“世界只有几千年的历史”——当人们错误地怀有这样的见解的时候，也同时认为动物植物从创造出来的一刻起就是一成不变，一直都是现在这个样子，从来没有变化过，但是，人类渐渐地摒弃了这种错误的观点，因为人们发现了岩石记录并对它进行深入的研究。他们开始质疑，这些物种在历经遥遥无期的岁月中，有着缓慢的进化和变化，正是这种质疑，最终有了“生物进化”的理论，也就是说，无论是动物、植物，地球上的一切生物都是从无生代海洋中一些近于没有组织的生物体、一些极为简单的原始生物，经过持续而缓慢的进化过程演变而成的。
就像地球的年龄问题一样，生物的进化问题在不管在过去还是现在，都是人们争论的话题。在曾经的一段时间中，生物进化论思想由于一些说不清的原因，被正统基督教、伊斯兰教和犹太教视为异端邪说。当然那个时代已经过去了。如今，天主教、基督教、伊斯兰教和犹太教教徒，对这种更新更开阔的、万物同源的观点，都坦然地予以接受。地球上的所有生物都是逐渐发展而成的，没有一种生物是突然出现的。久而久之，经过了悠远的时间鸿沟，使得我们的想象力处于混沌状态，潮汐涨落处的泥沙中终于有了生命蠕动的迹象，逐渐演变成强壮、自由、有意识的生物。
生命是由许多个体组成的。这些个体不像无边无际的静止的结晶体，也不像团状和块状的非生物体那样，它们都是实实在在的个体。
它们具有的两种特征，都是非生物体不具备的：其一是它们能把其它物质摄入体内，使之变成自身的一部分；其二是它们可以繁衍生息。
它们繁殖出来的新的个体，与自身既有相似性，又有差异性。每个生命体与其后代之间，都有着某些种族的特殊相似性，与此同时，还有着个体的差异。从这一点可以看出，不管生命的哪一个阶段，不管哪一个物种都是相同的。
为什么生物体的后代和母体之间既有相似性又有差异性？直到今天，科学家都不能做出合理的解释。与其说这种相似性和差异性是科学知识，还不如说是常识。如果一个生物的生存条件发生了变化，就会发现这种生物的特征也会有相关的变化。无论在物种的哪一代，总有很多个体由于其个体的差异，使得它们可以对所处的环境有更好的适应，同时，也有一些物种的个体，由于本身具备的特征使它们难以在新的环境中生存。总体而言，两者比起来，前者更长寿，繁殖力也更强，从而使种族更加兴旺，像这样一代代的承传下去，这个物种的平均适应性就会向更有利的方向发展。这个过程就叫做“自然选择”。
与其说这一过程是科学的推测，倒不如说是建立在生物繁衍和个体差异基础上的一个必然的推论。也许，有很多力量在物种的演变、保存和灭绝的过程中发挥了巨大的作用，可是到现在为止，科学也不能解释其中的奥妙。但是“自然选择”这种从生物出现以来就存在的作用，是没人能否定的，不然他不是缺乏基本的思维能力，就是无视生命的基本事实。
有很多科学家都做过生物起源的设想，他们的判断推测都生动有趣，可是到了今天也没有关于生命起源的明确说法和令人信服的理论。
不过有这样一个观点，它获得几乎所有的权威人士的认可：在温暖阳光的照耀下和海洋浅水区的泥沙中，产生了生命，然后，这些生命随着潮汐的涨落分散到潮间区、海岸和大海深处。
在原始的世界里，潮水的活动极为剧烈。毁灭性的打击不断地向微弱的个体生命冲过来，它们有的被潮水冲进深海，与阳光、空气隔绝而死去，有的被潮水卷到岸上被阳光烤焦。生命个体在这种恶劣的环境下，不得不向着生根固定的方向发展；它们不得不长出外壳避免脱水晒干。最初，生物寻找食物都是依仗味觉的敏感，依靠对光线的敏感从黑暗的深海和洞穴中出来，或者凭借光线刺目的敏感，从险象环生的浅滩中逃离出去。
起初，生物只是为了防止本身的干燥，才长出甲胄和硬壳，而不是为了抵御外敌。但是，在地球历史的早期，生物就已经进化出爪子和牙齿了。
在前面，我们讲过远古时期海蝎子的大小，海蝎子在很长的一段时间里号称生物界的霸王。之后，一种有眼睛、牙齿、会游泳的、生命力更顽强的物种在古生代岩层中“志留纪时代”出现了，很多地质学家认为志留纪时代是在5亿年以前。而这种新生的物种就是我们已知的最早的脊椎动物，也就是最初的鱼类。
岩层的下一记层是“泥盆纪时代”，这种脊椎鱼类的数量有了明显的增加。岩石记录把这一时期叫做“鱼类时代”，因为鱼类在这一时期极为繁盛。而现在地球上的这些鱼类早就灭绝了，他们和今天的鲟鱼、鲨鱼的形状非常相似。它们喜欢穿梭在浩瀚的海水中，一会儿在海藻间觅食，一会儿跳跃在水面上，一会儿又相互追逐捕食，远古的海洋增添了不少生机。从现在的标准看，这些鱼并不是很大，它们之中身长达到二三英尺的极为少见，当然也有例外，有一种长达20英尺的鱼类。
我们无法从地质学上获得任何关于这些鱼类的祖先的信息，好像它们和以前的物种不存在一丝的关联，尽管动物学家对它们的祖先有许多有趣的观点，但这些结论都是通过对现存的、与它们有血缘关系的鱼卵进行的研究以及其他渠道考察获得的。根据他们的推测，或许，那些软体动物就是脊椎动物的祖先，又或者是从嘴里、嘴巴四周长出牙齿般的硬物的小型水生动物。鳐鱼和角鲨的牙齿遮住了上下腭，并且从嘴边开始，全身长满了齿状的鳞片。据地质学的记录，鱼类的齿状鳞片成形以后，它们就摆脱了黑暗，朝着光亮的地方的游去，最早的脊椎动物也就出现在地质纪录中了。