1781年，富兰克林回到了他念念不忘的故乡--费城。
10月31日，宾州人第三次把富兰克林选举为宾州州长，但10月刚过，富兰克林就病倒了。在第二年1月3日到3月12日，他一次都没能到州政厅、参事会视事办公。
在他任期内的最后几个月里，宾州的行政参事会一直在富兰克林家中举行。连1788年9月16日传来的十一州批准宪法的消息都是在富兰克林家中得知的。
1788年10月，托马斯·密弗林当选州长，继任了富兰克林连任了3年的职位。富兰克林最终离开了他服务于其中60余年的政治生活。
多年来竭心尽力的工作，耗损了他健壮结实的身体，乐天、开朗的富兰克林终于被年老、疾病击倒了，他用立遗嘱的举动承认了这一点。
现在，富兰克林彻底闲下来了，他开始续写自传。他在1786年11月26日开始动笔，以后几次中断；1788年10月22日起又写到12月9日结石病重为止。至此，富兰克林不能再执笔写作了。那以后，他只能口述，由外孙笔录。
富兰克林的最后一个冬天是在亲人环护中度过的。他的孙女黛博罗每天喝过茶就来陪他。
杰斐逊在赴联邦政府国务卿之任的途中，到费城探望富兰克林，那是这位老人去世前9天。杰斐逊目睹他清晰地一气写完了他此生的最后一封信，暗自为这个久病垂危者惊人的脑力而惊叹。
1790年4月17日，富兰克林好像知道自己就要离世，忽然起了床，请人们帮他整理一下床铺，以便让他死得像样些。女儿莎拉·富兰克林听了悲从心来，对他说，她要他好起来，再活许多年。富兰克林平静地说：“我不希望这样。”他已经看到了最后时刻的来临。
就在那天夜里11点，这位伟人溘然逝去，走完了他八十四年的春秋。
4月21日，费城人民为他举行了葬礼，两万人参加了出殡队伍。码头上船下半旗，教堂钟楼里哀钟长鸣。
4月22日，詹姆斯·麦迪逊在参议院动议为富兰克林的逝世服丧一个月以示哀悼，被不经讨论地通过；6月11日，在巴黎的国民议会中，米拉波动议各国应为富兰克林先生之逝世哀悼3天，拉法耶特、拉·罗其福考尔德附议，议员鼓掌通过；第二年3月1日，富兰克林原来的敌人威廉·史密斯在美洲哲学学会向路德派教堂发去一篇赞美词，赞美逝去的富兰克林。
本杰明·富兰克林这位伟人静静地躺在教堂院子里的墓穴中，他的第一块墓碑上只刻着：印刷工富兰克林。第二块墓碑是群众为他后立的，碑文是：从苍天处取得闪电；从暴君处取得民权。两句碑文概括了他一生中的两件辉煌的事业。