随着源源不断地获得全球种群基因组数所，科学家对人种差别的理解也日趋深化。人类本来同种，科学家称作“标志物”的种族差异只是由文化和地理上的长期隔绝造成的。这类变异除了提供种族起源的线索，大都无关宏旨，其他的东西抑或才是要端，譬如说，有些基因会导致威胁生命的疾病。这些知识使基因组研究步上新途，也有人说是险途。对种族知识潜能的利用以及误用，是科学家殷殷关切的问题。基因资料可能会使人质疑自己的身份和种群类属。基因揭示的物质事实并不是总能够与我们对自己的感觉一致。
先前大家对种族图谱有所担忧，作为回应，人类基因组计划的科学家煞费苦心，把种族差异说得无关紧要。基因排序显示，人类在99.9％的程度上是一样的，这个数字被用来增进全球和睦的呼声。在白宫庆祝基因组完成的典礼上，人类基因组计划的带头人弗朗西斯·柯林斯说：“种族的观念没有基因或科学的基础。”
然而，在这0.1％的差异上正酝酿着诸多争议，越来越多的科学家想利用这些资料为恶性疾病找到疗方法。他们称，如果我们对导致白种人易患胆囊纤维化或者黑种人易患镰状细胞性贫血的基因了解更多的话，这些疾病的治疗方法就会更容易找到。宾夕法尼亚州立大学的人类学家马克·施赖弗说：“血统对生物医学研究至关重要。”
但是，也有人预见了这种思路的严重危险。