果汁的营养与水果有相当大的差距，果汁不能完全代替水果。首先，果汁里基本不含水果中的纤维素；第二，在捣碎和压榨的过程使水果中的某些易氧化的维生素被破坏；第三，水果中营养成分（例如纤维素）的缺失会对整体营养作用产生不利的影响；第四，在果汁生产的过程中一些添加物影响到果汁的营养质量，如甜味剂、防腐剂、使果汁清亮的凝固剂、防止果汁变色的添加剂等；第五，加热的灭菌方法也会使水果的营养成分受损。
