在临床上，种公猪的繁殖障碍主要表现为性欲减退或缺乏、不能交配、不能繁殖、阴囊炎和睾丸炎。
要有专为公猪用的配合饲料，建立配种制度。对于性欲不强、射精不足的公猪，精液严禁使用。对于缺乏性欲的种公猪可一次皮下或肌肉注射甲基睾丸酮。对于性欲、精液正常的种公猪虽不能交配，可采集其精液进行人工授精，对先天性不能交配的猪应予淘汰。对因外伤等原因不能进行交配者经治疗仍不能交配的也要淘汰。肺炎和睾丸炎患猪可先进行治疗，早期可恢复。若转为慢性而丧失生殖能力要予以淘汰。加强饲养管理，让公猪多运动。同时要按规定时间用相关疫苗免疫。