日俄战争爆发后，列强各国不仅各怀目的，宣布中立，而且还求中国政府也与他们一道，对这场在自己国土上展开的战争不闻不问，保持中立。
早在战争爆发的一个月之前，日本政府就向清政府表明：如果本国与俄国谈判破裂，不仅不愿意其他国家参与，同时也希望中国政府在战争中保持中立，以免其他国家有所借口，横生枝节。并告诫清政府：贵国内地须自固守，勿使变乱。英国人对于日本人的这种做法表示支持。美国人也于2月10日，采纳德国人的主意，自行出面向清政府和日本及俄国发出照会，要求交战国双方在战争中“尊重中国的中立”，并要求清政府为之划定一块战区，企图使之局部化，以使列强各国在华权益不受这场战争的波及。20日，它又以同样的内容照会其他《辛丑条约》的签字国。
日本和俄国关于东三省的谈判，虽然关系到中国的切身利益，但是对中国政府却从来都是保密的。现在战争已然打起来了，清政府不敢、同时也确实无力阻止这场战争在中国的国土上打起来。列强各国为清政府提出的中立路线，它也只得接受。于是2月12日，清政府以光绪皇帝的名义发布上谕，宣布：“现在日俄两国，失和用兵，朝廷轸念彼此均系友邦，应按局外中立之例办理。”同一天，外务部也通电声明：把吉林、黑龙江两省之全部及奉天大部划在中立区之外，留作日本和俄国战争的战场。把东三省之地任由日俄两国的铁蹄践踏。
战争打到1905年的5月间，局势已经明朗，俄国人败局已定，同时也已经把中国的东三省打得遍地弹痕，满目狼烟；人民流离失所，国土黯然无色。日俄双方这时再也无力继续打下去了，其他列强也希望早日恢复远东地区的和平。于是6月，由美国总统罗斯福出面，进行调停，为两国所接受。8月9日，议和谈判在美国的朴茨茅斯开始。
清政府得知日俄两国媾和的消息后，深恐他们在谈判时对中国东三省地区进行瓜分，于是在谈判开始前分别向两国政府照会，声称“此次日俄战争曾在中国疆土用武，现在议和条款内，倘有牵涉中国事件，凡此次未经与中国商定者，一概不能承认”。
但是，日俄议和实际上就是双方要根据各自在战争中的胜与败，重新确立自己在中国东三省地区的地位和利益，对于中国政府的合理要求，日俄两国都没有予以理睬。在谈判期间，同样没有与清政府进行商议，即擅自在关于中国东三省地区的问题上达成了妥协。
1905年9月5日，日俄两国签订《朴茨茅斯条约》，计正约十五款，附约两款。其中涉及到中国主权的内容主要有：
一、俄国将包括旅顺口、大连湾在内的辽东半岛租借地，及附属的一切公共财物，让与日本；
二、俄国将从长春到旅顺口的铁路及其一切支线，铁路区域内所附属的一切权益、财产让与日本；
三、两国在东三省各自经营的铁路，只限于工商业用，不得用于军事目的，但辽东半岛租借地内的铁路不在此限；
四、以十八月为限，日俄两国军队同时撤出满洲，同时，为了保卫各自的铁路，可留驻守备兵，每公里不超过十五名。
此外，条约还规定：俄国以北纬50度为界，将库页岛的南半部及附近的一切岛屿割让与日本，俄国政府还承认日本在朝鲜享有政治、军事、经济上的特殊权益等等。这样，日俄战争以俄国的失败和日本的胜利而告终。
但是，日本从俄国人那里私相承受下来的诸种特权，必须经过清政府的同意后才能生效。于是在与俄国人谈判结束之后，日本人转过身来即向清政府施加压力，逼使它允以承认，以使得自己从俄国人手中夺得的权益合法化。同时，它不仅仅是要迫使清政府承认在《朴茨茅斯条约》中从俄国人手中承受下来的权益，而且更要借此时机，从中国攫取新的特权。从1905年11月17日开始，小村寿太郎特意来华，与奕勖、袁世凯等人进行长达五个星期的谈判，并于12月22日签订了中日《会议东三省事宜下约及附约》。条约中规定：清政府将俄国按照《朴茨茅斯条约》之规定所转让与日本的一切权利，一概照允。在附约中，日本又从清政府手中攫得一系列新的特权，主要有：
一、在日俄撤军之后，清政府须从速将奉天的凤凰城、辽阳、新民等地牛六处开为商埠；
二、战争期间日本所修之铁路，由日本在1908年之前加以改良，仍由日本经营到1923年，届期估价卖与中国；
三、设立一个中日木植公司，在鸭绿江右岸采伐木植；
四、中朝交界的陆路通商，彼此应按照相待最优国之例办理。
这样，东三省大地，经过了一场浩劫之后，仍然没有逃出魔爪；东三省的广大人民，从此更遭到日本侵略者的肆意蹂躏。中国的领土完整和主权独立，再一次遭到侵略者的无情践踏。