结肠镜主要是检查结肠大肠病变。如经X光检查有息肉、溃疡、肿瘤以及有不能确诊的可疑病变；原因不明的便血，慢性腹泻以及疑有下消化道恶性病变者；慢性非特异性溃疡，慢性结肠炎溃疡；结肠病变需确诊部位、范围及性质者；或需要观察治疗效果者；结肠术后随访；用结肠镜治疗结肠息肉及消化道出血等情况，皆需要做纤维结肠镜检查。
做纤维结肠镜检查前，①要查肝功能、乙型肝炎表面抗原，以便乙型肝炎表面抗原阳性者和阴性者用不同的镜子；②结肠要清洁；③检查时结肠要适当充气。
查乙肝表面抗原之后，预约检查结肠镜的时间。在检查前两日吃少渣半流食，每日三餐吃米粥，不吃蔬菜水果。检查当日早晨禁食；上午10点30分开始口服温热后的20%甘露醇250毫升，并立即饮白开水1000毫升；中午可吃少量干食；下午1点30分到内窥镜室等候检查。
检查时病人不要紧张，要全身放松。检查之后，不要马上进食，待结肠内气体排出，腹胀消失后可进易消化流食。
有以下情况者不能做纤维结肠镜：严重心脏病病人或身体衰弱不能耐受者；严重高血压病，肺功能不全、脑循环障碍者；肠道狭窄，近期手术有穿孔可能者；曾做过肠道放射治疗并发生肠道放射性坏死者；下消化道急性炎症、腹腔炎、肛周脓肿、肛裂者；传染病及精神病病人以及妇女经期等均不宜做此检查。