抗生素类不仅只对细菌有抑制和杀灭的作用，而且对一些病毒引起的疾病也有一定的作用（如四环素族抗生素、氯霉素，但它们对肝炎是无效的）。它们还对一些原虫引起的疾病有效，如青霉素用于治疗梅毒。有些抗生素对真菌（霉菌）引起的疾病也有很好的作用，如制霉菌素、灰黄霉素、二性霉素B。更值得注意的是，有些抗生素对有些癌症有较好的治疗作用，例如博来霉素、丝裂霉素、阿霉素等。
抗生素不仅仅用于治疗人类的疾病，也用来治疗动物、家禽、家畜的疾病。用于动物疾病的治疗药物即兽用药与人用药在药品的质量上有所不同。一些抗生素可以作为家禽、家畜饲料的添加剂，以促进动物的生长，提高饲料的利用率，提高产蛋、产肉率，例如金霉素、土霉素、红霉素、青霉素等。抗生素工业产生的大量废料，例如发酵后过滤出来的滤渣，主要是菌丝体和剩余的培养基（淀粉、豆饼、棉子饼等），可以作为家畜的饲料。其中除了含有家畜所需要的营养物质外，还含有少量未分离出去的抗生素。这种废料是很好的饲料，这样综合利用是互相有利的事情。
化学合成杀虫剂会造成环境污染，影响生态平衡。例如DDT是一种有效的杀虫剂，但它可以在植物体内积蓄，因为它比较稳定，不易被分解、破坏。因此人或动物吃了用DDT喷洒过的农作物、蔬菜、水果后，会导致中毒。例如鸟类若吃了这种谷物，则会影响到蛋壳碳酸钙的沉积量，使鸟蛋易碎而不能繁殖。因此，一些不易分解（降解）的杀虫药已被禁止使用。就是那些不易在植物体内积存，易于降解的农药，也在收获前相当长的一段时间内不能使用，特别是蔬菜、水果。有些抗生素可以有杀虫、杀螨的作用，例如四活菌素、尼可霉素。皮欧霉素有杀灭真菌的作用，因此常用于蔬菜和水果的病害防治。此外，在日本用春日霉素、有效霉素防治水稻瘟病。
抗生素的用途是多方面的，它们神通广大，对于人类是一大类非常重要的物质。抗生素还在不断地发展，近些年又发现了不少疗效更好的抗生素，有兴趣的读者可以参看有关抗生素的专门著作，这里就不多介绍了。