脱粒不净损失主要指在脱出物中的未脱和未脱净的穗头被排出机外造成的损失。造成脱粒不净损失的原因主要表现为三个方面：
（1）调整不当造成。如滚筒转速太低，滚筒与凹板间隙过大。
（2）由机器零部件磨损超限、变形损坏造成。如纹杆齿棱角严重磨损，棱角已成圆角，且半径大于1毫米。
（3）滚筒纹杆条弯曲变形，凹板横板条棱角磨成圆角，凹板变形（这时脱不净损失和破碎损失同时存在）等。造成钉齿式滚筒脱不净损失的原因主要表现为两个方面：一是调整问题，滚筒转速太低和凹板间隙太大；二是装配问题，装配时带钉齿的凹板偏向一侧。所谓的滚筒凹板间隙是指钉齿侧面间隙，一但装偏，就会出现钉齿一侧间隙大一侧间隙小，其结果是既有脱不净损失，也有破碎损失，两种损失会同时存在。
实践证明，造成脱粒不净损失的主要原因属上述第二种情况者偏多，很多驾驶员对此认识不清，总认为只要滚筒能转动，不与凹板碰撞就是好机器，就能从事收割作业。还有就是驾驶员对零部件磨损是否超限无界定标准。