养猪场每天有许多粪尿和污水需要处理。处理得当，变废为宝；若处理不当，则会破坏生态环境，造成环境污染。
（1）粪尿的处理利用主要包括如下方面：①粪尿与垫料直接用作肥料，一般不经处理，水冲洗粪后经初步沉淀，分离后即用作肥料。②将收集的粪尿以适当比例与水混合，先用以发酵产生沼气，之后再把残渣作肥料。
（2）污水的处理。利用舍内污水经过沉淀、分离，固体残渣作堆肥，液体部分经过处理，如利用厌氧发酵池产生沼气，使生产需氧量降低之后，排入农田；或再经过澄清消毒，重复做清洗猪栏用水。
研究结果表明，猪粪尿先生产沼气，然后再将残渣施于田间是目前最有益、最合算的处理方法，且能取得一定的效益。