进行双孢菇水分管理的原则是：结菇水要狠，出菇水要稳，转潮水要准，维持水要常，同时不打关门水。水分管理的注意事项如下：
（1）看菌株喷水。贴生型菌株耐湿性强，出菇密，需水量大，同等条件下，喷水量比气生型菌株多。
（2）看气候喷水。晴朗干燥天气，菇房喷水量要多；阴雨潮湿天气，要停水或少喷水。
（3）看气温喷水。气温适宜时应多喷水，气温偏高或偏低时，要少喷水、不喷水或择时喷水。例如，土层调水期间，遇到22℃以上的高温时，喷水应在晚间或清晨凉爽时进行；气温在10℃以下时，则应在中午或午后气温较高时喷水。
（4）看菇房保湿性能喷水。菇房漏气严重，保湿性能不好，要多喷水，少通风；反之，喷水量要适当减少，通风量增多。
（5）看土层持水力喷水。覆土材料偏干，黏性小，沙性重，持水性差，喷水次数和喷水量都要增多；覆土材料偏湿，持水性好，或采用河泥砻糠覆土时，应采用轻喷、勤喷方法，且喷水量要小。
（6）看土层厚度喷水。覆土层较厚，可间歇重喷；覆土层较薄，应分次轻喷。
（7）看菌丝强弱喷水。覆土层和培养料中的菌丝生长旺盛，要多喷水，其中结菇水、出菇水或转潮水要重喷；反之，菌丝生长细弱无力，要少喷、轻喷。
（8）看菇体多少和大小喷水。出菇高峰期，床面菇多而大，吸水量大，水分蒸发、消耗多，喷水量也要相应增加；如果床面菇少而小或进入产菇后期，喷水量则要相应减少，必要时见菇再喷水。
（9）看菌床所处位置喷水。床架下层和靠近门窗处的菌床，由于通风条件好，水分散失快，应多喷水；床架上层和菇房四角靠边的菌床，通风条件较差，水分散失慢，应少喷水。