生命进化是一个优胜劣汰的漫长过程，能保留至今的生命形式都有它存在的理由。人们一般认为从性行为的最终功能——生殖来说，同性交配无法产生后代，是一种浪费的行为模式，可是这种现象在动物界广泛存在至今，就必、然有一定的生物学和动物社会学意义。这里仅仅介绍同性恋行为常见的几种生物学功能：
1、技能训练
动物间同性性行为的生物学意义，或许在于是一种性技能的训练。年幼的灵长类在游戏时有时会发生一些爬跨行为。研究表明，在幼年时期的同性爬跨行为比成年时要多得多，这也许是由于幼体未到成熟期，还没有发育成熟的性器官，没有足够性激素的刺激，它们之间的爬跨不是一种性行为，而仅仅是一种“游戏”。小家伙们是在模仿成年动物之间的行为？幼年时期的同性性行为也许是一种性技能的训练吧。
2、攻击抑制
社群动物中的个体间常常发生对抗性冲突，因此自然选择保留了抑制冲突的行为方式，其中交换礼物（食物或树枝之类的物品）、对唱山歌、合唱共舞、互理毛发（羽毛）、乃至拥抱（灵长类）、交嘴（鸟类）等等一系列类似求偶动作的修好礼行表现最为常见。动物间的争斗通常以同性居多，动物发生性行为的本质也许不仅是为了繁殖后代，还可能是一种个体间结合的手段。倭黑猩猩是一种容易激动的动物，经常为了一些小事而争斗，可是它们争斗平息的速度似乎比发生的还快，其途径之一就是通过性行为。两只同性间互相摩擦生殖器，而异性间则发生真正的交配行为，它们以这种行为来示好、平息争斗，以减少家族和自己的损失。由此可以看出，同性性行为有着维持动物种群稳定的作用。
3、能且释放
（缓解紧张）在交配季节，一些雌少雄多的种群里或是在等级序列非常严格的种群里，雌性动物会选择那些具有优秀基因的雄性个体与之交配，剩余的单身汉往往因为找不到配偶，又受到附近异性交配的刺激而互相之间发生同性性交行为，就像上面提到的雄斑鸠在没有雌斑鸠的情况下会对母鸡甚至抹布求偶，取代对象的存在是发生同性性行为的基础。动物通过对取代对象做出求偶行为或性行为，可以释放体内积累的动作特异势能（即表现某一动作之前的内部待机状态程度），以缓解自身的紧张状态。
4.联盟效应
季节性繁殖的物种，在交配期雄性动物为争夺配偶权，常发生象征性或殊死性的争斗以形成新的等级序列。胜者往往会对失败者做出爬跨行为，向弱者“示强”，这属于一种性侵犯的爬跨。在猴群中常会有这样的现象，实力不够强大者之间常会依靠互相爬跨的举动示好结为联盟，以增加与雌性交配的机会。因为两个单身汉联合在一起就很有可能打败一个比它们任何一个都强大的对手，当强者被“联盟”打得精疲力尽时，其中的一只就会拖住强者，让另外一只去与雌性交配；下一次，它们可以交换角色，使两者都得利。这样的情况在鸟类中也不罕见。