演习的总题目是：以苏联遭到法西斯德国突然袭击为背景，组织“红”、“蓝”两军的防御和战役战略总学习。苏联为“红军”，德国“蓝军”。西部特别军区司令巴甫洛夫上将指挥“红军”，朱可夫大将指挥“蓝军”。双方各自准备，设想在苏联遭到德国突然进攻时，西部边界可以发生变化的情况，为未来的战争积累一些经验和宝贵资料。斯大林十分重视这次演习，要求各军区和各集团军司令员等所有重要政治、军事官员自始至终参加这次演习。他还多次召见演习的总导演铁木辛哥，详细询问了演习的准备情况。
在这次演习中，朱可夫率领的“蓝军”获胜，根据斯大林的建议，总讲评在克里姆宫里进行，总参谋长梅列茨科夫报告了演习的经过，当他谈到双方力量对比的数字和“蓝”军在演习开始阶段的，特别是坦克和空军的优势时，斯大林不禁打断他的话说：“参谋长同志，不要忘记，决定战争的胜负的因素除了数量上的优劣，还有指挥员和军队的作战艺术。”
演习讲评的第2天，斯大林召见了朱可夫。斯大林对朱可夫在这次演习的表现很满意，又加上他先前对朱可夫的印象良好，于是他以政治局的名义认命朱可夫接替梅列茨科夫，担任总参谋长的职务。
朱可夫上任后，苏联的国际形势已经岌岌可危，德国军队进攻苏联的战略意图非常明确。但是斯大林错误地估计了形势。他认为：德军对苏战争中首先是力图占领乌克兰和涅茨克河域，以夺取苏联最重要的经济地区，夺取乌克兰的粮食、顿涅茨克的煤，以及高加索的石油，因为这些重要的战略物资是德军进行长期、大规模战争的基础。
由于他错误地判断了德军的进攻方向使苏联红军在战争初期遭受了惨重的损失。
斯大林忽略了德军赖以称霸欧洲的“闪电战”，而1941年6月，希特勒统帅部选定的主攻方向又恰恰在斯大林没有预料到的西部方向。希特勒在白俄罗斯方向集中便用了最强大的陆军和空军集团，企图在最短的时间内攻破莫斯科。
朱可夫通过详细的侦察得知，德国法西斯军队已经在苏联西部边集结了大量军队，形势十分危机，朱可夫决定调动部队，针锋相对。
但是斯大林仍然犹豫不决，他怕触犯德国，影响两国关系，又怕给德国抓住把柄以发动战争，斯大林为了延缓战争发生，保持国内和平费尽了心思，但战争还是来了。
1941年6月20日深夜，基辅军区参谋长向朱可夫报告，从一个德军投诚司务长口中得知，德军已经进入出发阵地，德军将在6月22日凌晨全面发动进攻。
6月22日凌晨3时零7分，黑海舰队司令奥克恰面里海军上将报告，有大量来历不明的飞机正向苏联海岸接近。3时30分，西部军区报告，德军空袭白俄罗斯的城市。3分钟后，基辅军区报告，乌克兰的城市遭到空袭。3点40分，波罗的海沿岸军区报告，敌机空袭考那斯和其他城市。
战争终于爆发了。德国政府已正式向苏联宣战。直到此时还犹豫不决的斯大林在朱可夫和铁木辛哥的力劝下，才勉强下了命令任朱可夫担任西南方面军统帅部代表，立即动用各边境军区所有的兵力猛烈还击敌人的进攻，制止其继续前进。
朱可夫雷厉风行，在与斯大林谈话后40分钟就已经乘上飞机起飞了。他于22日黄昏时分，赶到了位于基辅市中心的乌克兰共产党中央委员会大楼。赫鲁晓夫正在等他。两位老朋友此时相见，倍感亲切。赫鲁晓夫关切地说：“不要再往前飞了，否则有危险。德军飞机总是追逐我们的运输机，应当坐车去。”朱可夫听从了赫鲁晓夫的安排。
随后，朱可夫乘车到塔诺波尔去，那里是西南方面军司令员基尔波斯上将的指挥所。深夜时分，朱可夫赶到目的地。下车他顾不上和高级军官们寒暄，立刻要通了瓦杜丁的电话。
瓦杜丁报告说：“到6月2日此刻，尽管采取了有力措施，总参谋部仍无法从各方面军和空军司令部获得我军和敌人的准确情报。”
朱可夫亲自赶到担任主攻任务的机械第8军的指挥所。这位军长是朱可夫的老部下。利亚贝舍夫拿着地图向朱可夫报告了部署，安排干净利索，句句击中要害。
这时屋外传来一阵飞机俯冲的尖叫声和炸弹声。朱可夫看到利亚贝舍夫和在场的军官们都有条不紊地工作，就像在野外习时一样。朱可夫心中暖融融的，心想：“真是好样的，到底还是老部队过硬，有了这些人，我们是不会打输的!”
6月24日，按照统一部署，机械化第8军在别烈斯贴奇科方向转入进攻，机械化第15军在腊迭霍夫以东进攻。这两个军的出色战斗，使德军第1装甲集团的第48辆摩托化军陷入十分危急的境地。德军统帅部调动了全部空军到这一地域抗击苏军的反突击，才使第48摩托化军免遭全军覆没。
在朱可夫的指挥下，西南方面军胜利实施了最初的一系列反突击。德国陆军总参谋长在这一天的日记里写道：“敌人以大量坦克兵力在第1坦克集群的侧翼转入进攻。”
对这次战斗，朱可夫并不甚满意，他认为，如果他手中有更多的航空兵用来与机械化军同作战，可能会取得更好的效果。
朱可夫分析：莫科斯方面的德军，由于损失太大，短期内不可能实施战略进攻；列宁格勒方面的德军，在得到兵源补充之前，也不可能夺取列宁格勒；乌克兰的德军正在与苏军对峙，朱可夫认为，苏联最薄弱的是中央方面军，德军很可能利用这个弱点向西南方向军的侧翼实施攻击。
当斯大林召见朱可夫时，朱可夫根据当前敌我形势的分析，建议首先加强中央方面军，至少还要增加3个集团军。西南方面军必须撤过第聂伯河，把兵力集中起来，避免被敌军包围。
放弃基辅，在西部方向马上组织兵力夺取叶利尼亚的突出部。
对于当时的原苏联人来说，基辅意味着生命，他们对这个地方倾注了太多的感情，自然朱可夫这个建议无异于在斯大林头上丢了个炸弹，不明形势所迫的斯大林生气指责朱可夫完全在乱弹琴。
1941年秋，朱可夫大将在列宁格勒前线。以后的事实证明朱可夫是完全正确的。基辅会战历时一个半月，最后以苏军惨败告终，65万苏军官兵被俘，大量物资装备落入了敌人手中。
8月中旬，朱可夫率部向叶利尼亚地区的德军发起进攻。战斗异常激烈，双方在所有地段同时展开激战，德军企图以密集的大炮和迫击炮火力阻止苏军进攻，朱可夫则成竹在胸，沉着应战，下令动用所有的飞机、坦克、大炮和新研制的“喀秋莎”火箭炮猛烈还击。
9月6日，苏军最终攻占了叶尼亚，歼敌近5个师，共5万余人，这是苏德战争开始以来苏军取得的第一次重大的胜利，苏军的士气空前高涨，坚定了战胜德军的信心。
朱可夫又被斯大林召回莫斯科，派往形势危急的列宁格勒。
4.保卫列宁格勒
列宁格勒原叫彼得堡，是彼得大帝在1703年建立的“西方的窗户”，此后一直作为俄罗斯的帝国首都。
正是在这里，俄国的共产党于1917年11月夺取了政权。列宁格勒是苏联第二大城市，有300多万居民，是苏联最重要的海港和重要的工业、文化中心。
列宁格勒的重大意义，苏德双方都十分清楚，1941年7月，希特勒就决定将列宁格勒和莫斯科夷为平地。8月底，西北方面的德军进逼列宁格勒。9月8日，德军完成了对宁格勒的包围，并开始收紧夹攻的铁钳。
负责驻防此城的苏军统帅伏罗希洛夫彻底感到绝望，他甚至跑到火线上，希望被德国人打死，苏军士兵的士气也极为低落。斯大林不得不重新启用朱可夫，要他来保卫列宁格勒。
朱可夫上任后立即着手整顿士气和纪律问题。他一到前线就发现第8集团军纪律松懈，如同一盘散沙，有些师长没有接到命令就擅自退出战斗，不少战士一听到枪声就跑，朱可夫认为对于这些状况必须采取最严厉的措施。
于是他颁布命令，凡是失职者都要处决。为了使命令具有威力，他逮捕并处决了一批投敌叛国的擅离职守的军官和士兵，并将一些不良风气弥漫的连队解散，士兵重新分配。对军队机关中不负责任、形式主义严重的不良作风，朱可夫也大力整顿。
经过整顿，部队的战斗力大大提高了，朱可夫精心制定了一个加强城防的计划。苏军在最危险地段和战略要地集中了大量的高炮、舰船，并调集兵力建立了纵深防御。
朱可夫和高级将领们面临着巨大的压力，在高度紧张的气氛中，朱可夫显得态度烦躁。但他对士兵们仍旧保持友好的态度，对于那些没有责任感的军官特别是中高级军官则大声训斥。
朱可夫的精心防御有效地阻止了法西斯军的进攻步伐，这使布特勒大为恼怒，他下达命令猛攻列宁格勒，即使不能用武力取胜，也要用封锁的把城里人困死，然后将城市摧毁。
朱可夫面临的形势更加严峻了，他手下的军队不但要进行残酷的防御战斗，还要应付空袭、炮轰，而且还要应付更严重的饥饿。
为了加强防御，朱可夫把全城分为6个防御地段。每个地段都建立了以营防御区为基础的坚强阵地，此外，又组织了所有的妇女在全城修建路障，在城周围挖防坦克堑壕。
朱可夫在进行地面防空建设后，还作了最坏的打算，就是德军突入列宁格勒后的应变措施。朱可夫命令在工厂、桥梁和公共设施内部安装了地雷，如果敌人进入了城市，把这些建筑物连同敌人一同炸掉，朱可夫还给居民们发放了武器弹药，做了大量的组织发动工作，使列宁格勒变成了一座攻不破的堡垒。
由于固守列宁格勒的苏军做了充分的准备，所以尽管苏军在城市周围某些地段发起的反攻未获成功，但他们得以与进攻的德军对峙达50天之久，打破了德军从南北两个方向夹攻、以夺取列宁格勒的计划。到9月底，列宁格勒几个方面的战线都处于稳定状态。
德军为了“彻底摧毁”列宁格勒，除了陆地上封锁外，还进行了系统的炮轰和飞机轰炸。
第1次轰炸是在9月8日，但规模最大的则是9月21日至23日的轰炸，约有400架轰炸机参加了他们选定的主要轰炸目标，企图摧毁喀琅施塔得要塞和红旗波罗的海舰队。
9月至10月，德军的飞机进行了数百次袭击。虽然，这些轰炸未达到目的，但毕竟给朱可夫及军带来了极其困难的局面。后勤供应基本中断，只剩下的唯一途径就是被称为“生命之路”的拉多加湖水道。通过这一水道进的食品和弹药只能最低限度地满足官兵们的需要，特别是粮食的需求更加恶化。
9月至10月，居民的面包定量先后降了5次，10月至20日降到最低限量，即高温车间的工人每人375克，一般工人和技术人员250克，职员和儿童125克。可以想象，这么点粮食会出现什么情况呢？不少妇女在挖工事时，饿得一头倒在地上再也起不来了；工人安装机器时，一下子倒在机器上再也唤不醒了。为了节省体力，对路旁的尸体，人们也懒得去进行安葬。
在这种困难的情况下，红军在朱可夫的指挥下仍然英勇作战，一次又一次把红了眼的德军打退到他们的进攻出发地。到9月底，敌人终于相信，列宁格勒的防御十分坚固，依靠现有兵力是无法摧毁它的。剩下的办法只有一个，那就是围困列宁格勒，企图使苏军丧失战斗力，不战而胜。
可德国的企图最终还是失败了。1943年3月初，苏军开始全线反攻，终于结束了长达一年多的列宁格勒保卫战。
列宁格勒保卫战的胜利是空前的，它不仅坚定了苏联人民必胜的信心，打击了德军的气焰，而且牵制了德军大量的兵团，对其他战场形势的转变起了重要作用。朱可夫对于这个战役的胜利，作出了巨大贡献，的确是功不可没。
朱可夫在作战役准备。
5.莫斯科会战
1941年10月上旬，德军知道列宁格勒是攻不下的。于是，集中了100万多人、1700多辆坦克和1900门大炮，在空军掩护下，又对莫斯科发动了猛攻。
斯大林又一次将这场关系苏联生死存亡大战的指挥棒交给了朱可夫。
10月10日，斯大林给朱可夫打来电话，正式通知他，最高统帅部决定任命他为西方方面军司令员。最后，斯大林以命令的口吻在电话中大声说：“赶快把一切都抓紧干吧!”
很快，朱可夫就接到最高统帅部于1941年10月10日17时发布的命令：
1、西方方面军和预备防方面军合并为西方方面军。
2、任命朱可夫同志为西方方面军司令员。
3、任命科涅夫同志为西方方面军副司令员。
4、任命布尔加宁同志、霍赫洛夫同志和克鲁格洛夫同志为西方方面军军事委员会委员。
5、朱可夫同志于1941年10月11日18时开始指挥西方方面军。
6、撤销预备方面军指挥机关，用以补充西方方面军和莫斯科战线的预备队。
接到命令后，朱可夫立即出发去西方方面军司令部。方面军司令部临时设在几个帐篷内，朱可夫走进帐篷后立即投入了战役的组织工作。
熟悉朱可夫的人都知道，他是一个意志坚强、处事果断、具有杰出才干和天赋的人，也是一个要求严格、持之以恒、目标明确的人，所有这些品质对于一个精明强干的军事首长来说，是必不可少的。
在莫斯科会战最激烈的日子里，朱可夫的严厉粗鲁几乎达到了令人无法容忍的程度。可正是由于他的个性品质，才使他在国家与民族危难的时刻，能够挑起挽救莫斯科和整个国家的千斤重担，能够组织起保卫莫斯科的有效防御。
朱可夫以他特有的充沛精力和工作效率，开始实施这新的使命。他通过实地考察军情，制定了一系列战略方针：莫斯科正西方面组织了一条牢固的防御带；加大纵深防御，建立第二梯队和方面军预备队，随时听候调动；组织有效的地面和空中侦察，以加强对方面军各部队的指挥；安排好军队的物资保障；增强战士们必胜的信心。最让朱可夫头疼的问题是兵力不足，现在的部队根本无法有效地驻守136公里长的防线。最高统帅部竭尽全力从其他地方调集了14个步兵师，16个坦克旅，40个炮兵团，以解燃眉之急。
与此同时，莫斯科几十万居民不分昼夜地构筑保卫首都的防御工事。他们修筑了7.2万米长的防坦壕、近9万米长的峭壁和断崖，设置了5万多米长的障碍物地带，挖掘了近12万米的战壕和交通壕。这些用居民双手挖出的300万多立方米土壤，建立起一个颇为壮观的环形防御圈。
前线的苏军官兵知道，全国人民都在为保卫莫斯科作最大的支援，这种军民同仇敌忾的团结精神，是苏军取得莫斯科保卫战胜利的鼓舞力量和坚强支柱。
11月上半月，苏德军队双方都作了新的调整和补充，莫斯科附近一场更大规模的生死决斗即将开始。