日趋严重的瓜岛战事，使美国军队的士气十分低落。美军占领的亨德森机场在日军的猛烈攻击下，也受到严重破坏，已陷入瘫痪状态。
为了扭转战局，尼米兹亲自前往太平洋视察，之后便决定将南太平洋地区的三军指挥权交给哈尔西。当尼米兹的手令送到哈尔西的手里时，哈尔西正前往南太平洋访问。哈尔西接过任命，不无惊讶地说：“耶稣基督和杰克逊将军：这是他们交给我的最热的番薯！”
他发出这样的感慨不仅因为他从来没有指挥过陆军，也没有指挥过任何一支盟军，更因为他接替的是他40年的老友——戈姆利中将。尽管如此，他还是坚决地执行尼米兹的命令。
哈尔西接过指挥权之后，很快组织了美国军事史上的第一个真正的三军联合指挥部，迅速展开了对三军协同作战的指挥。
他首先召见了手下的陆、海、空三军首长，并询问他们是准备撤退还是苦撑下去。地面指挥官告诉他，只要能够比过去获得更多的海上支援，他可以撑下去。哈尔西对此肯定地回答：“我答应给你我所能获得的一切东西。”
哈尔西是实践者，他的行动比言语更积极。他到处收集不能使用的旧船只，拆卸武器和零件来补充已经受损的舰艇。为了确切地掌握瓜岛的实际情况，哈尔西冒着巨大的风险亲自前往该岛视察、部署兵力和研究对策。这是他的前任从来没有做过的事。他的到来使前线的美国官兵兴奋不已。
1942年10月23日，日本正准备从陆、海、空同时向防守亨德森机场的美军发起进攻。哈尔西从侦察机报告的情况中分析出：日军总攻即将发动。在研究对策的最高司令官会议上，地面指挥官反复强调，必须给予强有力的支援。哈尔西肯定地回答：“我会把我的全部家底统统调给你的。”在哈尔西许诺后，地面指挥官放心地返回了阵地。
10月24日，日军总攻开始。哈尔西立即投入一支由2艘航空母舰为核心的舰队，用来对抗中途岛海战以来最强大的日军舰队。
10月26日，哈尔西所辖的第十六特混舰队和第十七特混舰队与日本联合舰队在圣克鲁斯岛海域交战，美国海军遭到战术性失利，损失1艘航空母舰和74架飞机，日本则有2艘航空母舰受创共损失100架飞机。
趁日本联合舰队撤回特鲁克岛接受补给的机会，哈尔西加紧为海军陆战队赶运增援力量。哈尔西视瓜岛战役为南太平洋战区战役的关键，于11月8日飞抵该岛的亨德森机场视察，鼓舞守军。
11月14日，美国海军在哈尔西指挥下向日本运输舰队发起反击。次日，在瓜岛海域的战列舰交战中，日军损失2艘战列舰、1艘重型巡洋舰、3艘驱逐舰、11艘运输舰和数十架飞机。损失惨重的日本联合舰队再也不愿支援陆军作战。1943年2月，瓜岛日军被迫撤离。
得到消息的哈尔西满怀喜悦，立即向尼米兹发出了捷报。为了庆祝美军的胜利，美国总统罗斯福、海军部长诺克斯·金和尼米兹纷纷发来贺电。
哈尔西立刻向那些实际战斗人员转达，并在贺电中添上一句结束语：“向战斗中光荣牺牲的人们致敬，愿这些英灵魂归天堂！”
鉴于哈尔西在瓜岛的卓越战功，罗斯福总统建议，打破美国海军只有4位上将的惯例，将哈尔西提升为四星上将。
瓜岛的胜利极大地鼓舞了美军的士气，打破了日本人不可战胜的神话，所以将哈尔西晋升为四星上将绝对是众望所归。