发现海底古城以后，埃及相关部门即对该海域进行了保护，除了体积较小的文物会被运到博物馆展出外，当局让其余的遗迹继续留在水底。被打捞上岸的文物包括：玄武岩法老王头像、土地神塞拉皮斯的大理石头像、送子女神伊希斯的无头石像等。文化交流和融合的倾向在这些文物中有非常明显的体现。
根据考察，考古学家们估计，这几座古城建于公元前7—前6世纪。其中伊拉克利翁很可能曾经是这一地区的经济中心，不过自从亚历山大城在公元前331年建成后，伊拉克利翁的经济地位便被取代。由于遗迹中还发现了拜占廷时期的金币和珠宝，因此人们相信，古城最迟是在7—8世纪左右突然消失的。
但是，这个城市群的灭亡过程仍然是一个未解之谜。美国斯坦福大学的地球物理学家阿莫斯？努尔认为，城市淹没于海底的可能性最大的原因是地震。大概在7世纪或8世纪的时候，一场突然降临的大地震将整座城市毁灭，地壳运动使得城市整体下沉，最终沉入海底，归于沉寂。
目前，海底古城仍然保存在海底，只有少量艺术品被摆在博物馆展出。科学家们还在对这些海底古城进行进一步的研究，希望找到关于海底古城的更多信息。
大力神城突然毁灭之谜
2500年，大力神城曾作为地中海沿岸宗教圣城而存在，但是在某一天随着一阵剧烈颤动，这个城市好像被融化一样消失在大洋底。几个世纪后，沿岸的另一个城市卡纳普斯也遭到相同的厄运。从城市的东边开始，地面逐渐在溶解，然后房屋、庙宇和道路慢慢地被淹没在泥潭里。
原本极其繁盛的两座城市突然消失之后，城里没有一人能够幸存，因此也没有任何记录。它们消失后，很快被人们遗忘，再后来，人们甚至不知道这两座城市原来的确切位置。直到2000年，一位法国考古学家开始致力于揭开地中海历史上的最大谜团：究竟是什么大灾难将这两座城市从地球的表面抹去？
1996年，考古学家开始了寻找大力神城和卡纳普斯城的过程。他运用各类电子探测仪器，在舟筏遍布的阿布其湾150平方公里范围内搜索。此外，在一些海域，他还派遣潜水员进行近距离观察。1999年，考古学家在离海岸1.6公里的地方发现了卡纳普斯城的东郊。它在水下6至8米的地方被淤泥部分覆盖着。几年之后，大力神废城也被发现。大力神废城离现在的海岸6.5公里，全长1000米，宽800米，城里的东西一切依旧。
潜水员从海底淤泥中发掘出来的物品更是令人难以置信。在原卡纳普斯城的东部，发现了一座寺庙的残部，全长60米，庙墙厚度达2米。其间散落着一些金币和珠宝；还有残余的雕像，其中包括一具玄武岩加工成的法老雕像，以及一具没有头颅的女神伊希斯的身体雕像。从发掘的物品看，它们应该分别处在法老王朝的末期至公元7世纪时期。
2001年春天，考古学家的考古队开始发掘大力神废城。他们从淤泥中挖掘出一具狮身人面像的头和三具粉红色的花岗岩石雕像，还发掘出了一座名为大力神的希腊神庙，大力神城因此庙而得名。最令人兴奋的是，潜水员还发现了10条沉船，它们排成一行，每只船的两边都用锚固定着。这10条船肯定是停泊在原来城市的码头上，尚未起锚，就随着城市一起消失了。
这两座城市缘何迅速毁灭？考古数据表明，城市中的建筑物是突然坍塌的，人们在平静的日子里，这座城市的地面突然间下降了8米，生活中的人们还没有来得及思考是怎么回事，就失去知觉而死亡。
这两座城市消失的时间不同。大力神城的消失时间几乎可以断定是在公元前一世纪，因为其中所发现的物品最晚可以追溯到一世纪。而卡纳普斯东部消失的时间要晚，海底废墟中发现的最新物品是两枚金币，其中一枚铸造于公元724年至743年之间，也就是说卡纳普斯城直到伊斯兰时期仍然是完好的。
还有一些迹象也表明了这两座城市是突然倒塌的，比如，大力神城废墟中到处都散落着金银珠宝和青铜花瓶。如果人们是有秩序地撤退的，他们肯定已经把这些值钱的东西带走。海底废墟中留下这么多金器，说明人们要么走得很匆忙，要么来不及逃走就已经被杀死。
另外，雕像、石柱和墙壁都坍塌在海床上，至少有一些城里人被这些掉下来的石头砸死。卡纳普斯东部的海底废墟也一样，石柱、墙壁和庙宇的一些部分也倒塌在海床上。很明显，卡纳普斯的东部在沉入海底之前，不止一次地遭到自然灾害的袭击。地质剖面图显示，海底废墟的下面有数条裂缝，其中有一条长达几百米，深度为2米。挖掘时发现，大裂缝曾经被填埋好，然后在上面建房子。也就是说，这个城市曾经被毁坏过，而又得以重建，然后才突然间消失在大海之中。
是板块下陷？到目前为止，这两座城市的毁灭原因仍是一个谜团。
托木斯克爆炸之谜
俄罗斯历史上曾发生过两起神秘的大爆炸：一起是1908年发生在通古斯的大爆炸，另一起是1983年3月26日晚，发生在苏联西伯利亚的托木斯克地区大爆炸。这次大爆炸非常类似通古斯的大爆炸。
根据数百名目击者的回忆，在发生大爆炸的那天傍晚，托木斯克地区的上空，先是出现一个像“照明弹”一样的东西，把黑夜照得如同白昼一样，然后它又变成一个大火球。接着，火球上出现了桔红的尾巴和发出两三次蓝绿色闪光。在眩目的闪光之后，在10公里的高空，这个火球爆炸了，红色的火流射向地面，但没有达地面就消失在夜空之中。爆炸时．半径150公里范围内，都可听到雷鸣般的响声。
托木斯克大爆炸发生后，托木斯克大学和科学院、地球物理研究所联合组成了调查队，对这次大爆炸进行了调查。当时的目击者向调查队提供了许多奇怪的现象：
火球飞行时发出奇怪的响声，有时像树叶发出沙沙声，有时像发动机发出的扑扑声，有时又像铁皮屋顶在微风吹击下的轧支轧支声。许多目击者都是在听到这些响声之后才发现火球的。
再有，这个火球带有异常强的电场。在通过城市和乡村上空时，电视图像受到干扰，路灯发生故障，电灯被烧毁。但是，在火球爆炸地点下面宽20公里，长30公里的范围内，至今没有发现任何痕迹。
这次火球也是沿着通古斯一样的路线飞行。
虽然联合调查队对这次奇特的大爆炸进行了多方面的深入调查，但最终还是没能解开它的秘密。
芝加哥天火之谜
1871年10月8日，是个星期天。当月色降临芝加哥的时候，忽然，城东北一幢房子首先起火。旋即，不远处的教堂也起火了，随后，在城的四面八方都相继腾起大火。从第一个火警发出1个半小时后，全城已陷入火海之中，火借风势，越烧越烈，此时任何力量也无法抵御大火的进攻。惊慌失措的市民惊叫着在街上瞎跑乱撞，一些富商弃了马车，骑上马向市郊突围，一路上踏死了不少人。所幸火燃之时，人们均未入睡，但全城被烧死和惊马踏死的也有千余人，另有几百人在郊区倒毙。
大火一直燃烧到翌日（10月9日）上午，才渐渐熄灭下来。大火使这个拥有60万人口的城市，一夜之间化为瓦砾，1.7万座房屋被毁，直接经济损失达20多亿美元，12.5万人无家可归。
这场火灾的肇事者是谁呢？报纸说是1头母牛碰翻煤油灯，触燃了牛棚，才蔓延于全城的。在现场指挥救火的消防队长麦吉尔对此轻率的结论嗤之以鼻，他在证词中说：“在短时间内燃遍全城的这场火灾，是由某间房子开始而蔓延的，这完全不可能……如果不是一场‘飞火’又怎能在瞬间使全城燃成一片火海呢？”
目击者称：“整个天空都好像烧起来了，炽热的石块纷纷从天而降……”，“火雨从头上落下”。同一天晚上，芝加哥周围的密执安州、威斯康星州、内布拉斯加州、堪萨斯州，印第安纳州的一些森林、草原，也都发生火灾。这火是怎么烧起来的？
靠近湖边的一座金属造船台，被烧熔成团，城内一尊大理石雕像也被烧熔了，这要多高的温度？木屋之火不过两三百摄氏度，不可能熔化金属和岩石。
几百人奋勇窜出火海，死里逃生，庆幸来到郊区的公路上，可是，他们却离奇地集体倒毙了。尸检鉴定，他们的死与火烧无关。
总之，谁也不再相信1头母牛碰翻油灯烧掉芝加哥的鬼话了。那么谁是罪魁祸首呢？一个多世纪以来，人们对芝加哥这场蹊跷大火。一直没能找出真正的起因，而被戏称为“无名之火”，成为世界之谜。
此事发生很久以后，一位美国科研人员为考证火灾与气象的相互关系，读到早已为人们忘怀的芝加哥惨案报告，重新提出了对火团的讨论。他认为，芝加哥灾祸的起因，最大可能是一场炽热的陨石雨，因为当时城市上空无风，而只有两小时全城就被吞没在一片火海中，这说明这场火灾非同一般。陨石落到地面，依旧具有极高的温度，足以使金属、石头熔化。芝加哥即被“天火”所焚。附近各州亦溅落“天火”，引起一些森林、草原同时起火。陨落物含有大量致命的一氧化碳和氰，可以形成小区域的“致命小气候”，使人不焚而亡。几百人逃到空荡的郊区公路上，正好进入“死亡区”。
另外一些学者认为，起火原因是地球与高速运行的彗星尾巴相碰，使地球大气层一下子变得炽热造成的。
苏联的一些科学工作者则持不同意见。他们认为彗星上只有各种“冰”和微小坚硬的细尘的松软聚积，并没有什么能引起火灾的东西。地球也曾不止一次地穿越彗星尾巴，每次都没有引起意外，也没有使大气层“染受”有毒气体。至于陨石，虽说它飞进大气层时也会燃烧和熔化，但只限于陨石表面薄薄的（小于1毫米），陨石内部始终是很冷的，他们认为芝加哥火灾的起因看来还是应该从地面去寻找。所以，有人认为是由短暂的龙卷风造成的。