在通过对足部各反射区进行按摩时，也要遵循一定的按摩方向与按摩程序。方向与程序对了，才能起到有效的养生保健疗疾作用，否则不仅会事倍功半，还可能起到反作用。
1.按摩方向
在对双足进行按摩时，总体方向应沿着静脉、淋巴回流的方向进行向心性按摩。我们知道，双足位于身体的最下端，承受着身体的重量，而且又是离心脏最远的部位，加上地心引力的作用，所以双足的末梢循环比较差。而通过向心性的按摩，可以改变双足的这种循环状况，使其中的毛细血管扩张，血流量增加，降低循环外周的阻力，从而减轻对心脏的负担，同时又可以增加回心血量。
2.按摩程序
在按摩足部反射区时，从左脚开始，先按摩6个基本反射区（也称开水道），即依次按摩肾上腺、腹腔神经丛、肾、输尿管、膀胱、尿道反射区后，按脚底→脚内侧→脚外侧→脚背→小腿的顺序进行。待按摩结束时，再重复按摩左脚的肾上腺、腹腔神经丛、肾、输尿管、膀胱、尿道反射区（再开水道）。再按上述次序按摩右脚。这样的按摩顺序符合人体客观规律，全过程的按摩时间通常以45分钟为宜。
不要在某一反射区按摩过久，可根据自己的病情需要及双足的耐受力分两次或多次按摩，中间的时间换按其他反射区，这样的按摩效果既容易接受，又可令反射区神经末梢始终保持兴奋状态，获得在相同的时间内出现不同的按摩疗效。相反，如果长时间在一个反射区施以刺激，很容易令反射区产生耐受性。