海胆的危险武器有两种类型：一是针状的毒棘，二是叉棘。大多数危险海胆必具备其一或二者皆备。海胆全身长满了棘，但各种海胆间又有很大差别。多数种的棘是硬的，棘端圆而钝，没有毒腺。但有些种的棘细长而尖锐且是中空，如刺冠海胆的棘可长达30厘米。这种棘很容易断，刺伤皮肤断在其内，难往外取，抓取这种海胆是很危险的。
海胆
叉棘小而精巧，长在棘之间，有好几种类型。其中之一是由两部分构成，一是头部，位于上端；一是下部的柄，起支持作用。头是圆球形，又称球生叉棘，是有毒器官，主要用以防御。一旦刺中目标，叉棘可以从壳上脱下来，活几个小时，继续对被刺者产生毒性作用。
被刺后伤口异常疼痛，除因断下的棘留在皮肤内引起剧痛外，棘内的紫色毒液会注入皮肤，引起被刺部位皮肤红肿。较重者还会引起恶心、呕吐和腹泻，甚至失去知觉，呼吸困难，个别者还会死亡。所以在采集海胆时务必小心，尽可能戴上厚的手套。