运输时间需半天或更长时间的，尤其在天气炎热和中程运输时，必须采用降温运输方法。
（1）带水降温运输。一般用鱼桶装水加冰块装运，6千克水可装运泥鳅8千克。运输时将冰块放入网袋内，再将其吊在桶盖上，使冰水慢慢滴入容器内，以达到降温目的。此法运输成活率较高，鱼体也不易受伤，一般在12小时内可保证安全。水温在15℃左右，运输时间在5～6小时效果较好。
（2）鱼筐降温运输。鱼筐的材料、形状和规格参见第64个问题。
每筐装成鳅15～20千克。装好的鱼筐套叠4～5个，最上面一筐装泥鳅少一些，其中盛放用麻布包好的碎冰块10～20千克。将几个鱼筐叠齐捆紧即可装运。注意避免鱼筐之间互相挤压。
（3）箱运法。箱用木板制做，木箱的结构有三层，上层为放冰的冰箱，中层为装泥鳅的鳅箱，下层为底盘。箱体规格为50厘米×35厘米×80厘米，箱底和四周钉铺20目的聚乙烯网布。如水温在20℃以上时，先在上层的冰箱里装满冰块，让融化后的冰水慢慢滴入鳅箱。每层鳅箱装泥鳅10～15千克。再将这两个箱子与底盘一道扎紧，即可运输。这种运输方法适合于中、短途运输，运输时间在30小时以内的，成活率在90%以上。
（4）低温休眠法运输。此法是把鲜活的泥鳅置于5℃左右的低温环境之中，使之保持休眠状态的运输方法。一般采用冷藏车控温保温运输，适合于长距离的远程运输。