农药在防治农业病虫害，去除杂草，促进农作物生长方面有重要作用。但在施用农药的过程中，农作物、畜类、水产品等动植物都可能受到农药的污染，不可避免地会以各种形式侵入人体。有些农药，如有机氯农药“六六六”、DDT等，稳定性强，不易分解，一旦进入人体，就易形成蓄积。经上海市调查，我国人体脂肪中蓄积的有机氯农药量，六六六平均为9.52毫克/千克，DDT平均为22.95毫克/千克。食物是农药进入人体的主要来源。由于农药污染食品而发生急性食物中毒者也不少见。
常用农药中有机氯、有机汞、有机磷农药及2.4.5T-（2.4.5-三氯苯氧乙酸）有胚胎毒性。有人发现于乳汁中检出了DDT的189例母亲的婴儿中，有8例出现发育缺陷，如足内翻、先天性髋关节脱臼、多指畸形等。而母亲乳汁中未检出DDT的对照组妇女的婴儿中则无畸形发现。有机汞农药西力生、赛力散及甲基汞等，主要作为杀菌剂用于麦种的灭菌消毒。动物实验发现有机汞农药有致畸作用。自发生先天性水俣病以来，甲基汞对孕妇胎儿发育的影响已被证实。目前我国及其他许多国家已禁止生产有机氯及有机汞农药。
有机磷农药是目前农业上使用较为广泛的农药，用量大，品种多，杀虫效率高。国内外对有机磷农药的致畸性进行了大量研究。有机磷农药可通过胎盘屏障进入胎儿体内。动物实验资料表明，较低浓度的滴百虫（Q005～。02毫克/米3）即可引起胎儿的四肢骨骨化不全，当浓度增高到0.2～9毫克/米3时，且可出现各种内脏畸形、脑发育不全等。对孕妇胚胎发育有无影响，报道甚少。有人报告，甲基内吸磷中毒的妇女，呈现月经周期紊乱、妊娠障碍及死胎。所以妊娠妇女应该避免接触有机磷、汞、氯农药。