因奕在政变中为慈禧等出了许多高招，起到了关键的作用，政变后，他被封为御前大臣、领侍卫内大臣、后扈大臣、都统、掌神机营，他曾经不无得意地说：“我21岁时就担当过大事，亲手缉拿了肃顺。”33岁，他由醇郡王晋封为亲王。45岁时，他参与了军机处紧要事件的商议。46岁，他总理海军事务，所有沿海水师统统归他节制调遣，还带领禁卫军保卫皇宫。正当壮年的奕成为清王朝内有权势的人物。如果他要弄权的话，完全可以作威作福一番的。可是慈禧对奕的信任，反而使奕变得异常地小心翼翼、战战兢兢，因为他愈亲近慈禧，越知道慈禧的猜忌任性、不可一世。他不敢安然享受这些权势禄位，所以他曾一再请求辞去他担任的总理海军等职务，但总未获准，而且为了慈禧的需要，反而挪借北洋海军的军费为她修建了北京西郊的避暑胜地——颐和园。47岁时，他更被赏坐杏黄肩舆，他一再固辞。甚至有人对他的赞扬奉承，他也以为是有人要陷害他而心存戒备。最能说明这种心理的是1875年，同治皇帝病逝，慈禧让立奕的次子载湉作为咸丰的嗣子，即光绪皇帝。这本来是个“喜讯”，可是奕譞听说后却大惊失色，当即碰头痛哭，昏迷伏地，掖之不能起。后来他自己说：“臣前日仰瞻遗容，五内崩裂，已觉气体难更，犹思力济艰难，尽事听命。忽蒙懿旨下降择定嗣皇帝，仓促之间昏迷罔知所措。迨舁回家内，身战心摇，如痴如梦。致触犯旧有肝疾等症，实属委顿成废。”以此遮盖他的失态。慈禧也认为他“情词恳挚，出于至诚”，而没有深究。
奕的正福晋是叶赫那拉氏，她是慈禧的同胞妹子，理应和慈禧很亲近，但恰恰不是。她为人拘谨，头脑里旧的观念根深蒂固。夏天轻易不到花园里去，怕踩死蚂蚁，是罪过。光绪被选进宫去以后，底下还有两个孩子，她心疼孩子，怕孩子得病，不敢让孩子吃饱，节制饮食。孩子饿得皮包骨头，得了营养不良的病。仆人们看见孩子饿得可怜，偷偷地给些吃的，又受到训斥，最后这两个孩子活活饿死了。同治死后，西太后看戏，召奕福晋进宫一同看戏，她闭着眼不看。慈禧问她为什么不看戏，她说：“国丧不能看戏。”把西太后气哭了，觉得这个人怎么这样不近人情！所以说她们亲姊妹之间的关系是非常不好的。
慈禧既和她亲妹妹不和，她还想出个绝招来治她妹妹，慈禧太后后来赐了个宫女给奕，叫颜扎氏，并封为侧福晋。慈禧赐的宫女，奕怎敢不要呢？更不能亏待她。颜扎氏长得漂亮，又常被慈禧叫进宫去，她常和正福晋作对，使醇亲王府内宅不宁。载沣的亲娘是刘佳氏，她原是王府中的“侍女”。
慈禧为了维护并巩固她的权威，必然要信任奕这样的近支亲属。奕也一再用各种方式表明自己对朝廷忠心耿耿，让慈禧放心。例如他把自己的居室命名为“退省斋”“九思堂”“恩波亭”等。据说奕还有一个象牙镇纸，上面刻有奕譞亲笔题词：“闲可养心，退思补过”，就说明了他这种心情。奕卒于光绪十七年（1891年），谥曰“贤”，称醇贤亲王，这是第一代醇亲王。老醇王刚过世不久，慈禧太后就指派奕第五子载沣世袭醇亲王。