投资建议书从众多备选项目中脱颖而出后，将会面临风险投资家们更为苛刻、更为严格的评估阶段。在本阶段，通常风险投资公司在评估投资项目时，会把重点放在财务分析和物质保证方面。投资收益或净现值（NPV）是投资项目取舍的关键因素，其本质就是尽量减少投资风险，保证投入资金与收益的安全回收。
一、投资成本评估是核心
风险投资家们开展财务分析的核心内容就是对投资成本的评估。由于风险投资的成功率不高，投资家们就需要极为谨慎地计算为发展风险企业所需的成本。计算的依据不仅是创业者提交的商业计划书，更重要的是风险投资家们的经验和专业知识。他们计算企业的财务预算，往往是要预算三至五年或更长。他们需要知道一个新起步的公司由亏损转盈利所需的总资本，他们还必须明确这个公司大概要花几年时间才可扭亏转盈。而这样一个过程，通常IT产业需要三至五年的时间，而生物企业则需要更长一些时间。风险投资家还要评估未来十年后的公司收入和利润，从而判断他们投资收益的目标是否能够达成。这项评估是深入、复杂且耗时的，评估结果将决定是否投资、如何投资以及投资多少。此过程往往由风险投资家或外聘专家组成的评估小组进行，评估小组一般会包括会计师和律师在内。
二、投资分析报告是成果
评估小组经过全面评估之后，会形成一份详细的投资价值分析报告。投资价值分析报告是国际投、融资领域投资商确定项目投资与否的重要依据，主要对项目背景、宏观环境、微观环境、相关产业、地理位置、资源和能力、市场详细情况、销售策略、财务详细评价、项目价值估算等进行分析研究，反映项目各项经济指标，得出科学、客观的结论。投资价值分析报告在全面系统分析目标企业和项目的基础上，使用国际通行的企业价值评估方法，站在第三方角度客观公正地对企业、项目的投资价值进行分析。不仅为融投资双方充分认识投资项目的投资价值与风险，更重要的是通过充分评估项目优势、资源，加速企业或项目法人拥有的人才、技术、市场、项目经营权等无形资产与有形资本的有机融合，对企业和投资机构提供重要的融投资决策参考依据。
三、风险投资评估体系是保障
风险投资家面对每年数以百件的项目书，没有一套严谨有效的投资评估体系是难以做出最适当的投资决策的。针对越来越专业化的高科技项目，只有事前充分的信息搜集和审慎的研究评估，才能预测可能出现的风险，事先防范，将投资风险度降低。经过几十年的发展，目前国外风险投资运作已经相当完善，特别是在风险评估方面，进行了大量的案例研究和实证分析，理论较为成熟，对我国的风险投资项目评估有重要的参考与借鉴意义。随着我国风险投资业的风生水起，不管是行业内还是学术界都对风险投资理论给予了高度重视。吉林大学、清华大学等多所高校已开展有关的课题研究。但目前的研究多涉及宏观层面，对微观层面的问题涉及不多，主要集中于风险投资的“为什么要做”，而不是“要怎么做”。目前，我国风险投资的主力是政府主导的风险投资公司，在项目选择评估中更侧重于项目的技术先进性，往往忽视市场前景和产业发展，缺乏复合型风险投资专业人才。因此，我们非常有必要结合国外的风险投资评估模式和我国实践中取得的企业孵化与风险投资经验，总结并创新，建立中国特色的风险投资评估体系。