在治疗上，实证痛经和虚证痛经有两个通用的穴位——关元穴和三阴穴交。
关元穴是任脉上的穴位，位于脐下3寸，是肾阴肾阳交关之所，也是与肝、脾、肾三条经脉的交会穴，任脉起源于子宫，因此关元穴是治疗痛经的首选穴。
关元穴治疗痛经的操作方法是：患者取坐位或仰卧位，虚证痛经最好用手掌按揉、艾灸法（最好使用艾灸盒）或拔火罐法；实证痛经用指压点按法、皮肤针叩刺法。指压按揉时虚证手法要轻一点，点按的时间短一点；实证手法要重一些，点按的时间要长一些。一般按5～6分钟疼痛就可以缓解。
三阴交是脾经上的穴位，在足内踝尖上3寸（四横指宽的高度）、胫骨内侧缘后方。它是脾经与肝经、肾经的交会穴。中医学认为，脾是统血的、肝是藏血的，肾主泌尿、生殖，也是直接联系子宫的，所以三阴交是个治疗痛经非常有效的穴位。
三阴交穴的操作，用指压点按、艾灸、拔罐、皮肤针叩刺法都可以。虚证用灸法5～10分钟，实证则用皮肤针重叩，气滞血淤者即使叩刺出血也无妨。我曾经就用穴位疗法治疗过一个典型的痛经患者。那时我正在一个农村巡回医疗，有一次我们背着药箱走在乡间的小路上，看到很多农民都在水田里忙着插秧，但是却有一个二十多岁的女孩一个人蹲在田边。看她满脸通红、表情痛苦，我就叫一个女同学去问她是怎么回事。那个女孩说是来例假了，生产队长还要她下水田干活，于是就痛经。于是我就让学生重力按揉了一会儿她的三阴交穴，结果女孩的腹痛当时就好了。为了让她能请假休息，还特意在她的三阴交穴“埋”了一根小针，外面绑上绷带（故意小题大做，给生产队长看的），队长看了就不再让女孩下水田插秧了。
还有一次我出差到天津开会，在火车上见到几个女孩子为一个女同伴掐人中。我感到很好奇，就过去问话，才知道那个女孩子肚子痛得很厉害，面色苍白，不欲言语。伙伴们还以为她是疼晕过去了，就掐她的人中穴。我当时就问那个女孩子是不是例假来了？她有气无力地点点头。路见痛经应解救，该出手时就出手！于是我立即为她点按三阴交穴，仅仅1～2分钟，女孩就缓过神来说不痛了，还引来同车厢旅客们的一片叫好的掌声。