陈诚住院后，正在美国痛感前途无望的何应钦，却意外得到蒋介石两次催他回国的电报。被冷落了近两年的何应钦，欣喜若狂，又忐忑不安，叫来夫人王文湘和女儿何丽珠一同祈祷上帝，希望耶稣降临福音。
蒋介石在内战中已输掉了大半本钱，人一下子老了许多，也变得爱忘事了。一心指望的陈诚不但没有创造奇迹，反而一败涂地。他又把一线希望寄托在何应钦身上，这也是不得已的事。
5月31日，何应钦被任命为行政院政务委员兼国防部部长，同时，以顾祝同接替陈诚的参谋总长职务，免去了陈诚本兼各职。陈诚嘴上没说什么，可头上豆大的汗珠直冒，脸色蜡黄，他的胃病一下加重。6月，他不得不在上海国防医学院将胃部割去三分之二，医生说至少要半年以上的休养。陈诚那颗不肯安分的心，一下子凉透了。
这时，在华北一连打了败仗的陈继承，命运却比陈诚好，不但当了华北“剿总”的副总司令，而且又得一枚一等宝鼎勋章。1948年2月，华北“剿总”总司令傅作义召开会议，研究作战计划。傅作义提出有权使用战斗序列的整个部队的问题，受到奖励的陈继承口出狂言，坚持中央军的行动必须由他批准。气得傅作义三次打电报给蒋介石要求辞职，蒋竭力挽留。
7月5日，东北流亡学生到东交民巷请愿时，陈继承怂恿青年军第二○八师开枪镇压，当场打死学生8人，伤48人，造成“七五血案”。事发后，陈继承推卸责任，傅作义只好出面接见学生代表，流着眼泪向学生检讨。国民政府监察院派员调查并写《检举书》，称“傅作义一再命令不准开枪，不准打学生，陈继承有措置失当之责”。为了平息舆论，蒋介石遂将陈继承调离北平。10月底，陈继承又到南京就任卫戍总司令。
而南京已闹得不可开交。
7月下旬至8月上旬，蒋介石在南京召开了七天的军事会议。当时，他还没有料到这是他在大陆的最后一次全面军事会议。会议的地点是国民政府国防部大礼堂。到会的有高级将领120多人。蒋介石、何应钦和顾祝同三人轮流主持会议。
开幕时，蒋介石一脸沮丧，目光早已失去了早年的明亮，变得浑浊起来。他用手帕擦了擦已隐约长出一些白胡茬的嘴唇，感慨地说：“我们在军事力量上本来大过共匪数十倍，制空权、制海权完全掌握在政府手中，论形势较过去在江西围剿时还要有利。但由于在接收时许多高级军官大发接收财，奢侈荒淫，沉溺于酒色之中，弄得将骄兵逸，纪律败坏，军无斗志。可以说，我们的失败，就是失败于接收。”他越说越激动，最后敲起桌子，痛心疾首：“现在共匪势力日益强大，匪势日益猖獗，大家如果再不觉悟，再不努力，到明年这个时候能不能再在这里开会都成问题。万一共党控制了中国，则吾辈将死无葬身之地！”
也许，这是蒋介石讲话中最清醒的一次，最有预见的一次，也是最无奈的一次。
可是，这些话只能由他自己口中说出，一旦别人来说，他又会暴跳如雷。会议开到第三天，便出现了最紧张的一幕。那一天，由国防部部长何应钦作军事报告。他就悬挂的许多军事地图说明各个战场的双方态势，并公开了两年来作战损耗的数字，计：兵员的死伤、被俘、失踪总数共300余万人；步枪100万支，轻重机枪约7万挺，山炮、野炮、重炮共1000余门，迫击炮、小炮共1.5万余门；还有战车、装甲车、汽车以及大批的通讯器材和弹药。何应钦的意思很明白，即这两年的损耗都是由挤走他的陈诚造成的。
蒋介石自己平时并不到会，而由蒋纬国（时任装甲兵司令部上校参谋长）与会，并由他的两个侍从秘书轮流到会，记录每一个人发言的内容和会场情况。蒋介石在官邸听了这天何应钦的报告和一般情绪的反映，气得满脸涨得通红，连胡子都翘了起来，两手撑着腰，在室内走了许久。第二天，蒋介石穿上军装，挂上自己发给自己的一枚最高勋章和美国杜鲁门总统赠给他的一枚勋章，气势汹汹地走上讲台，把面孔绷得紧紧的，用凶狠的目光向会场扫视一周，开始发言：
“我自黄埔建军二十多年以来，经过许多的艰难险阻，总是抱着大无畏的精神和百折不回的决心，坚持奋斗，终能化险为夷，渡过种种难关。自对共匪作战两年来，军事上遭受了挫折，这是不容讳言的事实。但今天最重要的是我们大家同心同德，共济时艰，抱定‘有敌无我，有我无敌’的决心，激励士气，来挽救危机争取胜利，而不是要互相埋怨，互相倾轧。尤其是我们这些高级负责人，更应坚定信心，处在危疑震撼之际，更宜力持镇静，绝不可有丝毫悲观失败的情绪和论调，以致影响士气，影响全局……”
这番话本来是针对何应钦而发的，可何应钦坐在主席台上，若无其事地听着，如和尚打坐，入定得没有任何激动和不安。
蒋介石也没有办法，最后扯了一通：“就总的力量对比来说，我们要比共产党大过许多倍，没有任何悲观失望的理由。‘破山中之贼易，破心中之贼难’，现在最要紧的就是要打破大家害怕共匪的心理。”他还讲了一大段曾国藩、左宗棠、胡林翼、李鸿章等人扫平太平天国及捻军的历史，勉励诸位一心一德，矢勤矢勇，担负起削平大难，挽救国家民族的重大责任。
会议的第七天也就是最后一天，由参谋总长顾祝同提出一个战略方案：为巩固长江以南地区，防止共军渡江起见，应暂时停止战略性的进攻，将现在长江以北、黄河以南地区的部队，编组成为几个较强大的机动兵团，将原有的小兵团概行归并。这几个兵团应置于徐蚌地区、信阳地区、襄樊地区，其主要任务是防止共军渡江，并相机打击共军。在长江以南地区迅速编练第二线兵团。这方案获得了全场一致的同意。
闭会后的第二天下午7点，蒋介石和宋美龄在励志社宴请参加会议的人。席间又讲了一些打气的话，并散发了一篇标题叫“为什么要剿共？”的印刷品，叫大家带回去对官兵讲解。