但谈到从广东到甘肃的迁移，《金城孔氏族谱》所叙历史则出现一段明显的断裂。例如，永靖孔氏公认的来甘世祖孔嘉兴从广东惠州来到甘肃的时间是“宋朝末年”。1991年由庙管们编成的仪式书中进一步讲明说孔嘉兴到兰州的时间是“宋末明初”。大川人近编《祭圣祖仪式》继而又说孔嘉兴是一位无所畏惧的将才，因“圣旨诏书下降，上甘安靖黎民，扫荡妖氛，旗帜鲜明”。孔祥国，1991年，第45页。但宋末明初之提法相当含糊，因为其间有一百多年为蒙古人统治，而永靖孔氏族谱或仪式文本并没有提到蒙元政权。
显然，所谓来甘世祖属于一位民族英雄的说法与历史情况相矛盾。1131年，源出东北的女真人攻占兰州，取代汉族统治。女真人占领兰州后，又必须为保卫兰州数次与附近的吐蕃军和西夏国军队作战。女真人虽然没有败在吐蕃或西夏手里，却敌不住蒙古人的铁骑，1226年，蒙古军占领兰州，经过一系列惨烈的战役，长驱南下最终在1278年打下惠州。就是在南宋这个最后的堡垒附近，著名的丞相文天祥被元军所擒。文丞相的被擒和第二年元军对赵宋皇室的斩尽杀绝当然可以让我们把1278—79当成“宋朝末年”，但这也是蒙古人建立绝对统治的开始。直到1369年，兰州才回到汉军手中。换句话说，兰州被异族统治的时间长达238年，然后才在明朝回到汉人手中。在明军攻陷兰州的时候，孔家已经在此繁衍了七代。兰州的明朝机构建立之后第二年，孔嘉兴的一个后人才谋得了一个较低的官职。
上述考证说明，孔嘉兴在蒙古人统治时期到兰州。而这也许是孔家人不愿意说明的历史，生怕影响到孔嘉兴作为爱国者的形象。毕竟，在永靖孔氏的族谱和仪式文本中，孔嘉兴奉朝廷之命来边疆抵御外侮，所以需要将他的到来与蒙古人的统治分割开来。因而这也就导致措辞困难的“宋末明初”之说。但无论是本世纪初族谱的编写人还是近年孔家人祭祖仪式手册的编写人，重构历史的重要性并不在于确凿的事实，而在于维护有关祖先的神话。如果来甘祖先可以被描绘为一位捍卫国家尊严的民族英雄，那么模糊的历史就会比清晰的事实更为重要。彰显过去与掩饰过去的逻辑有时会变得相当的雷同。