一、战争尾声
太平洋战争的头两年中，麦克阿瑟将军的西南太平洋地区战事最为活跃，而他后来沿新几内亚海岸推进，对战局根本没有决定性的影响。麦克阿瑟将军曾经担心，这种推进同尼米兹将军横跨中太平洋的迅猛进攻相比，似乎是多余的。麦克阿瑟的部队占领吕宋，为封锁日本提供一个有用的基地。但在占领吕宋之后，他的部队仍只限于在西南太平洋地区作战，只能南进到菲律宾南部和婆罗洲，对于击败日本无关大局。
到了1945年，陆军部和麦克阿瑟对这种束缚陆军将军手脚的限制，特别是由于这种限制将妨碍他参与进攻日本而日益不满。陆军部不愿看到，在尼米兹指挥以海军为核心的各级司令部进攻日本本土的同时，让麦克阿瑟在南边坐冷板凳。在华盛顿，有关整个太平洋战场建立统一指挥部的各种老意见再度提了出来，但各种意见均遭到难以辩驳的反对。最后，麦克阿瑟在三月下旬间接从总统那里得知，最高指挥部已寻得一项解决办法。罗斯福对正在华盛顿的肯尼将军说："你可以告诉道格拉斯，我希望他不久将在菲律宾以北承担重大任务。"
4月3日，参谋长联席会议颁布了一项折衷的解决办法：在进攻日本中，麦克阿瑟将指挥太平洋地区的全部陆军地面部队和航空兵（驻马里亚纳的陆军第20航空队和某些非战区的部队除外）；尼米兹指挥太平洋的全部海军。这个方案看起来简单，实际上难办。附带的一项指示是，参谋长联席会议命令麦克阿瑟和尼米兹仍按旧的指挥关系完成当前各自的战斗任务。至于如何过渡到新的体制，应逐步进行，共同协商。
4月13日，由萨瑟兰将军率领的一班军官从麦克阿瑟的马尼拉总部飞抵关岛，会晤尼米兹将军和他的参谋人员，贯彻落实参谋长联席会议的指示。萨瑟兰将军误认为尼米兹态度谦让，软弱可欺，他盛气凌人地提出了他所谓的麦克阿瑟的意见。他说，将军建议尽可能迅速地全部接管尼米兹指挥的陆军部队，包括太平洋地区各岛屿基地上的驻军。在接管过程中，萨瑟兰要把他称之为"过时的"尼米兹的统一指挥分散开来。他断言，今后任何海军将领都不得指挥和调动陆军部队。
如果萨瑟兰认为尼米兹会顺从地接受这种条件，那么他很快就发现他错了。尼米兹对他说，他希望在陆军部队完成作战任务后再把对它的指挥权交还麦克阿瑟；只要尼米兹仍在太平洋战区负责，该区各地的主要驻军都必须由他指挥；如果各海区和外围岛屿不实行统一指挥，将会引起部队混乱，而且影响战争任务的彻底完成。他最后说："因此，我现在不能答应把这些对太平洋战区的防务和履行职责必不可少的陆军部队（包括地面、空中和后勤）的作战指挥权交给他。
萨瑟兰说，麦克阿瑟要求将冲绳岛作为肯尼将军的航空兵基地，作为预定在1945年11月1日发动进攻九州的"奥林匹克行动"的基地。尼米兹同意在完全占领冲绳后立即将整个琉球群岛移交麦克阿瑟；如果参谋长联席会议发出进攻九州的指示，他还可提前移交。他谢绝了请他负责西南太平洋地区海上作战指挥的建议。他要是同意这样做，就必然在事实上成为麦克阿瑟的部属。如果他一旦接受麦克阿瑟的命令，麦克阿瑟一定会指挥快速航空母舰特混舰队的一切行动，结果只会受到海军部尤其是金将军的斥责。尼米兹说，虽然他不负责指挥西南太平洋的海军部队进行两栖作战，但他将一如既往在这类战斗中提供海上掩护并把海上直接参战的部队调归麦克阿瑟指挥。
萨瑟兰一行这次到关岛来是专程代表麦克阿瑟提出立即采取行动的建议，但他们在4月16日清晨离开时却是两手空空，一无所获。他们了解到尼米兹外表谦让，实际上态度强硬。尼米兹向金报告说："有关进攻日本的计划和各项准备工作都未作认真讨论，西南太平洋地区的一行人，显然并未打算讨论这些事。"
当晚，尼米兹在给夫人的信中写道：从清晨西面来的朋友们离开时算起，我度过了难熬的一天。我认为双方均未使对方心悦诚服，至少我们是一无所失，而对方也了解到我方强硬，绝非软弱可欺。相信以后必将进行多次会谈，那时我们也许能获得进展。会谈的确进行了许多次，参谋人员在马尼拉和关岛间飞来飞去。尼米兹认为，将海军与陆军分开是一种消耗部队的愚蠢行动。在处理完一天中令人心烦意乱的各种问题之后，他匆匆给夫人写了一封思绪纷乱的信："……真的，--参谋长联席会议关于把陆军和海军分开的指示，肯定需要作大量工作和费大量口舌，才能使紧密相关的各个领导班子重新发挥作用……如果我的记忆杂乱无章，支离破碎，那完全是由于这些日子处于并非来自日本的沉重压力之下。"
尼米兹在解决统一指挥这个棘手问题的过程中，逐渐认识到统一指挥是有一定限制的--统一取决于局势，取决于担任主官的领导。他再也不提全国范围的武装部队实行统一指挥的问题了。
由于麦克阿瑟拒绝来关岛协商，而他从礼仪规格上又不愿与尼米兹的代表达成最后协议，因此尼米兹于5月15日飞往马尼拉直接同他商谈。麦克阿瑟按正常的礼仪接待了尼米兹，并请他住在他的寓所--巴克拉克官邸。它是这座经过战争洗礼的城市中少数几座未遭破坏、还可居住的房屋之一。在会晤中，尼米兹发现麦克阿瑟还是非常理智的。他们共同签署了以前会议制订的各项计划，并在两天会谈中解决了绝大部分存留的问题，奠定了进攻日本九州、本州及其他岛屿的合作基础。
他们很快否定了关于任何陆军部队不得归海军将领指挥的提法。他们还摒弃了陈旧的英国两栖进攻方案，即设置两名并行全面领导的指挥官，一名陆军将领和一名海军将领；而选用了美国1942年11月进攻北非首次运用的领导体制。按照美国两栖进攻方案，在进攻时，两栖部队由一名军官指挥，首先是一名海军将领，然后是一名陆军将领。进攻九州计划的核心部分，在太平洋舰队司令部兼战区司令部1945年5月19日的一份绝密文件中是这样写的：第5舰队司令将通过太平洋舰队两栖作战部队司令指挥两栖登陆作战，后者依次指挥各攻击部队或大队指挥官，对各自目标进行两栖作战。
各突击师或各独立登陆部队的指挥官在岸上建立指挥机构后，向相应的海军攻击大队指挥官发出准备担任登陆部队指挥的通报，随即指挥陆上各部队。
军长在抵达各自作战地区并建立指挥机构之后……岸上部队应交由军长指挥。
美国陆军第6集团军司令，在向大平洋舰队两栖作战舰队司令宣布他已作好准备承担对登陆部队的指挥时，两栖作战部队应交由第6集团军司令指挥。由于中太平洋的部队日益扩大，尼米兹将军终于能把它分为第5和第3舰队。第5舰队由斯普鲁恩斯将军指挥，通过支援和指挥部队在九州登陆，开始"奥林匹克行动"。这支舰队包括特纳将军的两栖作战部队和弗雷德里克·谢尔曼将军指挥的第58特混舰队的部分快速航空母舰部队。由哈尔西将军指挥的第3舰队，实际上是一个完全独立的组织。它拥有其余的快速航空母舰部队，即第38特混舰队，和番号为第37特混舰队的英国太平洋舰队。第3舰队加上两栖作战部队通过支援和指挥部队在本州登陆，开始"王冠行动"。英国皇家海军罗林斯中将为第37特混舰队司令。麦凯恩将军由于健康不断恶化，第38特混舰队司令将由约翰·H·托尔斯接任。
如果接替麦凯恩的任命按计划下达，杰克·托尔斯终将能获得他渴望已久的作战指挥职务。不过，实际上他是在战斗结束之后才获得这一职务的。尼米兹对托尔斯个人从来没有好感，但他了解这个人有才干，精通业务。而且，托尔斯在任何繁冗的工作中都能兢兢业业，尽忠职守，完成任务。尼米兹推荐他担任航空母舰部队司令，金勉强表示同意。
1945年5月8日德国宣告投降，标志欧洲轴心国的最后失败。太平洋舰队司令部对此无人感到惊异。惟一使人费解的是，德国人居然能坚持这样长的时间。当然，太平洋所有指挥官都为盟国的胜利而欢欣鼓舞，但尼米兹却认为欧洲胜利对他自己的问题，并没有多大作用。如果在一年前，他定会为之欢呼，因为那将意味着可以抽调更多的兵力和空中力量来击败日本。而现在他确信，在盟军部队从欧洲调来之前靠封锁和轰炸，即可迫使日本投降。
尼米兹将军根据一个可靠的情报相信，日本不久即将投降。2月，一位年轻的海军中校弗雷德里克·L·阿什沃思穿着一套咔叽布制服来到太平洋舰队司令部。他十分狼狈，汗水湿透全身，所以拉马尔不愿让他进入内间。阿什沃思是一位海上武器专家，他解释说他刚从美国飞来，很不适应中途岛上这种炎热而潮湿的天气。他迫切地要晋见尼米兹将军。拉马尔忐忑不安地向尼米兹说明了情况，尼米兹同意让那个中校进去。
拉马尔走开后，阿什沃思以一种诡秘的神色看了看周围，使尼米兹笑了起来。接着，阿什沃思解开衬衣，露出一条被汗浸湿了的钱袋，从中抽出一个潮湿而发皱的信封递给将军。尼米兹撕开信封，看见里面的第二个信封上写着"绝密"，他又把它撕开。里面是金将军的一封信。
金将军在信中说，原子弹正在试制，预料其能量相当两万吨梯恩梯炸药。这种炸弹将于1945年8月1日在太平洋战场使用。金指示尼米兹，这封信的内容除一人外不得泄露给参谋部的任何军官，还说，如对这种炸弹的特殊技术有什么问题，可向送信人了解。
尼米兹将军按铃把索克·麦克莫里斯叫来，拿信给他看，然后让阿什沃思也看了信。阿什沃思扼要地介绍了炸弹的技术性问题，但尼米兹似乎不感兴趣。阿什沃思觉察，他心中似乎对一颗炸弹就能毁灭一座城市，全部或者几乎全部杀死居民，有一种畏惧感。
"年轻人，"他说，"这是件很有趣的事，但是8月份离现在还远，我还有仗要打。请你告诉金将军，如果他希望我提供支援，我相信他一定需要我支援，那么我不能遵守他只让一个军官知道的要求。你告诉他，我必须让我的战备军官汤姆·希尔上校知道这件事，他有责任去检查是否提供了所需的支援。"
尼米兹在座椅中转过身来注视着窗外，然后站起来对阿什沃思说："非常感谢你。"并轻声地，好像自言自语地说："我想，我是生不逢时，出世太早。"
阿什沃思中校接着到了马里亚纳群岛，去为第509特混大队的B-29型轰炸机找一块适于飞往日本投掷原子弹的地方。他选择了提尼安岛西北角。随即在那里铺设了长长的跑道，运来了B-29型轰炸机，架起了半圆形的活动房屋，并在新基地周围架设起铁丝网进行严密警戒。第509特混大队的军官们，在犹他州和古巴经过紧张演习后，于6月27日到达那里并继续进行训练。第509特混大队以后的活动只是飞到海上去，又立即返回基地，使驻在提尼安岛的其他B一29型轰炸机的飞行员迷惑不解和感到气愤，因为他们总是冒着生命危险去轰炸日本和在日本海布雷。
在1945年大忙的春季里，热衷于宣传的海军部长决定，太平洋舰队总部应出版一种日报，或者至少要出版一种太平洋舰队的杂志。尼米兹认为，他拥有一个良好的发布新闻的宣传班子，可以担负这一工作。但是他说："当我们在忙于打仗的时候，出版发行以及其他工作确实太重，何况我们每天都有报纸、广播和大量的杂志。"甚至前线地区还有缩印的国外版《时代》和《新闻周刊》杂志，尼米兹无心与他们竞争。
"战争中的宣传出版战线日益扩大，"尼米兹说，"它几乎使作战战线黯然失色。"福雷斯特尔部长越坚持要尼米兹抓宣传出版工作，将军越不愿干，甚至不闻不问。部长最后只好放弃，并认为可能除厄内·金外，尼米兹是他不得不与之打交道的最顽固的军官。
哈普·阿诺德将军有一次来太平洋视察时，准备解决尼米兹出名的固执看法。陆军航空兵，包括李梅将军的第21轰炸机部队在内，一直向阿诺德抱怨太平洋舰队总司令在他们的前进道路上设置不必要的重重障碍。阿诺德怒气冲冲走进太平洋舰队司令部，向尼米兹重复了这些抱怨。尼米兹洗耳恭听，并欣然同意将军提出的各项改革。
"这次同尼米兹将军商谈后，"阿诺德后来写道，"我终于明白，航空兵的大多数问题、困难以及纠葛，都是由于下级军官把某些枝节问题加以扩大，而说成为了不得的事件。无论从哪方面来说，我应该把他们集合起来谈谈。"阿诺德同其他许多军官一样，了解尼米兹只是在反对不合理、浪费时间或者不公允的问题上态度顽固。
1945年春夏，关岛的工作多而且杂。不仅是由于要把陆军和海军的各级指挥部分开，而且由于来访者源源不断。他们大多是应海军部长邀请或是以他的名义来访的文职人员。议员、工会领袖、出版家、国防企业的经理--似乎任何人都有办法打通关系找一个不着边际的理由去访问前沿阵地，与高级军官会谈，然后又想办法回去。这项任务，都是由太平洋舰队司令部新闻发布官和他的助手们负责迎来送往，安排日程。但是，尼米兹本人要会见他们中的大多数人，并请许多人吃饭。
来关岛作客的议员中，有尼米兹在得克萨斯州的邻居林登·B·约翰逊。出版家中，有弗吉尼亚州里士满市《新闻导报》的编辑道格拉斯·索撒尔·弗里曼。尼米兹乐于与弗里曼结交，因为他最近读过并欣赏他写的四卷R·E·李将军的传记。
其他军官们认为这些浪费时间的客人是一帮十足令人讨厌的人，所以对他们很冷淡。一些客人把受到的这种冷遇反映给福雷斯特尔，福雷斯特尔转告金后，金给尼米兹写了一封信，说"去你地区访问的知名人士还将增加，对他们应以礼相待。至要。"
当金刚把这份温和的劝告寄出去以后，马上又听到海军部长又一次措词更尖锐的批评。这次无礼冒犯客人的是关岛两位以脾气暴躁著称的军官索克·麦克莫里斯和外号"温和的约翰"胡佛。金火速向尼米兹发出一份备忘录："海军部长认为，胡佛与麦克莫里斯应尽可能地不与"客人"接触--除非给他们训斥--理应"受到"训斥！"