阿瑞德曼对NUAD病毒的出现心存疑惑，决定独自追查——这让本就心虚的防卫部更加害怕了……如若阿瑞德曼真的顺着这条线索一直查下去，就必然会了解到防卫部的“Ultra计划”和他妻儿的死亡真相。
当时的防卫部并不希望树立阿瑞德曼这样的强敌，他们派人多次试探口风，并尝试开导他放下对妻儿的执念。
[阿瑞德曼视角]
尚且不知妻儿已死的阿瑞德曼只当这是地球人给予他的安慰
——他毫不掩饰的向那些前来试探口风的防卫队队员吐露了自己的心声：
阿瑞德曼表示自己被囚于暗黑星域之时才想明白自己最想珍惜的是什么……当初之所以奋不顾身不顾违背“正义法则”也要的维护地球，是因为地球上有最为珍视的人
——自己的妻儿便是自己心灵的寄托，因为地球上有他们，所以地球便成了自己的归属，有了自己的家……自己也早已把自己当做是一个地球人
——自己深爱着地球，而这份“深爱”是因为地球上有着令自己时刻牵挂的人和那些令自己无比幸福的回忆……因为这份“爱”，所以自己当初才会那样义无反顾。
[防卫部视角]
防卫队队员将阿瑞德曼的原话复述给了防卫部高层——当他们了解到阿瑞德曼的妻儿在他心中已占据了无比重要的位置的时候，他们的内心也十分忐忑。
防卫部其实很希望阿瑞德曼能像从前那样用他那强大的力量来守护地球
——但如果被阿瑞德曼知道他的妻儿早已死在防卫队之手……只怕他不仅不会再像从前那般热爱地球，反而还会为他的妻儿报仇。
虽然阿瑞德曼就算真的要复仇也未必会对地球做出什么过分的事情
——但他必定不会原谅那些曾经下令处死他妻儿的防卫部高层。
就在防卫部高层感到苦恼的时候，关于NUAD的研究已经有了初步进展：
由于研究人员发现NUAD病毒的感染者全都是参与过“Ultra计划”的志愿者，所以他们便找来没有参与过“Ultra计划”的普通市民来进行感染性测试，发现这种病毒对普通市民的感染概率为零。
换而言之，这是一种基因针对性极强的病毒
——只有那些在“Ultra计划”中接受过基因改造的志愿者们才容易受到感染……而且基因改造越是成功的Ultra志愿者，死亡率就越高
——基本可以断定，这种病毒所针对的对象，就是Ultra战士。
防卫部高层决定秘密启动NUAD的生化研究计划……说是要为人类留下足以防范Ultra战士的后手
——其实细想也不难猜到，在NUAD研究计划的启动资料上安加的那些对Ultra战士“莫须有”的臆测，必然的掺杂了不少高层人员的私心……他们最担心的不是Ultra战士对地球不利，而是担心有朝一日阿瑞德曼知道真相后会对他们那些高层人员不利
——高层人员是为了让他们这种“假公济私”做法看起来合情合理，才加上了那些冠冕堂皇的理由。
然而，随着时间的推移，Ultra计划中所收集来的那些精神能量的贮存之地还是被阿瑞德曼发现了
——眼看阿瑞德曼距离当年的真相越来越近，防卫部高层人员也越来越害怕
——最终，那些防卫部高层为了维护他们自己的利益和安全，竟然下令利用NUAD来对付阿瑞德曼。
可是防卫部的决定终究还是害人害己：
防卫部的高层人员满心以为将NUAD作为生化武器投放后只会让身为Ultra战士的阿瑞德曼受到感染，却万万没有料到广崎市的市民们竟然也遭到了波及。
[解说视角]
由于过去的那么多年里面防卫部进行“Ultra计划”时所收集来的精神能量一直全部贮存于广崎市地底
——所以长期居住在广崎市的市民们，在那些精神能量的长期影响下已有部分居民的基因序列发生了细微的改变
——也就是，广崎市的常住居民中，其实还存在着不少不同于其他城市居民的“特例”。
然而，在防卫部启动研究NUAD之时，为了不让当时居住在广崎市的阿瑞德曼发现端倪，而刻意避开了广崎市……原本的研究基地也已从广崎市市内迁移到了远离广崎市的其他城市
——所以当时参与NUAD感染性测试的志愿者们也都并非广崎市的长住居民……这才让他们没能发现广崎市市民中所存在的“特例”。
[叙述视角]
如果NUAD只是在广崎市内那些“个例”之间传播也就罢了，可偏偏那些还贮存于广崎市地底的精神能量，导致NUAD迅速变异
——原本不易被NUAD所感染的普通民众，也变成了NUAD变异体的易感人群。
人群的聚集和流动让病毒迅速的传播和扩散——事情变得一发不可收拾……
再后来，便是像阿克斯所描述的那样，防卫部决定用导弹毁灭广崎市——抹杀那些感染者，同时也想要毁掉那些导致病毒疯狂变异的精神能量……
【回述毕|现实中】
在“黑匣子”所记录的那段“录音”的末端，是研究室外面无数人慌乱的尖叫，但却终究没有导弹炸毁地面时的爆炸声，而是一阵强烈的磁场干扰声伴随着雷声一般的“隆隆”巨响
——那个声音听上去越来越近，也越来越嘈杂，持续了很久……但在声音变得最刺耳的时候，周围却突然安静了下来
——那样的“安静”持续了好一段时间，直到播放结束……
[诸星真视角]
当年防卫部高层的那些做法，让诸星真愤恨不已……心口不禁再次传来一阵剧痛
——他不得不马上克制住自己的情绪让心情平复下来。
不过，从“录音”的内容上听起来，当年的导弹应该是并没有成功炸毁广崎市……可那阵嘈杂的声音又是什么？
既然“广崎市”确实曾经存在，为何在这个地球上丝毫没留下任何关于它的痕迹？
阿克斯所说的“广崎市消失了”又是怎么一回事？