（第一节 ）生物化学的概念和内容
一、生物化学的概念
生物化学是以生物体为对象，研究生命化学本质的科学。它应用物理、化学、生物学的理论和方法去研究生物体内各种物质的化学及其化学变化规律，通过对这些规律的了解，以期认识和阐明生命现象的本质，并将这些知识应用于工、农、医等实践领域，为人类的物质文明和精神文明建设服务。
生物化学可分为不同的学科。若以不同的生物为对象，生物化学可分为动物生化、植物生化、微生物生化、昆虫生化等；若以生物体的不同组织或过程为研究对象，则可分为肌肉生化、神经生化、免疫生化、生物力能学等；因研究的物质不同，又可分为蛋白质化学、核酸化学、酶学等分支；研究各种天然物质的化学称为生物有机化学；研究各种无机物的生物功能的学科则称为生物无机化学或无机生物化学。
20世纪60年代以来，生物化学与其他学科又融合产生了一些边缘学科，如生化药理学、古生物化学、化学生态学等；或按应用领域不同，有医学生化、农业生化、工业生化、营养生化等。
二、生物化学的研究内容
生物化学的研究内容可分为三个部分：静态生物化学、动态生物化学以及机能生物化学。
静态生物化学研究蛋白质、核酸、糖类和脂类等生命物质的化学组成、分子结构和理化性质，以及它们在生物机体内的分布和所起的作用。
动态生物化学研究生命物质在生物机体中的新陈代谢及其规律，包括物质代谢、能量代谢及机体与周围环境进行物质和能量交换的规律。
机能生物化学研究生命物质的结构、功能和生命现象之间的关系，包括各种生命物质在生命活动中所起的作用及其结构变化对生命活动的影响。
（第二节 ）生物化学发展简史
生物化学这一名词的出现大约在19世纪末20世纪初，但它的起源可追溯得更远，其早期的历史是生理学和化学的早期历史的一部分。例如18世纪80年代，拉瓦锡证明呼吸与燃烧一样是氧化作用，几乎同时科学家又发现光合作用本质上是动物呼吸的逆过程。又如1828年沃勒首次在实验室中合成了一种有机物——尿素，打破了有机物只能靠生物产生的观点，给“生机论”以重大打击。
1860年巴斯德证明发酵是由微生物引起的，但他认为必须有活的酵母才能引起发酵。
1897年毕希纳兄弟发现酵母的无细胞抽提液可进行发酵，证明没有活细胞也可进行发酵这样复杂的生命活动，终于推翻了“生机论”。
生物化学的发展大体可分为三个阶段。
第一阶段从19世纪末到20世纪30年代，主要是静态的描述性阶段，对生物体各种组成成分进行分离、纯化、结构测定、合成及理化性质的研究。其中菲舍尔测定了多糖和氨基酸的结构，确定了糖的构型，并指出蛋白质是肽键连接的。1926年萨姆纳制得了脲酶结晶，并证明它是蛋白质。
此后四、五年间诺思罗普等连续结晶了几种水解蛋白质的酶，指出它们都无例外地是蛋白质，确立了酶是蛋白质这一概念。通过食物的分析和营养的研究发现了一系列维生素，并阐明了它们的结构。
与此同时，人们又认识到另一类数量少而作用重大的物质——激素。它和维生素不同，不依赖外界供给，而由动物自身产生并在自身中发挥作用。肾上腺素、胰岛素及肾上腺皮质所含的甾体激素都是在这一阶段发现的。此外，中国生物化学家吴宪在1 931年提出了蛋白质变性的概念。
第二阶段约在20世纪30～50年代，主要特点是研究生物体内物质的变化，即代谢途径，所以称动态生化阶段。其间的突出成就是确定了糖酵解、三羧酸循环以及脂肪分解等重要的分解代谢途径。对呼吸、光合作用以及腺苷三磷酸（ATP）在能量转换中的关键作用有了较深入的认识。
当然，这种阶段的划分是相对的。对生物合成途径的认识要晚得多，在20世纪50～60年代才阐明了氨基酸、嘌呤、嘧啶及脂肪酸等的生物合成途径。
第三阶段是从20世纪50年代开始，主要特点是研究生物大分子的结构与功能。生物化学在这一阶段的发展，以及物理学、技术科学、微生物学、遗传学、细胞学等其他学科的渗透，产生了分子生物学，并成为生物化学的主体。
（第三节 ）生物化学与其他生命科学的关系
从生物学的发展历史看，人们对生物体（生命现象）的认识，是从宏观到微观，从形态结构到生理功能。首先是观察生物体的形态，继而解剖观察其组织结构，从器官、组织到细胞不同层次的观察和研究，曾产生了一系列生物学的分支，如分类学、解剖学、组织学、细胞学等。20世纪40年代开始，从对细胞的研究深入到对组成细胞物质的分子结构进行研究。虽然生物化学的起源可以追溯到一个多世纪以前，但生物化学的真正蓬勃发展，却始于20世纪40年代末50年代初，由于当时对构成生物体的基础物质一蛋白质和核酸的分子结构得到初步探明，从而促进了生物化学的迅猛发展。生物化学的成就，又带动和促进了生命科学向分子水平发展，生物学的各分支学科，又衍化出若干分子水平的新学科，如分子分类学、分子遗传学、分子免疫学、分子生物学、分子病理学、分子细胞生物学，终于又独立产生一门崭新的生命科学——分子生物学，从而使人们对生命的本质和生物进化的认识向前大大迈进一步。
生物化学既是现代生物学科的基础，又是其发展前沿。说它是基础，是由于生物科学发展到分子水平，必须借助于生物化学的理论和方法来探讨各种生命现象，包括生长、繁殖、遗传、变异、生理、病理、生命起源和进化等，因此它是各学科的共同语言；说它是前沿，是因为各生物学科的进一步发展要取得更大的进展和突破，在很大程度上有赖于生物化学研究的进展和所取得的成就。事实上，没有生物化学上生物大分子（核酸和蛋白质）结构与功能的阐明，没有遗传密码和信息传递途径的发现，就没有今天的分子生物学和分子遗传学。
没有生物化学对限制性核酸内切酶的发现及纯化，也就没有今天的生物工程。由此可见，生物化学与各生物学科的关系是非常密切的，在生物学科中占有重要的地位。
主要以生物化学、生物物理学、微生物学和遗传学为基础发展起来的分子生物学，其主要任务是从分子水平来研究生命现象和生命规律。因此广义而言，生物化学主要研究内容的蛋白质和核酸等生物大分子的结构和功能，也纳入了分子生物学的研究范畴，有时就很难将生物化学与分子生物学分开，二者关系非常密切。正因为如此，国际生物化学协会现已改名为国际生物化学与分子生物学协会，中国生物化学学会也已更名为中国生物化学与分子生物学会。
不过，目前人们还是习惯采用狭义的概念，将分子生物学的范畴偏重于核酸（或基因）
的分子生物学，主要研究基因或核酸的复制、转录、表达和调节控制等过程。可见，生物化学与分子生物学有着各自的侧重点。
（第四节 ）生物化学与现代工、农、医的关系
生物化学是在医学、农业、某些工业和国防部门的生产实践的推动下成长起来的，反过来，它又促进了这些部门生产实践的发展。生物化学在发酵、食品、纺织、制药、皮革等行业都显示了强大的威力。例如皮革的鞣制、脱毛，蚕丝的脱胶，棉布的浆纱都用酶法代替了老工艺。近代发酵工业、生物制品及制药工业包括抗生素、有机溶剂、有机酸、氨基酸、酶制剂、激素、血液制品及疫苗等均创造了相当巨大的经济价值，特别是固定化酶和固定化细胞技术的应用更促进了酶工业和发酵工业的发展。
（第五节 ）21世纪生物化学的发展趋势
生物化学现在的研究前沿包含以下几个方面的内容：（1）蛋白质三维结构与功能关系的研究重点在于完整、精确、动态地测定蛋白质在溶液和晶体状态下的三维结构，并分析与其功能的关系。
（2）蛋白质折叠的研究主要包括生物体内新生肽链的折叠和体外变性蛋白的重折叠，以及以氨基酸序列知识为基础的蛋白质构象预测。
（3）多肽工程和蛋白质工程主要包括通过有控制的基因修饰和基因合成，对现有的蛋白质和多肽加以定向改造，同时设计并最终生产比自然界已有的性能更加优良、更加符合人类需要的蛋白质和多肽。
（4）核酸结构与功能的研究包括tRNA结构和功能、核糖体的结构与功能、DNA复制、RNA翻译、酶活性RNA的结构和功能、snRNA的结构与功能的研究。
（5）蛋白质功能的研究包括酶促作用，受体识别，分子间专一性结合的机理，信息通生物化学过受体本身或通过分子间的作用而传递的机理。20世纪80年代以来，酶学中具有突破性进展的是酶活性RNA和抗体酶的发现。酶结构与功能的研究中有效的方法是蛋白质工程和一些物理技术已经可以描绘出酶蛋白的立体构象。固定化酶和生物传感器的研究已经产生了巨大的效益。酶学研究包括三个部分：基础酶学，即酶的结构与功能、动力学、酶分子设计等；应用酶学，即疾病的诊断、治疗、物质测定及酶在工农业中的应用；酶工程，即固相载体、固定化技术、酶传感器等。
（6）基因工程的研究包括基础研究（如基因信息的表达、传递、调控等的机理研究，工程化宿主，翻译后加工，肽链折叠等）和关键技术（如基因体外操作和基因转移技术、体后处理、肽链再折叠、高密度培养技术等）研究。
（7）生物分子的合成和组装包括膜脂与膜蛋白的相互作用，膜蛋白的相互作用，物质跨膜传送，跨膜信息传递和脂质体功能等研究。