强巴林寺位于昌都镇的第四级台地上，为昌都镇地势最高之处。站在大门口就能看到昌都镇的全貌，看到昂曲和扎曲在寺庙下面的山脚处交汇，合并成澜沧江向南奔腾而去。据说在这里建寺还是格鲁派创始人宗喀巴最早的意图，不由得人不感叹高僧大德们对于寺庙选址的精妙和独到眼光。
强巴林寺是康区最大的寺庙。寺内主供强巴大佛，所以寺名为昌都强巴林寺，也简称昌都寺。该寺始建于1444年，由宗喀巴的晚年弟子西饶桑布主持，用了8年时间方建成。这里曾由包括三世达赖等著名的高僧主持过，后由帕巴拉三世主持，从此帕巴拉体系传下来，现已转世至十一世。帕巴拉活佛体系在康区影响最大，它分支的丹吉林第穆呼图克图、功德林济咙呼图克图，都属于西藏四大呼图克图之列，都曾任噶厦政府摄政。全国人大副委员长帕巴拉·格列朗杰为十一世帕巴拉活佛，是该寺第一大活佛。
强巴林寺历史上与内地王朝联系很紧密。清康熙年间在西藏发生过几次战争，1718年康熙平定准噶尔进犯西藏，1792年康熙驱逐廓尔噶（今尼泊尔）入侵西藏，强巴林寺都极为出力，积极为清军组织粮草、支应乌拉等，受到清政府表彰。六世帕巴拉被敕封为“诺门汗”并正式颁发呼图克图铜印，这是清康熙年间敕封班禅额尔德尼之后，最早敕封的呼图克图之一。康熙还御笔亲题“甘丹强巴林寺”的匾名，钦赐给该寺。强巴林寺的势力也达到鼎盛时期，共有僧人3500多人，下属寺庙135座，遍布昌都、林芝、那曲等地区，成为藏东格鲁派的大寺院。
强巴林寺在建筑、绘画、雕刻及收藏等方面都很有特色。它主要由强巴大佛殿、佛祖殿、宗喀巴殿和护法神殿等组成，占地300余亩。强巴大佛殿中泥塑镀金的强巴佛是寺庙的主供佛，每年藏历二月十五日，寺里都要举行迎请强巴佛的仪式。这天是释迦牟尼圆寂日，为迎接强巴佛化度众生的时代早日到来，特举行这一盛大活动。届时将该寺的强巴佛抬出，众僧口念超度经，绕强巴林寺转一圈。各地百姓集中在沿途围观，人山人海，场面非常壮观。
强巴林寺经堂内塑有数以百计的各类佛像和高僧塑像，还有上千平方米的壁画以及众多的唐卡画，五彩缤纷，气象万千。画作多为本地噶玛一带擅长工笔的民间艺人们绘制。噶玛的艺人世代相传着彩绘等工艺，他们大多以此为生。强巴林寺可以说是昌都能工巧匠的聪明才智结晶，代表了昌都一带的最高水平，堪称康区文化艺术宝库。
强巴林寺门外，有几堆长数十米、高一两米的玛尼堆。玛尼堆上是大大小小刻着佛像、六字真言的石片，还有大量由江河中拾来的彩色鹅卵石。玛尼堆上面经幡招展，蔚为壮观。
现在，该寺已恢复了传统的宗教活动。藏历二月二十七日至二十九日，强巴林寺举行“古庆”跳神，以示消灾驱鬼，祈求来年五谷丰登，牲畜平安。表演者戴着狰狞逼真的面具，以整齐典雅的动作造型、宏大的场面而征服了观众。该寺跳的钺斧舞，服饰华丽，舞姿古朴典雅，配器简约清越。以该寺独有的宗教舞蹈为形式的昌都藏戏，在整个西藏自成一派。
强巴林寺还曾经是一段历史的见证。西藏和平解放应该说便是在这里拉开帷幕的。1950年，藏军主力几乎全部布防于昌都、江达一线，想拒解放军于金沙江东岸。交战失败后，一部分藏军欲以强巴林寺所在的山地为据点负隅顽抗，但在力主国家和平统一的强巴林寺主持活佛帕巴拉·格列朗杰和昌都行政长官阿沛·阿旺晋美的积极斡旋下，藏军最终放下武器，接受了和平条件。昌都的和平解放为全西藏的和平解放铺平了道路。