蟹养殖的市场前景广阔，但几大因素制约着蟹养殖业的发展。
首先，河蟹苗种与商品蟹养殖相对脱节。自70年代至今，人工育苗，特别是沿海地区利用天然海水育苗技术已基本过关，并趋于稳定。
其次，河蟹本身种质混杂、质量下降。河蟹种质由于天然和人为因素的影响，已基本混杂。由于天然蟹苗产量的锐减，只能依靠人工苗来满足市场需求。在巨额利润的刺激下，长江流域的养殖者，一方面为盈得商业利润不问蟹种来源（或者根本不懂），只要是河蟹种买来即养。但因养殖技术、防逃技术不过关及自然灾害，造成河蟹种质自然混杂。另一方面，不同水系河蟹的个体形态差异小，购种时非专业技术人员难以区别，造成同一水域多种水系河蟹混杂。
三，河蟹养殖业科技开发明显滞后于生产。目前河蟹养殖者，大多是自发“个体户”，对河蟹养殖技术了解者寥寥无几，也不可能把资金投入到河蟹养殖技术更新上来，仅仅依靠钱多胆大，敢闯敢拼和“运气”赚钱，造成有苗就要、有种就养、有水就放的局势，科技开发明显滞后于生产，使发展河蟹养殖业缺乏动力。
四：河蟹种质管理混乱，制度不健全。河蟹作为我国特有的水产品，至今还未出现相应的种质管理条例，对种质的管理，仅仅停留在收“资源增殖费”上，给投机者制造了贩卖假种的可趁之机。
五：河蟹经营分散、小规模、粗放型、产销两地分离、供销服务脱节。目前，河蟹养殖基本上是小规模、粗放型养殖方式，缺乏市场竞争能力和应变能力，效益相对较差。对内陆河蟹养殖业影响的另一主要因素是产、销两地分离，供销脱节。