在古埃及的典籍里，法老咒语“显灵”的记载比比皆是，而它之所以神秘，是在一些死亡事件上往往笼罩着令人毛骨悚然的恐怖气氛，对此，科学家、学者众说纷纭。其中有几种猜测似乎比较合理。
病菌说：开罗大学生物系教授阿扎丁·塔哈在1962年11月3日的记者招待会上宣称他找到了法老咒语的秘密。他说，那些接受过他的身体检查的考古学家和工作人员只是在陵墓中感染细菌得病去世的，因为那些细菌在陵墓中生存了3000～4000年，所以让现代医学有些措手不及。这位教授的观点得到了很多科学家的赞同。
但不幸的是，记者招待会后不久，塔哈在开罗到苏伊士的公路上，发生车祸去世。尸体解剖证明是心脏病突发，而许多人联想到是法老的咒语。
“真菌说”：联邦德国格平根的研究人员在电子显微镜下发现一种杀人真菌。一旦墓被锯开，真菌就会粘在挖墓人的身上，通过人的器官侵入，引起一种致命的癌症。
“毒物说”：埃及的法老中不乏毒物专家，第一王朝的第一位国王美那就是种植毒作物的能手。法老用毒物来保护陵寝也更实际。毒物并不一定是从口而入，也可以通过皮肤。法老陵墓的壁画就用含有砒霜等剧毒的颜料。普通的毒药在空气和阳光的作用下，几年内毒性就会消失，而剧毒可以维持几百年，若放在密不透风的墓穴里，则能维持更长的时间，但会不会几千年聚集不散呢？
“放射物质说或超能量物质说”：科学家们认为陵墓本身或是陵墓附近有放射性物质的存在，比如说铀矿。埃及中部发现的含铀矿石也可以证明这些说法。或是法老陪葬的物品有放射性的物品，含有一种现代人未知的能量，致人于死地。
种种说法都未能揭开“法老咒语”的真正秘密。