植被按起源可划分为天然植被和人工植被。
天然植被共划分10个一级分类单位，17个二级分类单位和40个三级分类单位。
究其起源，绝大部分是经人工造林逐渐发展形成的，因而林相比较单纯，组成结构单一，群落中除有少量阔叶林和杉木、柏木等针叶树外，绝大部分为黑松、马尾松组成的纯林。此外，在村前屋后、路边沟旁有少量水杉、池杉、落羽杉、罗汉松等针叶树种分布，但不构成林份。黑松和马尾松为海岛上分布最普遍、生长最旺盛的树种，构成海岛植被的主体。但由于各种原因，林木生长缓慢、矮小、扭曲，且病虫危害时有发生，顶端枯死现象普遍，林木通直度差，森林生产力低。虽然林分密度大，郁闭度高。林下植被以草本层占优势，灌木和更新树种少。
针叶林下属一个二级分类单位，即常绿针叶林。各主要海岛有分布，面积大，但生长有差异。下属两个群系，即马尾松林和黑松林。
一、马尾松林
马尾松林大多为人工造林后自然发展起来的，由于生境条件差，林分年龄不同，群落特征差异大。从组成看，有的林分中混有较多的黑松，有的则混有较多的枫香，有的则混有少量朴树、榔树，有的则混有黑荆树、桉树、台湾相思树，有的则混有杨梅、青皮竹等。从外貌看，马尾松林终年常绿，季相变化不明显，在较好的立地上林木生长旺盛，枝叶繁茂，郁闭度高，树干通直高大、年高生长可达60厘米，林下土壤深厚较肥活，树冠较大，多为尖塔形或圆锥形。在较差的立地上，马尾松生长缓慢，矮小、扭曲、树冠小，盖度低、林下土层薄，较干燥，多裸岩，肥力差，马尾松年生长量小，树冠狭小。从林层结构上看，有的林分乔木层、灌木层、草本层。分层明显，有的则仅有乔本层和草本层，灌木层发育不明显。有的林分由于年龄小、立地差、层次分化不明显。在乔木层中大部分可分为两个亚层。从年龄结构上看，马尾松林在北部岛屿分布较为集中，南部岛屿相对较分散。从分布坡位看，立地条件较好的山坡中下部，马尾松林分布较多。从生长状况看，一般山岙、山麓的马尾松林生长较好，山脊、山顶及山坡中上部生长较差。
二、黑松林
黑松耐瘠薄、抗风抗旱能力强，适应性广，生命力强，是海岛绿化的先锋树种和主栽树种，无论土层厚薄，肥力高低、裸岩多少均能生长。
对美化自然景观，改善生态环境，保持水土，涵养水源、改良土壤及减轻自然灾害等具重要意义。
由于立地条件、林分年龄差异较大，生长状况很不一致，有的密度大、郁闭度高，生长旺盛，林相整齐；有的生长稀疏、郁闭度小、生长差、林相参差不一。
由于生境条件差，一般树种难以生长，因而黑松林的树种组成十分单一，纯度很高；但在局部立地条件好的地段，黑松林中常混有少量木麻黄、黑荆树、杨梅、桉树、青冈栎等树种。
由于黑松树冠小，所以林分密度较大，但郁闭度却差异很大，有的林分郁闭度较高，林下灌木、草本植物较少，有的林分郁闭度很小，林下灌木、草本较发达，有的林分林相整齐，分化较小，有的林分林木分化较大，高度参差不一。
由于黑松林分布的立地条件普遍较差，生长缓慢，所以黑松林下植被以草本层为主，灌木层不发达，草本植物种类较多，盖度较大。灌木层种类少，生长稀疏、盖度小。