淡全蝎又叫清水蝎，加工工序与咸全蝎相同。只是食盐加入很少，为咸全蝎用盐量的20％以下，或不用盐。加工前，把采收到的蝎子放入清水中浸泡1小时左右，同时轻轻搅动，洗掉蝎子身上的污物，并使蝎子排出粪便。捞出后放入沸水中用旺火煮30分钟左右（锅内的水以浸没蝎子为宜）。出锅后，放在席上或盆内晾干（晒干亦可）。煮蝎时间不可过长，以免破坏蝎体的有效药用成分。
淡全蝎和咸全蝎各有优缺点：咸全蝎在湿热的夏季便会变得湿漉漉的，返卤起盐，但有不易遭受虫蛀、发霉等优点；淡全蝎不会返卤，形态较为完整。但易受虫蛀或发霉，干时碰压易碎，不易贮存。近年来采用此法的人减少。但是优质的淡全蝎体轻、质脆、气腥、味咸、颜色正，新货有光泽，虫体完整，大小均匀，不返卤，不含盐粒和泥沙等杂质。有的人认为，从药效来看，淡水蝎比咸水蝎好。