乡村生态旅游经营管理直接决定着乡村生态旅游企业的效益。
乡村生态旅游作为解决“三农问题”的手段之一，在现阶段来说其经济效益是首要目标。要使乡村生态旅游的经济效益最大，就必须在经营管理上下功夫。只有有效实施计划、组织、领导、指挥、监督和控制等环节，才能使人力、物力、财力达到有效的统一，才能获得旅游产业的最佳效益。
乡村生态旅游经营管理有助于解决和协调乡村生态旅游发展中的各种矛盾。
乡村生态旅游前后项产业联系紧密，产业链长，涉及范围广，人际关系复杂。需要处理好与农业、交通运输业、乡镇企业、小城镇建设等各项事业之问的关系，同时，还要协调旅游者与经营者、经营者与经营者、经营者与当地居民、当地居民与旅游者之间复杂的关系。乡村生态旅游经营实体要想增强自己的竞争实力，赢得市场，就必须在注重硬件建设的同时，提高管理水平，处理好各种矛盾，这样才能获得乡村生态旅游持续、稳定的发展。
乡村生态旅游经营管理有利于乡村生态旅游资源的有效利用与合理配置。
伴随着乡村生态旅游市场的形成与发展，必然带动人流、物流、资金流、信息流在城乡之间的融汇，起到加速农村市场发育和拓展的作用。然而，对于一个人均资源相对贫乏的发展中国家来说，如果在乡村生态旅游的开发中缺少对生态环境营建和对传统文化保护的理念，难免会出现新一轮的“开发区”热，出现一开发就造成破坏的现象。只有通过有效的经营管理手段，按照国家相关法律、法规进行物力、财力和人力的生产布局，才能实现循环经济的发展模式。