管弦乐
BWV1046-51《勃兰登堡协奏曲》 BWV1052-58羽管键琴和弦乐的协奏曲七首 BWV1060-62两架羽管键琴和弦乐的协奏曲三首 BWV1063-64三架羽管键琴和弦乐的首 BWV1065A小调四架羽管键琴和弦乐协奏曲（维瓦尔迪协奏曲Op.3No.10的改编曲） BWV1044长笛，小提琴，羽管键琴，弦乐协奏曲 BWV1059羽管键琴，双簧管，弦乐曲 BWV1041/BWV1058A小调小提琴与弦乐曲 BWV1042/BWV1054E大调小提琴与弦乐曲 BWV1043/BWV1062D小调两把小提琴和弦乐 BWV1060D小调小提琴，双簧管与弦乐曲（羽管键琴协奏曲的改写稿） BWV1066-69四首组曲
室内乐
BWV1080《赋格的艺术》
BWV1079《音乐的奉献》
BWV1002，1004，1006三首小提琴独奏《古组曲》 BWV1001，1003，1005三首小提琴独奏《奏鸣曲》 BWV1014-19小提琴和钢琴六首奏鸣曲 BWV1020-25小提琴或长笛和钢琴奏鸣曲六首 BWV1036-39两把小提琴或两支长笛或两支双簧管和羽管 键琴的四首奏鸣曲
BWV1030-35长笛和羽管键琴奏鸣曲六首 BWV1027-29低音维奥尔琴（大提琴）和钢琴奏鸣曲三首 BWV1013A小调长笛奏鸣曲
BWV1007-12大提琴六首组曲键盘曲 BWV992《降B大调随想曲》（为送别亲爱的哥哥而作） BWV903D小调《半音幻想曲与赋格》 BWV972-87羽管键琴独奏协奏曲十六首（No.1，2，3，4，5，7和9是维瓦尔迪作品的改编曲，No.3是马尔切洛的作品改编曲，N.14 和15是泰勒曼作品的改编曲） BWV806-11《六首英国组曲》
BWV922A小调幻想曲
BWV904A小调幻想曲与赋格
BWV812-17六首法国组曲
BWV952C大调赋
BWV988《戈尔德堡变奏曲》
BWV772-86十五首创意曲（二声部） BWV787-801十五首创意曲（三声部） BWV971《意大利协奏曲》
BWV825-30六首古组曲
BWV924-32《为W F 巴赫而作的九首前奏曲》 BWV933-38六首前奏曲
BWV995G小调
管风琴曲
BWV592-7六首协奏曲（全部改编自其他作曲家的作品） BWV802-5四首二重奏
《幻想曲和赋格》
BWV5-37C小调
BWV542G小调
BWV573C大调
BWV562C小调
BWV572G大调
BWV574C大调
BWV575C小调
BWV577G大调
BWV578G小调
BWV582《帕萨卡利亚和赋格》
《序曲和赋格》
BWV536A大调
BWV543A小调
BWV551A小调
BWV544B小调
BWV531C大调
BWV545C大调
BWV547C大调
BWV548C小调
BWV549C小调
BWV532D大调
BWV538D小调
BWV539D小调
BWV533E小调
BWV548E小调（《楔形》）
BWV552降E大调
BWV534F小调
BWV541G大调
BWV550G大调
BWV535G小调
BWV542G小调
BWV553-60八首前奏曲和赋格
BWV525-30六首奏鸣曲
BWV564《托卡塔、柔板和赋格》
《托卡塔和赋格》
BWV538D小调（多里亚调式）
BWV565D小调
BWV566E大调
BWV540F大调
《三重奏》
BWV583D小调
BWV586G大调
众赞前奏曲
BWV599-644《管风琴曲小集》
BWV649《啊，留在我们身边》
BWV711《赞美天上唯一的上帝》
BWV653b《巴比伦流水》
BWV696《我们颂扬基督》
BWV720《坚固的堡垒》
BWV709《耶稣基督，帮助我们》
BWV729《欢乐的佳节》
BWV713《耶稣，我的欢乐》
BWV688《耶稣基督，我们的救世主》 BWV667《来吧，创造者上帝》
BWV652《来吧，神圣的心灵》
BWV650《耶稣，你现在来了》
BWV706《亲爱的耶稣，我们在这里》 BWV648《我的灵魂颂扬主》
BWV657《感谢上帝》
BWV659《来吧！异教徒的救世主》
康塔塔
No.29《上帝，我们感谢你》（1731年） No.34《啊！永恒的火》（1742年后 ） No.40《上帝之子出现了》（1723年） No.45《对你说》（1726年）
No.51《欢呼上帝》（1730年）
No.60《啊，永恒，响亮的字眼》（1723年） No.61《来吧，异教徒的救世主》（1714年） No.68《上帝热爱世界》（1725年） No.78《耶稣，我的灵魂》（1724年） No.80《我们的上帝是坚固的堡垒》（1730年） No.82《我厌倦了》（约1713年） No.93《只有亲爱的上帝》（1724年） No.95《基督，我的生命》（1723年） No.106《上帝的时间是最美好的时间》（1711年 ） No.140《醒来吧》（1731年）
No.143《颂扬上帝》（1735年） No.147《心与口》（第10乐章是《耶稣，人类愿望 之欢乐》）（1723年） No.197《上帝是我们的信念》（约1728年） No.202《你退让吧，忧郁的阴影》
No.208《什么使我感到愉快》（1716年） No.211《愿闲话停息》（《咖啡康塔塔》）（1732年） No.212《我们的新长官》（《农民康塔塔》）（1742年） 声乐曲
BWV1075，1077，1 073，1078 二声部，三声部，四声部和七声部卡农清唱剧等 BWV248六声部《圣诞节清唱剧》（1734年） BWV249《复活节清唱剧》（1736年） BWV243D大调《圣母颂歌》（约1723年） BWV232B小调弥撒曲（1733年） BWV236G大调弥撒曲（1738年） BWV235G小调弥撒曲（约1737年） BWV225-231七首经文歌《为上帝唱一支新歌》，《上帝的 人》，《耶稣，我的欢乐》，《别害怕》，《来吧，耶稣，来吧！》，《颂扬上帝》，《颂扬 和荣耀之奖》》 BWV245《约翰受难曲》（1723年） BWV244《马太受难曲》（1729年） 歌曲和咏叹调 BWV508-18《安娜 玛格达勒娜 巴赫的笔记簿，No.2》 BWV461《上帝仍然存在》（咏叹调） BWV474《耶稣是最美的光》
BWV478《来吧，甜美的死》（咏叹调） BWV493《啊，可爱的耶稣》
BWV505《别忘了我，我最亲爱的上帝》