百日咳的治疗，我采取：初咳期开肺，痉咳期泻肺，恢复期润肺三大治法。
本病初期的咳嗽，虽状如感冒，但有咳声不扬，咳呈连续性，且逐渐加重，夜间甚于白天的特点。此期治疗，及时祛邪肃肺，开宣肺气，常用药为麻黄3克，杏仁10克，生甘草6克，南烛子10克，天将壳10克，桔梗5克，百部6克。这对百日咳早期具有寒象者为适宜。如已出现痉咳征象，而尚未化热化火者，可加入炙细辛(5岁以下不超过2克)、五味子各3克，以佐温散肺经之寒，摄纳肾经之冲气。
痉咳期是由痰火交结，而为阵阵痉咳。此期治疗，重在涤痰泻火，可用礞石滚痰丸30克煎服，导痰下行。如阵咳剧烈，频繁呕吐或气急憋气者，乃心肝之火刑金犯胃，宜苦寒泻火、降气镇逆并用。药如：川黄连5克(亦可用龙胆草10克)，代赭石15克，葶子10克，姜半夏6克等。亦可酌加蜈蚣、僵蚕祛风镇惊，缓解痉咳。
恢复期的咳嗽，多呈干咳状，痰少而黏，不易咯出，属阴虚燥咳，治宜润燥养肺。服用南北沙参各12克，天麦冬各10克，杏仁10克，款冬花10克，佛耳草10克，黛蛤散10克，川百合10克。
为了便利小儿服药，每剂量取60～100毫升，加入冰糖、蜂蜜适量，分3～4次服。