新疆巴州牦牛产于新疆维吾尔自治区巴音郭楞蒙古自治州。巴州牦牛体格大，头较重而粗，额短宽，眼圆大，额毛长而卷曲，但不遮盖双眼。耳小稍垂，鼻孔大，唇薄。角细长，尖锐，自基部先向两侧、再弯向前方伸出。颈薄，头颈结合良好。体躯长方，鬐甲稍高，胸部宽，腹大。后躯发育中等。尻斜，尾短而毛长。四肢粗壮而有力，关节圆大，蹄小，质地坚实。全身被毛，黑毛色占47％，黑白花占18％。巴州牦牛的平均体高，成年公牦牛为126.8厘米，成年母牦牛为110.7厘米，平均活重相应为361.2千克和251.7千克。
（1）在产肉性能上，巴州牦牛平均初生重，公犊牛为15.39千克，母犊牛为14.42千克；1岁牦牛平均活重公牦牛为68.76千克，母牦牛为71.58千克，平均日增重相应为146克和156克。
（2）在产奶性能上，巴州牦牛在终年放牧的条件下，一般挤奶期为6～9月共120天，日挤奶2次，平均日挤奶量为2.5千克。每100千克奶产酥油为8～12千克。
（3）在产毛性能上，每年5～6月间剪毛和抓绒，巴州牦牛平均产毛量为1.34千克，平均产绒量为0.43千克。
（4）在繁殖性能上，母牦牛一般3岁时初次配种，每年5～11月份为发情期，空怀母牦牛发情较早，当年产犊的母牦牛发情迟或当年不发情，膘情好的母牦牛多在产犊后3～4个月发情。公牦牛一般3岁进行初配，4～6岁配种能力最强，8岁后因配种能力弱而淘汰。3～4岁的公牦牛在配种季节每头可与15～20头母牦牛交配。