开场白:黑暗组织最后大对决，揭穿boss的大阴谋，这场红和黑的碰撞FBI是否能全身而退？
趁搭着升降机boss来到地下实验室，身后还跟着表情木纳的水灵。
这个地下实验室规模非常大，不管是机器还是人力都是一流，实验室里一群穿白大褂的人不停的忙碌着。
boss走到一位三十岁的男子身边，男子戴着眼镜看上去很有学文，而且他操作的电脑最大应该是这个实验室的主心吧。
“怎么样了海南博士？“boss
男子推了推了眼镜说:“我们已经把最后一颗潘多拉之心进行加工了，再有一个小时就大功告成了。“
“很好，看来我多年的愿望马上就要实现了。“
boss还在地下实验室做他的美梦，上边FBI已经攻了进来。
房间里琴酒坐在椅子上悠闲的吸着七星香烟。
突然门被狠狠的踹开基安蒂和柯恩拿着散弹枪出现在门口。
琴酒没看一眼被踹的门甚至动都没动，只是眉头稍微皱了一下。
基安蒂没好气的冲着琴酒大叫道:“亏你还有心情在这里悠哉，FBI的人已经打进来了。“
捻灭手中的烟琴酒站了起来双手插入口袋眼神冰冷的看着门口的两人说:“哦，既然如此你们两个还在这里干什么？“
对于琴酒冰冷的眼神基安蒂和柯恩已感到习以为常。
基安蒂愤怒的说:“你以为我们想在这里的吗？“
柯恩虽然没说话但琴酒的态度让他也很恼火。
外面的枪声越来越浓烈！
“柯恩，我们先过去吧。“基安蒂生气的转身。
柯恩在瞄了一眼琴酒后也跟着转身。
待基安蒂和柯恩都转过身后琴酒却从口袋里掏出枪对着基安蒂和柯南后背，看来琴酒想要杀死他们。
感到背后有杀气的两个人急忙转身正看到琴酒拿着枪对着他们。
“琴酒你想要干什么？“基安蒂更加气愤
柯恩声音低沉的说:“琴酒，你想要背叛组织吗？“
琴酒毫不在意的说:“背叛？是那位先生先背叛我和他之前的约定。“
“哼，你确定能杀的了我们两个人吗？“基安蒂
“砰！砰！“两声枪响基安蒂和柯恩倒地不动，从他们身体下流出大量的鲜血。
琴酒并没有为此而感到惊讶，只是缓缓的收起枪。不一会苦艾酒出现在门口背靠着门栏右手举着一把金色的手枪，枪口还微微冒着烟，苦艾酒轻轻吹了吹枪口冲着琴酒微笑，看来基安蒂和柯恩是她杀的。
组织的成员在FBI的攻击下不是死就是投降，所有组织成员都被制服后赤井秀一等人进去了组织大厅，大厅里除了几具尸体外别无他人。
不一会一个穿着FBI制服的男子跑过来向詹姆斯报告道:“詹姆斯先生，到处都找不到组织的boss。“
“真是奇怪了，所有的地方都找过了怎么不见组织的老大呢。“詹姆斯
“该不会是逃跑了吧？“朱蒂
突然一阵脚步声响起，所有人都警惕的向脚步声的地方看去。
从客厅通到房间的拐角处琴酒若无其事的走了出来。
所有人都有些惊讶的看着琴酒，唯有赤井秀一的眼神很奇怪，既不是仇视也不是敌对的眼神。
“完成了！“
地下实验室海南高兴异常。
最高兴的应该还是boss。
“成功了吗？“boss
海南按了一下自己面前仪器上的按钮，只听“吱扭“一声一颗超大的原子弹从实验室的中央自地下缓缓上升，原子弹的周围还有玻璃罩住只留着上方的空隙。
原子弹浮现所有工作人员都看着这颗超大的原子弹，各个都目瞪口呆的看着。
“这颗原心弹长58米，直径50米，重100吨。“
boss高兴的说:“恐怕这是世上最大的原心弹了，我多年的心愿完成了。“
海南博士拿出一个黑色的上面只有两个一红一绿按钮的遥控器说:“这个是发射原心弹的控制器。“
boss接过控制器看了看，看到上面绿色的按钮写着[发射]红色的按钮写着[自毁]
“这个自毁装置是怎么回事？“boss
“这个是为了以防万一如果有人想要破坏原心弹我们就可以把原心弹毁掉，不过如果按下自毁的话恐怕这个实验室都会倒塌连同附近百里的房屋都会遭殃。“
“这个装置是多余的，因为我已经迫不及待的想要发射我可爱的原心弹了。“
“原来boss的目的是这个？“詹姆斯
詹姆斯和赤井秀一，柯南，朱蒂，琴酒，卡梅龙，水无伶奈等人出现在实验室里。
也就在同时实验室四周都出现了FBI，各个拿着长枪，全副武装。
看到这种情况除了boss，海南博士和木纳的水灵外所有都害怕的举起了双手。
boss看了一眼琴酒冷笑一声说:“琴酒，没想到到最后你还是背叛了我。“
“是你先违背了我们之间的约定。“
朱蒂看了着原心弹说:“这颗原子弹一样的东西是什么？“
“这颗原心弹可不像普通的原子弹那样，虽然是在原子弹的基础上研制出的这颗原心弹但却比原子弹用的材质更重更精致，再加上宝石内的潘多拉之心这种特有的矿制更加让原心弹威力无比，一颗这样的原心弹投在地球的中心所有的国家都会被炸为灰烬。“boss
“原来长生不来只是你打的一个幌子。“朱蒂
“这么做你有什么目的？对你又有什么好处？“柯南
“我曾经也是一个杰出的武器专家，但在三十面前一次武器发表会上我说出了我可以做出比原子弹更厉害的核武器时所有人都嘲笑我质疑我，我就是要证明给他们看我可以。“
“我想你就是三十年前那个CAI里很厉害的武器专家爱尔因斯博士。“赤井秀一
“唉，爱尔因斯博士？他不是在一次实验中意外身亡了吗？“朱蒂
“恐怕是炸死吧，为的就是制造出这颗原心弹。“柯南
“没错，制造出这颗原心弹可是需要大量的人力和财力的，在CAI那种受管制的地方怎么可能制造出原心弹，所以我才假死。“
说完boss拿掉了脸上的面具扔在地上，看上去五十多岁但却不显苍老的感觉，比三十岁的男子还有精神。
“你可算是我们CAI的败类。“水无伶奈
“胜者王败者寇只要我成功我就是王，我要全世界的人都看到我的成功。“
“你简直是丧心病狂，我们是不会让你得逞的。“朱蒂
“你们有本事阻止我吗？“boss
说完boss拉着水灵的手腕就跑到身后的门里。
boss突然的举动让FBI的人来不及组织值得眼睁睁看着门关了起来。
詹姆斯向身后的FBI人员使了一个眼神后身后的人员一起开枪，子弹打中钢门，钢门没几秒就支撑不住“彭“的一声倒下。
詹姆斯一行人赶紧追了过去可没走几步就遇到了伏特加。
看到伏特加琴酒对身边的赤井秀一一行人说:“你们去追boss这里交给我。“
听到琴酒这么说大家都拐了弯换了方向追击boss。
“大哥你为什么要背叛boss？“伏特加
“伏特加，我跟了那么多年我不想为难你，你最好让开。“琴酒
“我不能让开，大哥你也回来吧，你也看到boss制造出的原心弹有多么厉害了。“
琴酒拿出枪对着伏特加说:“让开！“
“我说过我不会让开的？。“伏特加也拿出了枪
boss拉着水灵一路跑，跑到一面玻璃前boss急忙打开门。
门内有一个很大的机器，机器的上方有一个很大的显示屏，若大的一个玻璃门内只有这一台仪器看起来很高级的样子。
boss走到仪器面前按了仪器上的按钮，显示屏立刻出现地下实验室映像，屏幕上清楚的显示出原心弹及周遭的情况。
“哼，谁都无法阻止我欣赏原心弹发射的美丽盛况，哈哈哈！“
说完boss拿出遥控器想要按下发射按钮，此时站在他旁边的水灵突然抬脚一踢踢中boss的手腕，遥控器从boss的手中飞落水灵一个大旋身接住了遥控器。
也就在这个时候赤井秀一一行人也追了过来。
boss一副惊讶的模样看着水灵说:“怎么会这样？“
“很抱歉，我已经不受你控制了。“水灵
“是谁？是谁取出了你体内的芯片。“
“很抱歉哦boss，是我取出了水灵体内的芯片。“
苦艾酒不知何时也出现在了门口和詹姆斯等人站在一起。
“苦艾酒，没想到连你也背叛我？“boss
“我可是一直都期待着有一颗银色子弹能打穿组织，不过现在好像银色子弹不是一颗而是三颗。“
“你们要是以为这样就能打败我就错了。“
说完boss又在仪器上按了一下，墙壁四周立刻出现了机关枪，所有机关枪对准赤井秀一等人就是一阵乱射，不得已所有人只好找地方掩护自己，不过这样的话他们也无法出来。
不过不一会琴酒突然出现，琴酒举起手枪打在仪器的键盘上，一颗机关枪的子弹打在琴酒的身上琴酒却一滴血都没流看来他是穿了防弹衣。
机关枪的机关被琴酒打坏机关枪自然立刻失去了控制不在发射子弹，詹姆斯，柯南，赤井秀一等人也从躲避物中出来。
“你现在已经是众叛亲离劝你还是投降吧。“水无伶奈
“哈哈哈，你觉得我会在乎朋友亲人吗？“boss
“现在说什么都没用了，你已经无路可走了。“水灵
“你还是和我们走吧！“詹姆斯
“栽在你们手中是我失算，要不是苦艾酒和琴酒背叛我你们休想抓到我。“说完boss伸出了双臂意思是投降
卡梅龙拿出手铐向boss走去，卡梅龙还没靠近boss，boss突然从袖筒里滑出一把精短的手枪对着卡梅龙的要害开了一枪。
卡梅龙应声倒下没在动一下，事情发生的突然没人来得及的组织，boss也趁此机会掏出一个遥控器对着身后的玻璃按下了按钮玻璃立刻打开了一道门，boss逃走后打开的玻璃门又立刻关上，不仅如此boss临跑时还关闭了另外一个出口的门，这一行人等于被困在了这个地方。
“我已经启动了里面的定时炸弹，你们就慢慢等死吧，哈哈哈！“说完boss就关了第二道门
朱蒂跑到卡梅龙身边不停的呼唤他，不过他已经听不到了，卡梅龙死了所有人难过。
赤井秀一拿出手枪对着玻璃开了几枪可是玻璃完好无损。
“这里都是防弹玻璃子弹对它一点用也没有。“赤井秀一
“离炸弹爆炸的时间还有一个小时。“柯南看着定时炸弹上的时间说
“难道就没有其它出口了吗？“水无伶奈
“真是笨，心里一眼就能看完了四周都是防弹玻璃怎么可能会有其它出口。“苦艾酒
水灵走到boss逃出去的地方看了又看摸了又摸说:“他是怎么打开这个门的，这里一点缝隙都没有。“
说完水灵还使劲推了推玻璃可是一点用都没有。
“难道我们真的就死在这里了吗？“朱蒂
水灵看了一眼琴酒，看到琴酒的手臂上受了伤，血还在往外流，黑色的风衣让流出的血不太明显。
水灵走到琴酒身边说:“你受伤了！“
“没事，一点小伤而已。“
“我担心这次让boss逃走不知道以后要什么时候才能抓住他，我们的人应该都撤离这里了吧。“詹姆斯
“放心吧，我想这会boss应该被抓住了。“柯南
所有人都惊讶不解的看着柯南。
柯南得意的说:“为了以防万一我在来这里之前就以工藤新一的身份告诉毛利叔叔如果两个小时后我没有打电话给他的话就让他务必带着警察来这个地方，算算时间毛利叔叔应该刚刚赶到吧，如果boss想逃出去的话势必会碰到毛利叔叔。“
听到柯南这么讲他们总算松了口气，不管他们最后会如何至少大坏蛋boss被抓住了。
与此同时毛利小五郎带着目暮警官和高木警官及其他警员来到这个隐秘的大房子前。
“毛利老弟座房子里真的有一个坏人在里面吗？“目暮警官
“这个我也不是很清楚，是那个侦探小子突然打电话给我，听他语气很紧张不像是开玩笑。“
“待在外面怎么会知道呢，我们进去看看。“佐藤警官
“大家要小心一点。“目暮警官
佐藤和高木警官打头阵小心翼翼的打开大门走了进去，不过里面黑乎乎的。
才刚走进去突然有一个跑了出来撞到了高木和佐藤。
“什么人？站住，我们是警察。“高木
不过前面的人根本不理他，佐藤和高木立刻追上去。
高木和佐藤没追上他倒是让毛利小五郎用柔道制服了他。
其实这个人不是别人而是boss。
毛利小五郎坐在boss身上得意的大笑说:“毛利小五郎成功抓捕犯人。“
毛利小五郎还做出了剪刀手的手势，岂不知boss被他的屁股压的很难受。
目暮警官无奈的看着毛利小五郎说:“毛利老弟你就别耍宝了。“
被关在玻璃屋内的几个人还是一筹莫展，各个愁眉苦脸，只有苦艾酒还有心情吸烟。
“琴酒，你能和我讲我爸妈的事吗？你一定都知道的对吧？“水灵
“他当然什么都知道，他可算是你哥哥。“赤井秀一
水灵惊讶说:“哥哥？怎么可能？我为什么一点记忆都没有？“
“你的父母当年收养了一个孤儿，但在你父母死后那名被收养的孤儿就不知所踪，不过照现在看来那名孤儿应该就是琴酒没错了。“
“秀一哥哥说的是真的吗琴酒？“水灵
“令我们不解的是你和夏惠为什么最后会在组织，而夏惠为什么对她七岁之前的记忆一点都记不起？“赤井秀一
琴酒一直都没说话，他或许在想十年前的事。
(关于击破组织的部分写的非常不好，不过我已经尽力了，大家见谅，不要大力吐槽才好)