家康虽然鼓励对外贸易，但对于偷渡入境的传教士，家康和秀吉的态度是一样的。家康曾下令禁教，严惩不答应改教的。肥前的有马晴信被迫自杀；大阪高槻城主高山右近及丹后城主内藤如安带着百余信徒被放逐到吕宋，结果死于马尼拉。现在这些侥幸逃脱的基督徒们都对家康心存怨恨。
大阪的实力在逐渐增强，长曾我部盛亲也带来了1000余人，此外还有一些在关原之战中失败的诸侯之子及家臣们，如仙石宗也、毛利胜永、大谷刑部之子大学、增田盛次、明石守重、浅井长房等都支持大阪，总人数超过9万，摇旗呐喊，一心要打倒家康。
战争的筹备工作如火如荼地展开，铁铺开始铸造兵器，估衣店摆出了战袍，出售武器的店家纷纷把头盔护具等战具陈列出来。很多百姓开始为了躲避战乱举家迁移，浪人也纷纷向大阪集中。如此一来，要想保密是不可能的了。骏府的家康很快就得到了消息，而且片桐且元被逐出大阪的事他也知道了，因此他立刻召集家臣来会商。
家康手下的大臣悉数到齐，气氛显得很凝重。当时本多正信恰好也在骏府，其他还有正纯、天海、崇传、林罗山等也都在场，家康首先打破沉默说：“听说且元被赶走了，我和丰臣家和睦相处的心意显然是白费了，他们并不领情啊。”
正信愤愤不平地说：“大阪方面本来就跟主公不和，这次把且元赶走，更是蔑视主公的苦心，他们现在召集许多浪人，一定是在备战了。”
家康还很冷静，说道：“可能不是的，也许是秀赖母子受到浪人的蛊惑。我不恨他们母子，可恨的是那些浪人。”
正纯建议马上进攻大阪，天海僧正也表示赞同，而且他还谨慎地提醒到，家康今年已经73岁了，大阪的问题应该早作了断。家康表面上不服老，但是却不得不正视这个问题。如果不在自己有生之年平定天下，那么就很难安心地离开人世，因为他很难预料自己的子孙后代会有什么样的命运。
在过去的几十年里，那些曾经叱咤风云的枭雄们一旦死去，后人的下场通常都很悲惨。如今川、武田、北条、织田等各家，到如今连个影儿都没留下。成为比义元、信玄、信长更伟大的武将，是家康从少年时代起最大的愿望，为了达成目的，大权在握，家康多年来忍受了各种艰辛困苦。如今既然有人横加阻挠，这一仗是不可避免的了。更何况，家康也想结束这种无休止的动乱，想要天下彻底太平起来。想到这里，家康就说：“好吧！事情既然到了这个地步，你们就去部署一下，准备战斗吧。”
家康终于下了决断，大家都喜形于色，只有家康突然陷入惆怅，关原战役结束至今已经14年了，想起当年，他愈加怀念本多忠胜了。忠胜于4年前去世，是“四大天王”中最后走的一位。
看到家康追忆过去，正纯挺起胸膛来说：“可是，忠胜公之后有平八郎，井伊直政公之后也有直孝。”
家康笑着说道“嗯，父子两代都尽忠于我，说起来你也一样，有大家的追随，我真是感激不尽！”
家康一面下令各诸侯备战，一面派了快使到江户去向秀忠通报。唯一令家康担心的，就是福岛正则、加藤嘉明、黑田长政、蜂须贺家政等人，虽然他们都写下了绝不背叛德川的誓词，但毕竟也都受过丰臣家的恩惠，家康不确定他们究竟会采取什么态度。一向谨慎的家康，干脆命这些诸侯专门保护江户城。
庆长十九年（1614年）十月一日，寒风瑟瑟，大阪冬季之战正式揭开了序幕。
激战连连
庆长十九年十月十一日，家康率军由骏府出发。而在江户的秀忠则等待东国军队到齐之后，于23日出发向西行进。家康的大军号称20万人，德川一族自然全部参加，井伊直政之子直孝，和本多忠胜之子平八郎一心想要在战场上建功立业，也跟随家康一同出征。另外，九州岛除一小部分诸侯外几乎全部到齐了，随家康前去的有上杉景胜、伊达政宗、佐竹义宣、前田利常、藤堂高虎、浅野长晟和毛利秀就等。
11月15日清晨，大军把大阪城团团围往。在真田幸村的指挥下，大阪城在全力猛攻下竟防守得固若金汤，家康这边反而伤亡惨重。家康着急了，他把大本营推进到大阪城西方的茶臼山（位于今大阪市）上，亲自上马指挥进攻，但是大阪城依然屹立不摇。家康17岁就开始驰骋沙场，身经百战，而且工程经验也相当丰富，此时却不得不发出赞叹：“真不愧是秀吉公建立的城堡！”
大阪城的坚固和兵马的伤亡让家康有些动摇了，他知道如果要打败敌人，也许只能等城内的兵粮断绝，但是那也许会耗上三五年的时间，家康实在不忍心再看到自己的兵马有什么损伤了，他把秀忠等人召集起来商量，说：“付出这样大的代价，未免太愚蠢了！”并表示自己有言和的想法。
和解的提议遭到了大家的一致反对，包括秀忠在内的所有人都主张进攻到底，然而家康说一不二，就在大伙的反对声中，派本多正纯到大阪城中进行交涉，但是对方并没有接受。正纯向织田有乐斋及大野治长等人劝说：“你们已经被重重包围，虽然尚未失利，但总有一天会兵粮耗尽，与其活活饿死，不如趁早接受和议吧！”
淀君和秀赖坚决不答应，城中诸将也斗志昂扬，纷纷骂道：“胡扯！我们绝不和谈，太合殿下建的城不会战败的。”被拒绝的家康并没有气馁，三番两次遣使去要求和谈。除了正纯之外，还派了当时住在京都的侍女阿茶局同去游说，终于让织田有乐斋和大野治长有所动摇，他们对淀君说：“家康已经73岁，命不久矣，只要他一死，天下不就还是丰臣家的吗？”“目前丰臣家已经到了生死存亡的时刻，但诸侯们都对家康有所顾忌。我们暂且忍一忍，等候时机成熟再采取行动吧。”
但秀赖极力反对，他不想再等下去，坚持要作战到底。淀君如今也是一身戎装，附和着说：“秀赖说得对，有乐斋，治长，你们都不敢作战了吗？”正在秀赖和淀君的态度强硬，一意孤行的时候，突然一颗炮弹落在房门口，轰的一声爆炸开来，所幸没有太大伤亡，但是炮弹的威力和侍女们的哭喊声让淀君的态度软了下来。她不知道，这炮弹正是悲愤离去的且元发射的。他熟知城内情形，投奔了家康，特意瞄准淀君的房子发了一炮。淀君终于改口了，要家康提出条件考虑一下。家康开出的条件很宽厚，只有三条：
一、可以保留秀赖的居城和领地。
二、大阪城的本城留下，但是要填埋掉外城的第二、第三围城河。
三、不追究参战的浪人。
这些条件大家都欣然接受，只有真田幸村和后藤基次、塙直之等勇士激烈反对，但是已经影响不了全局，和谈已成定局。秀赖派木村重成做代表，到茶臼山上家康的大本营递上誓词，这场激战就在12月20日宣告结束了，为时两个多月。和谈后的大阪城又恢复了往日的活力，出逃的市民们纷纷返回家园。
本多正纯于第二天就率领数千工人开始填埋大阪城外壕。城墙很快就被掘开，壕沟渐渐被填平，先是第三道，紧接着第二道，最后填到了中央。大阪城所有壕沟都被填成了平地。原本坚强的城堡已经变得毫无防守作用了。大阪城的人见事态不对，急忙找总奉行本多正纯谈判：“说好了只有外壕要填埋的，怎么跑到了中间来，这样违反了约定。”
正纯敷衍地说道：“那一定是我弄错了，我回去向家康公请示吧。”说着立刻动身回伏见城。大阪方面也立刻派人到伏见城，向家康指责正纯的过错。
家康非常为难地说：“我明白你们的来意，真是很抱歉，我马上处置正纯。不过，在两家刚刚谈和的大好时候，要人自杀也未免太伤和气了，请看在我的面子饶他一命吧！”家康停了一下又说，“不过两家既然已经言和，大阪城也就不需要什么外壕了吧！”
秀赖和淀君听到使者带回来的话，觉得上了家康的当，气得咬牙切齿，后悔和家康进行了和谈，气氛顿时紧张起来。就这样又过了一年，年号由庆长改为元和。到了春初，大阪开始筑新墙、挖壕沟、召集浪人……家康接到消息，心想：“既已和谈，为何又有这些举动？”家康认定是那些浪人在作祟，只有让秀赖和他们分开才是解决之道。家康遣使到大阪商量：“请秀赖公搬到伊势（位于今三重县）或大和（位于今奈良县）可能比较好。如果不答应，就请驱逐所召的浪人，只留下以前的家臣，这样大阪才能稳定下来。”
家康派出了使者，但是大阪方面不仅没有回音，反而更加积极地备战，家康一怒之下，再次发兵攻打大阪。这一次家康带了15万人左右，除了家康的家臣，还有伊达政宗和藤堂高虎跟随。4月4日，一行人士气高昂地出发，6日开始攻城，秀忠紧随其后，大阪城夏季之战就此拉开序幕。
这一次，大阪城的壕沟已经被填平，大阪已经不是从前那个固若金汤的城堡了，双方陷入苦战当中。5月5日那天，双方展开激战，每个人都以死相拼，双方死伤都相当惨重。面对德川军的猛攻，大阪方面的名将先后阵亡，先是后藤基次，接着是薄田兼相、木村重成、增田盛次，最后是担任指挥的真田幸村，大阪方面已经快要抵挡不住了。
没过多久，整个大阪城都陷入了一片熊熊火海里。家康开始还坐在茶臼山大本营中观看，后来突然想起孙女千姬还在城里，连忙叫人去搭救千姬。津和野城主坂崎出羽守领命前去。