鱼鳍
鱼类在水中主要依靠鳍来自由游动。鱼的鳍分为背鳍、胸鳍、腹鳍、臀鳍、尾鳍。胸鳍2片，生在头的后方、鱼体前部的两侧，每侧1片，两侧对称，其主要作用是改变鱼的游动方向，如向上、向下、左右转弯等，同时还用于保持鱼体的平衡。背鳍生在鱼的背部，有的种类为1片，有的种类为一前一后2片。腹鳍生在鱼的腹侧前部，有的种类左右各1片，有的则合二为一。臀鳍生在鱼的腹部后方、****附近，一共2片。背鳍、腹鳍、臀鳍的主要作用是保持鱼在水中身体状态稳定，防止侧翻。尾鳍生在鱼的尾部，只有1片，有的呈桨状，有的为开叉状，尾鳍的功能最多，对鱼的运动也最重要，其左右摆动是鱼向前游动的主要动力，此外还有控制鱼的前进方向、保持鱼体稳定等作用。
鱼鳔
鱼类的身体比重一般都略大于水，之所以能在水中自由地沉浮，主要是通过体腔内一个叫做“鳔”的囊状器官来进行调节。大多数鱼的腹腔内都生有鳔，鱼鳔为长椭圆形囊状器官，分为前后两个室。鱼类可以通过部分腺体从血液中分离出气体填充至鳔内，以调节鱼体的比重。鱼需要上浮时，向鳔内充气，使鱼体的比重小于水；鱼类需要下沉时，则排出鳔内一部分气体，使鱼体的比重大于水。同时鱼还可以通过调节鳔前后两个室的充气量大小，使鱼体的前后侧浮力不等，从而使鱼在水中能呈现头部上仰或者尾部上翘等不平衡状态，以协助其能向上或向下快速游动。
有些深水鱼（如金枪鱼类）体腔内没有鳔，平时只能依靠在水中不停地游动才能保持漂浮状态，一旦停止游动很快就会下沉。鲨鱼虽然也没有鳔，但其肝脏很大，可通过调节肝脏的比重来调节其沉浮。
陆地生物的呼吸器官主要是肺，肺组织直接与空气进行气体交换，有些陆地生物种类的皮肤也能参与呼吸功能。而鱼类的主要呼吸器官是鳃，通过鳃与水进行气体交换，吸收溶于水中的氧，排出体内的二氧化碳。海水通过鱼的口进入口腔，再通过两侧的鳃流出体外。海水在经过鳃时，与鳃组织进行气体交换，溶于水中的氧透过鳃组织薄膜进入血液，鱼体内由代谢产生的二氧化碳等废物则透过鳃组织薄膜排入水中。鱼类呼吸系统的气体交换效率要比陆上生物高得多，陆上生物进行呼吸时一般仅能吸收空气中所含氧的20％左右，而鱼类则可吸收水中溶解氧的80％。这是由于水中溶解的氧比空气中氧的含量要低很多，空气中含氧量约21％，而水中的溶解氧的含量仅有5～7毫克/升，水中的含氧量仅为空气含氧量的几万分之一。