庚戊（康熙九年）
辛亥（康熙十年）
壬子（康熙十一年）
癸丑（康熙十二年）
十一月，平西王吴三桂据云南、四川、贵州以叛，遂陷湖南岳州诸郡县，称大周元年。初，平南王尚可喜疏称归老辽东，而留其子安达公之信袭镇广东，朝议许之，并令举家归旗。平西、靖南相继疏请，俱报可。至是平西反。乃命平南、靖南仍留驻镇。时耿继茂已死，耿精忠袭王。三王交通逆命，虽复停留，而反谋益决。
甲寅（康熙十三年）
三月十五日，耿精忠据福建传各官入府议事，伏甲执总督范承谟、巡抚刘秉政以叛。知府王之仪、建宁同知喻三畏走出被杀。范承谟被拘。以刘秉政为伪统制使，乡宦萧震为伪布政使，自称「总统兵马上将军」，移檄各府州县，俱望风而降。
十九日，耿精忠檄至泉州，提督王进功是夜纵诸将焚烧南街、西街谯楼，杀掠到晚，绅庶无遗，传檄各属县皆降。兴化镇马惟兴劫兴化，守备郭维藩劫惠安，独同安城守张学尧、晋江水师营李尚文所部无犯。
耿精忠再遣通事黄镛至台湾。初，耿精忠将拒命，遣镛通郑经请师为声援。至是，又遣镛见郑经，请以舟师由海上出江南，而己统陆师出浙江。镛回言，海上船不满百，兵不满万，精忠始轻之。
耿精忠以黄梧为伪平和公。梧病疽，受印不数日，疽坏而死；其子黄芳度袭封，管其兵。
驻防漳海道陈启泰党于范承谟，与精忠有隙，闻变，先杀家属十余人，乃自缢。陈为官则甚贫，于死则甚烈。
漳浦镇刘炎、海澄镇赵得胜俱降耿。福宁镇吴万福贪刻失将士心，谋拒耿，众不从。耿精忠遣伪都尉曾养性督兵至，万福出降，养性诱杀之，并其兵，遂乘胜长驱至平阳，总镇蔡朝佐降，温、处二府望风皆下。
四月，潮州总镇刘进忠降耿，密请师，耿令刘炎率兵会之，夜攻同城，续顺公沈瑞并其兵。精忠召王进功，至福州，留之，征其兵。
郑经遣协理礼官柯平至福州报命。时耿声势已振，谩应曰：『郑世藩来，甚喜，但兵多饷少，各分地自战可也』。由是兵端遂起。
郑经亲军侍卫冯锡范、镇将刘国轩率舟师数十，兵数千，先至厦门。
耿精忠檄诸路兵出关。黄芳度遣黄翼领兵千人应命。赵得胜不从，与冯锡范阴约，以海澄归命于郑经，随将兵进攻同安。
王进功之入福州也，耿精忠调张学尧镇泉州，以化尚兰代守同安。郑经兵至，尚兰迎降。获学尧家眷。学尧闻变趋回，施福引之，俱降郑经。
五月，郑经至思明州。以赵得胜为左提督，封兴明伯；张学尧为左先锋镇，化尚兰为仁武镇。遣人至精忠处，议拨地方安插船只兵丁，精忠不答，又禁买竹木麻绳修船等物，遂成仇隙。至是，耿精忠闻同安之失，乃遣王进率步卒千余人入镇泉州（王进号王老虎，原任漳州副将）。时提督五营兵将不肯应调。王进至，与城守赖玉相诘纳，用提标守备戴国用为爪牙，勒王进功家眷入省。耿精忠复遣兵接应，兵将至，进功之子藩锡与其属杨青等议先发以制之。
六月初一日，王藩锡以提督夫人之命召诸将议事，诱赖玉、戴国用、李尚文等执之，率兵攻王进。进走登涂门楼，意气自若，提标兵散而无统帅，相持至晚不决。进恐海船至，更深整队出城西去。
初三日，藩锡等杀赖玉，分其尸。初四日，绞杀戴国用，释李尚文，迎郑经入城。郑经以藩锡为指挥使，暂理提督军务。
黄芳度袭杀漳州城守刘豹。豹，耿氏所署也。郑经遣人谕之，芳度遂降，封德化公，授前提督，漳属钱粮听其征给。芳度终不自安，遣人间道赍密疏入京。
七月，平南王尚可喜遣兵围刘进忠于潮州。耿精忠不能救，进忠纳款于海上。郑经遣援剿后镇金汉臣率舟师援之。以进忠为右提督，封定虏伯。
九月，耿精忠以步骑二万，遣漳浦新降总兵刘炎同王进攻泉州。鼓行至惠安，肆行焚掠。郑经命刘国轩督诸镇，并统五营兵御之，对垒逾旬，进退屯枫亭，列营二十余里。
十月，国轩兵至涂岭，严阵会战。王进见前阵皆新募之兵，直前奋击之，兵皆惧怯死战。国轩令许耀分兵袭其后，焚其营垒，进兵大败。国轩追至兴化城外，三日夜而还。
十一月，伪周吴三桂遣礼曹钱点聘于海，值郑、耿交恶，回报。复遣礼曹员外周文骥至海和解。
刘炎在漳浦，不降郑经，密请援于耿逆。耿遣兵会之。至平和，郑经檄黄芳度击走之。耿逆复遣其亲军都尉徐鸿弼从间道入漳浦。郑经以冯锡范、赵得胜督诸军攻之。徐鸿弼、刘炎会云霄镇刘成龙合兵迎战于罗山岭。右虎卫何佑挥军击之，鸿弼等大败，走回城。冯锡范以红夷大炮击入城中，刘炎等大惧，同鸿弼、成龙俱出降。
十二月，赵得胜督诸军援潮州，与平南王兵战于黄冈，大破走之，潮围始解。初，进忠被围，金汉臣一军歼焉。进忠极力守御，将及半载。至是，广兵烧营而遁。
郑经分设六官，名曰协理：洪磊为吏官，杨英为户官，郑斌为礼官，柯平为刑官，杨贤为工官，兵官缺。置六科都事、都吏、察言司、承宣司、宾客等司。陈永华为总制留守，兼管勇卫，冯锡范为侍卫（二卫皆亲军）；薛进思为左武卫，刘国轩为右武卫，何佑为左虎卫，以施福为五军；其左右先锋及诸镇营皆听五提督调遣。凡文武事宜，皆赞画参军陈绳武、侍卫冯锡范主之。
初，郑经之来思明州也，兵饟取给于东宁。洪磊承其父洪旭遗命，助饷银十万两，至是兵众饷多，转运不给，乃以六官督比绅士富民以充之。以郑省英为宣慰使，总理各府州县钱粮。百姓年十六以上、六十以下，每人月纳银五分，名曰「毛丁」；船计丈尺纳税，名曰「梁头」；特设各府盐司，分管盐场，以给兵食。
乙卯（康熙十四年）
正月，耿贼遣张文韬至郑贺正议和，送船五只。郑经遣礼官郑斌报之，约以枫亭为界。自是郑、耿交好。
二月，永春马跳峰寨民吕华不服郑氏征派，薛进思围之。三阅月不下。知县郑时英谕之出降，钉杀之，家族发淡水充军。
续顺公沈瑞驻饶平，刘进忠攻之不克。广兵来援，何佑遇之于百子桥，破走之，瑞出降，改封怀安侯。
流洪经略承畴胞侄士昌、天恩、天伦及眷口于东宁之狼峤，从公论也。流前进士杨明琅及眷口于狼峤，以其过崇祯帝梓宫不下马，又修南安县志以海上为海寇也。后皆死于流所。知南安南县事刘佑云：『洪经略未必尽是，郑国姓未必尽非』。郑经悦其言，召之，已逃回籍矣。
五月，刘进忠请海师南下，郑经许之。初六日，郑经入海澄，遣郑斌入漳，慰谕黄芳度，或束兵入见，或统兵随征。芳度终不受命，密调回黄翼出关之兵。耿逆移檄召之，亦以疾辞。郑经遂定攻城之计。
刘国轩率诸镇兵至潮，与进忠规取属县之未附者。安达公尚之信悉力守御，相持日久，粮乏兵病。之信调兵十余万尽锐来攻。国轩自新墟寨一日一夜退至鲎母山，以余粮露载车上，宣慰使洪磊悬金以赏有功，军心稍定。进忠与国轩议曰：『之信大兵必从小路而来，出我不意，须得劲将当之；惟何佑可任，然不可言其故，恐其心怯。子可严阵以待，而余将骑兵背城以为应援』。国轩从之。是夜见敌营从大路火光照耀，进忠发大炮击之，见火光不动。进忠曰：『是空营也，我兵可安寝以待』。次日，之信率兵从小路而来，何佑见大队突至，欲退不可，冒死直前，奋勇击之，无不以一当百。之信大败走。国轩等穷日夜追之，杀死不计其数。是役也，佑以饥率数千破敌兵数万，由是何佑之名，大振粤东。佑，别号「何锥子」。
六月，郑经自海澄移檄万松关；黄芳度令其下俱薙发，率兵拒守，不降。遣其兄芳泰突围入粤请援。郑经进攻不利，援剿后镇万宏云梯登城，中炮死。郑经乃筑长围以困之。调何佑从潮州先攻平和县，守将赖升降，诸属县皆下。
十月，海澄公标将吴淑以漳州降于郑经。初，淑投诚属公标，黄梧待之厚；将死，呼淑托曰：『吾儿年少，君可保全之』。及城被围日久，淑谓其弟潜曰：『我本郑氏降将，公虽待我厚，我负罪于先藩实深。今世藩待我眷族，恩尤加重，岂可反图逆命』？遂以初六日开城出降。郑经兵入，芳度仓皇投开元寺井而死。获其将黄翼、蔡龙、朱武、张济、戴麟、陈骥、黄管等，皆斩之。没其家。剖黄梧棺戮尸斩首，并芳度首揭竿以徇众。有议发梧祖茔者，郑经曰：『罪止其身，与先死者何预』？不许。后朝命赠芳度为忠勇王。时芳泰往粤求援，会其兄芳世由汀州至永定，亦以是日破永定县，闻漳州陷，乃大掠而遁。郑经以吴淑为后提督，吴潜为戎旗二镇。
十一月，郑经令龚淳往日本取回郑泰所寄之银。淳乃泰委寄之人，并执有收票可据。先是，两家纷争，日本王皆不肯与；至是，番人皆混开支销银凡四十五万，仅得二十六万而回。
丙辰（康熙十五年）
正月，郑经以右虎卫许耀、前冲镇洪羽等率师会在潮诸将攻取广东州郡。
二月，平南王昏病日甚，会伪周师克肇庆、韶州等处，广州人人自危。驻韶诸军闻报，烧营而遁。刘国轩、刘进忠、何佑等分南北两路而进。碣石镇苗之秀军程乡，其妻在汛，遣人迎降，仍劝之秀纳款，郑经许其回镇碣石。国轩等水陆并进，围惠州，攻博罗不下，旋下长乐、新安、龙门等县。之信穷蹙，遂乞降三桂。三桂封之信为辅德公，檄让惠州于经。之信檄提督严明撤守兵回广，遣使馈弓马、币帛通好于郑氏。郑经乃以国轩镇惠州。东莞守将张国勋亦降郑经，经以为后劲镇。自是郑与吴分界而守。
五月，耿逆调汀州镇刘应麟兵出关，应麟不从，密通款于郑经。经乃遣吴淑统兵，驰书于精忠，言欲假道汀州以出江右。耿贼遣兵防城，应麟惧其图已，率所部出掠瑞金、石城。吴淑兵至，应麟与之合兵共攻汀州，遂下之。郑经以应麟为前提督。
七月，郑经调刘进忠出师，进忠称疾不行。进忠自潮州定后来见，郑经待之礼意疏略，见左右用事者皆录录，知不足与有为。及取汀州，叹为失计。至兴宁，与诸将不协，流言日起，遂称病回潮，阴为自守之计。
九月，耿贼师出浙江者为总督李之芳所扼，多被摧败，朝命遣康亲王提兵乘机入闽。耿贼兵出江西者为总督蔡毓荣及满洲兵移驻防兵合力拒之，耿兵大败，广信遂失。既而弃建昌不守，大势已溃。又闻汀州已破，耿贼益忧内顾，诸将遂密谋，诈作耿贼投诚献关。耿贼闻变，大惧，收王进、范承谟、萧震绞杀之，欲乘船奔海，为都尉徐文耀所胁，不得出城。遣王进功回泉州取救兵，密嘱曰：『我忍死以待也』！然延建已失，不得已于十九日薙发迎康亲王入福州。后耿贼入京，与徐文耀及诸将领皆伏诛。
兴化守将马成龙以城降于郑氏，郑经令许耀率兵赴之。
十月，郑经令许耀督诸军进取福州，驻师乌龙江；许耀骄纵，诸将不服，饮酒嬉戏，不知军事。大兵渡江，有议于半渡击之，不听；既登岸，仓皇出战，先锋死鬪，不能分兵救援，及少却，又不殿后，引兵先走，委弃辎重器械不可胜计。郑经乃遣赵得胜、何佑屯兴化以代之。
耿贼檄曾养性等自温州航海回闽，朱天贵以舟师降于郑氏，其余逃入福州。郑经遣奇兵镇黄应邀击之，获巨船数十艘。
十一月，精忠邵武守将杨德献款于吴淑，淑入据之，始请盟。
十二月，大兵至邵武，吴淑御之。时大雪严寒，诸军冒雪涉溪拒战，皆大冻，不能支。遂弃邵武，退札汀州。大兵进至建宁县，薛进思守汀，闻之惊惧失措。刘应麟愿倾赀饷兵固守，进思猜疑不从，弃城而走。应麟奔潮州依刘进忠，发愤病死。
平南王尚可喜于九月病故，之信遣使报讣，并请其妹奔丧。妹，沈瑞叔母也。郑经许之，并遣使吊丧。伪周封之信为辅德亲王。
丁己（康熙十六年）
正月，大兵至兴化。时郑军锐气已丧，何佑又与赵得胜不睦，疑其纳款于我，战败不救，得胜死之，何佑奔回泉州。
二月初九日，大兵至泉州。郑氏守将林定无备，城陷，标将林孟、参宿营谢贵死之。林定素与民相安，逃于民间，削发走免。诸军溃散。
十九日，大兵至漳州。郑经仓皇登舟，至海澄，弃而不守；至厦门，欲回东宁，百姓号哭攀留。角宿营吴桂整兵防守，泉赖以安。继而余众稍集，乃遣水师防卫分汛而守。
郑经祭赵得胜，亲临哭之。斩薛进思（原姓名斐德），许耀捆责。耀病痢，不数日死。何佑、吴淑戴罪自效。
郑经遣诸将家眷搬回东宁。王进功、沈瑞、张学尧等陆续起程。刘炎以母老病，至外洋勒兵劫船，乘风下碣石卫，依苗之秀；后投诚至京，流徙宁古塔。
三月，郑氏诸将退集思明州。时兵饷不给，乃分汛南北地方，措饷召募。以前虎卫林升、水师楼船中镇萧琛等驻晋南及定海、福宁一带地方；以后提督吴淑、扬威前镇陈昌、戎旗一镇林应、奇兵镇黄应等驻同安至揭阳、潮阳一带地方。
漳浦巫者朱寅挟左道，诡称朱三太子，聚集海上残兵二百余人，于十九夜袭泉州，攀堞而上，鸣鼓扬旗，从开元寺前至西街。守兵以为海师复至，乃于双门前发一大炮。寅乃抽回出城而去。人以为神，附者日众，屡战皆胜，蔓延于漳、泉属县，凡深山穷谷岩寨，无所不到，派粮以食。头裹白布，时人谓之「白头贼」。
六月，刘进忠拥兵观望。郑经遣户官至潮征饷，不应；买运，又闭籴，献款于伪周。寻归王朝，磔死燕市。
刘国轩在惠州，尚之信既归命，孤城难守，郑经遣水师迎之，乃率所部航海而归。