六七年来，他老了许多，从1890年的相片上来看，他仍是个精神奕奕的中年绅士，而到了1896年，半年当中他就变成一个肥胖又秃顶的老人了。
新的发明和新的市场，已非年届六十的洛克菲勒所能对付的了，所以他的退休可谓明智之举。当时，石油的市场已发展到密西西比河以西的广大地区，再加上汽车的发明，一夜之间把石油工业带到最高峰的地位。
1895年，汽车只是一个令人感到好奇的新发明；但到1900年，汽车渐渐成为有钱人的宠物；到1915年，它已变成美国大众的交通工具。石油工业也随着身价的提高，各公司更进一步地少产煤油而开始提炼汽油。“标准石油公司”自然是汽油界的首领，不断地增产。从前洛克菲勒垄断市场的理由是要使市场规律化，因为当时炼油厂的资本小，任何有点资金的人士都可以竞争一番，所以往往自相残杀，导致市场一片混乱，而使得洛克菲勒有借口出来统一局面，垄断市场。但随着石油工业的发展，汽车的兴起，汽油逐渐成为主要的燃料。而提炼汽油和各种润滑油却不是一件简单的工作，需要高级的技术，昂贵的机器。而在这方面，一般小资本的商家是根本不可能打进市场与有势力的“标准石油公司”一争长短的，所以“标准石油公司”十足地称霸于业内，真正地垄断了市场。
洛克菲勒自己创建托拉斯，把小型分散的工业带入统一的、垄断的工业，姑且不论道德上的价值，但只就工业上来说，他自创了一个新纪元。随着汽车工业的蓬勃发展和接着而来的飞机工业的兴起，洛克菲勒创建的时代已完全改变，所以在此关键时刻需要一个接棒人。在洛克菲勒离开之后，亚格博接棒。亚格博用尽一切办法来迎接新时代，满足市场，为洛克菲勒集团带来更多的财富。当时虽然洛克菲勒已将实权交出，但亚格博和老同仁仍希望他担任董事长，作为他们精神上的支持。这也是洛克菲勒一直没有正式宣布辞职的原因，以致日后亚格博行事的方针或作业的计划有错误或得罪他人的地方，舆论界也一一怪罪于洛克菲勒。洛克菲勒一生事业虽然庞大，但很少得到旁人的称赞，总是招人非议、批评，甚至对簿公堂，这也是最使他及他的家族感到遗憾的地方。