黄连是多年生草本植物，属于毛莨科。它生长在高山林下阴湿之处，地下部分根茎长而分枝，生着许多须根，均呈黄色。因根、茎多节，成串相连，所以取名“黄连”。叶柄细长，由三小叶构成复叶。春开小型白花，生于花茎上部，3～8朵花组成聚伞花序，雌雄异株。
