财务报表分析就是在财务会计报告所提供信息的基础上，结合其他信息来源，利用特定的方法，对企业当前状况作出综合评价，对未来发展趋势作出预测，使会计信息真正发挥其应有的作用。财务报表分析一般应按以下分析程序进行操作。
1.确定分析目的
在进行财务报表分析时，首先是明确分析目的，比如对盈利情况进行分析，据以预测未来年度的盈利能力，称为盈利性分析；再如对企业获取现金流量能力进行分析，以分析企业的支付能力，据以制定现金管理政策，称为流动性分析，等等。
财务报表分析具有广泛的用途，企业短期投资者分析财务报表的目的在于了解企业的短期偿债能力，便于短期投资决策；企业长期投资者分析财务报表的目的则着重于企业的长期偿债能力，为长期行为提供决策依据；股东分析财务报表的目的在于获悉企业的经营业绩、获利能力、财务状况及资本结构等因素，这些因素对股票价值的高低具有重大的影响；企业管理人员分析财务报表的目的在于及时掌握企业的财务状况及经营成果，检讨其得失，并及时发现问题所在，迅速采取有效的措施，使企业能够稳定发展；注册会计师分析财务报表的目的在于以独立超然的地位，采用合理的方法与程序，明确指明企业所提供的财务报表，是否公允表达某特定会计期间的财务状况及经营成果；税务机关分析财务报表的目的在于查核纳税义务人是否如实申报有关税收，等等。
2.搜集所需资料
财务会计报告是企业进行财务报表分析的主要资料来源，为了全面掌握企业的经营状况，还需要搜集其他资料，如市场前景、产销情况、员工构成、技术开发，以及预测、计划、定额和标准等资料。
企业财务报表分析所需资料的来源主要有以下几种。
（1）财务报表。
企业在会计期间编制的、对外报送的财务报表，主要有资产负债表、利润表、现金流量表及有关附表等。
（2）注册会计师查账验证报告。
注册会计师依照国家有关法规及一般公认会计原则，采用必要的查账验证程序，对企业财务报表予以验证后，应提出查账验证报告，对验证后的财务报表表示意见。财务报表分析者、银行、其他贷款机构及投资人等，对于注册会计师所提出的查账验证报告，一般是比较信任的。因为注册会计师必须在查账验证报告中对验证后的企业财务报表是否公允、是否合理发表审计意见。
（3）企业的会计政策。
企业的会计政策是指该企业在编制财务报表时所依据的各项会计原理、原则与方法，以及对这些原理、原则与方法的特殊应用。
（4）其他途径取得的有关资料。
其他专业性机构，如投资咨询服务机构、行业性协会、证券交易所等所提供的有关资料，有关企业预算、计划、总结、规划的材料以及企业管理人员对企业当年年度生产经营与未来展望的评价等，均可为财务报表分析者提供必要的会计资料。
（5）调查核实所获得的资料。
原始资料是粗糙的、零碎的、表象的、感性的，甚至是有错的，所以需要经过核实，才能去粗取精，去伪存真。
（6）有关部门对比分析所需的资料。
掌握有关计划资料、历史资料和同行业的先进资料，可以全面深入地分析企业的财务状况、经营成果和现金流量。对所搜集的各项报表资料反映出的各项经济指标，同有关的计划、历史资料、同行业的先进资料进行对比，有利于找出差距和应深入分析的重点。
在充分搜集了财务报表资料以后，还必须按实事求是的原则，严格按企业生产经营活动的全貌进行加工。只有这样，才能客观地、公正地、如实地反映企业经营的本来面目。
3.确定分析方法
分析方法服从于分析目的，应当根据不同的分析目的，采用不同的分析方法。如对未来发展趋势的预测，往往需要用到回归分析法；对流动性的分析，往往需要用到比率分析法；对计划执行情况的分析，往往用到因素分析法等。
4.具体分析计算
根据所掌握的数据资料，采用一定的分析方法，特别是采用一定的财务指标，进行指标计算，然后根据计算得出的指标，层层分解和辨析。比如，在进行计划执行情况的分析时，找出指标之间的差距，分析差距形成的原因；在进行未来趋势预测时，就要在指标计算的基础上，剔除其中隐含的非正常因素，从而对未来趋势作出判断。
通过分析矛盾，确定差距以后，还应当揭示各项报表资料所隐含的重要关系及相互间的影响程度。这是因为，进行财务报表分析所依据的报表资料都是综合性较高的经济信息，它们之间隐含着相互作用、相互影响的关系。它们之间关系的形成与变动，经常是很多正反因素交互作用、互相抵消的结果。对于这类综合信息就要进一步分析形成隐含关系的各因素及其影响程度，才能具体确定哪些是主要因素与次要因素，哪些是主观因素与客观因素，哪些是有利因素与不利因素等，以利于追根究底，探本寻源，明确区分影响这些指标完成程度的原因及责任，查明影响企业财务状况和经营成果的主要因素和真正原因。
5.报告分析结果
在分析报告中，应对分析时期、分析过程、所采用的分析方法和依据作出交代，对分析的主要内容和结果作出概括，同时还应当对分析资料、分析方法的局限性作出说明等等。这些将在下面的章节作具体的说明。