1952年建院初期，由于学生和新教师迅增，新专业、新课程大量开设，教师学习苏联、教学及进修等任务均甚繁重，尚难以顾及科学研究。开始，只要求各教研组，实事求是地根据教师的业务水平来考虑，不宜过急地要求所有教师都参加研究工作，但亦不应把科学研究看成高不可攀而裹足不前;研究题目，要结合生产实际和教学实际。当时把学习苏联的体会、编写教材、教学经验报告及安装实验设备等一类工作，均当作科学研究的前期准备工作。
1954年10月，院务扩大会议通过《关于开展科学研究工作的决议》，决议指出:“进行教学工作和科学研究工作都是高等学校的基本任务。开展科学研究，不仅对科学的发展和国民经济的发展，有着重要的意义，而且在鼓励教师钻研科学、联系实际，从而提高业务水平和教学质量，也有重要的意义。所以高等学校的教学工作与科研工作是不可分割的两个方面。”结合当时的实际，钱钟韩副院长要求教师注意:“从小到大，从低级到高级，循序前进”，并对基础课教研组、专业教研组以及不同水平的教师，分别提出了不同的要求。各系和教研组都制订了科研工作的计划，科学研究开始启动。1955年，总计提出科研题目的教研组共35个，题目113项。参加科学研究的教师147人，其中正、副教授42人，占同级教师的53.8纬;讲师52人，占同级教师的32.300;助教53人，占同级教师的23.800。与此同时，学术报告、学术讨论会也初步开展起来，建筑系举办了多次建筑思想的报告会和研讨会。与工厂企业合作进行研究工作也在开始，共与12个单位签订了联系、合作合同。但执行情况并不理想，由于有些题目并非教学或生产上L}需研究解决的问题，有些题目因工厂生产任务变动而中止，有些题目缺少必要的实验手段和物质条件，故约有三分之一题目没有完成任务。
1955年下半年，中共中央提出了“向科学进军”的号召，科研工作加快了前进的步伐，院系作出具体部署，教师从不同的起点上参加了各层次的研究工作。经过一年的努力和准备，1956年10月26日至30日，南京工学院召开了第一次科学讨论会。讨论会规模宏大，盛况空前，按学科、专业性质，分别在20个场所同时进行，来宾140。余人，在宁的科研机构、厂矿院校来人踊跃，来自西北、西南、华东、华南的也有500余人。
大会共收到论文201篇，其中20篇为工厂企业、科研部门及兄弟院校所提供，181篇系本校教师提供，内中叉有3000为青年教师撰写，显示了新一代教师在迅速成长。论文内容丰富，不少论文有较高的学术价值和实用价值，引起了与会者的兴趣和重视。例如，建筑系刘敦祯教授所作《苏州园林》的学术报告，得到了专家学者的高度评价，认为这是研究中国古典园林的经典成果。舒光冀教授所作《钢铸件冒口尺寸的计算》报告，获铸造工程界的好评，戚墅堰机车车辆厂的工程师认为对他们启发帮助很大，当场表示愿意协助学校进行该项试验。阂华教授所作《电力系统不对称运动》的专题报告，电厂同志听后满意地认为解决了他们多年未解决的问题。食品工业系的论文报告，大部分结合解决工厂生产中的实际问题，如王赦教授的《豆油高温水化》，沈学源教授的《目前碾米工业存在的几个问题》，黄本立教授的《从碾米厂的废物(下脚)中用物理方法分开杂质的初步试验》等，对工厂改进生产都有直接的作用与贡献。此外，如刘光华、苏华钦、戴居正、成竟志等的研究报告，也受到了与会者的较高评价。化工系水泥工学教研组在苏联专家库兹涅佐夫指导下共提出8篇论文，受到了同行的赞许。
这次科学讨论会是一个良好的开端。在此期间，也曾筹划过科研据点的建设。“科研据点”也即今天的学校重点科研基地和重点实验室，后来因种种原因而中断。
1957年，全院预计进行科学研究的选题有213项，参加研究工作的教师共291人，占全院教师的58.10o，其中正副教授61人，讲师93人，助教118人。在全部选题中，属于国家研究项目的有18个，属于工厂企业部门提出的共97个，编写教材方面的24个，其他项目74个，并准备于1958年4月前后，分系举行南工第二次科学讨论会，后因整风运动、“反右”斗争等原因而未能举行。
反思历史，人们痛切地感到:科学研究最需要有一个良好的做学问的环境，科研人员必须结合实际做扎扎实实的工作。