脏腑学说是以五脏为中心，以心为主导，以经络为联系，研究人体脏腑的生理功能、病理变化、疾病诊断、治疗预防，以及和外界环境相互联系的学说，是中医整体观的理论基础。
五脏，指心、肝、脾、肺、肾；六腑是指胃、小肠、大肠、膀胱、胆囊、三焦。除五脏六腑外，还有奇恒之腑，是指脑、骨、髓、脉、女子胞(子宫)及胆囊。
人体以五脏为中心，以心为主导，成为一个有机整体，五脏各自有生理功能。六腑也有各自的生理功能。而五脏的共性生理功能，主要是生化和贮藏精、气、血、津液和神，以藏为主；六腑的共性生理功能，主要是饮食的受纳、消化、吸收，分别清浊、排除废物，以通为主。
五脏之间，由于经络的广泛联系而密切相关；而五脏与六腑之间亦相互联系，形成人体内六对重要的相配内脏，如脾与胃、肺与大肠、肾与膀胱、肝与胆、心与小肠、心包与三焦。五脏与体表各种组织亦相联系，如肺与皮毛、脾与肌肉、肝与筋(肌腱)、肾与骨骼、心与血脉。五脏又与五官及肛门、尿道相联系，如心与血脉，肝、肾与子宫，肾与骨、髓、脑。
脏腑学提出，经络在人体内起着广泛联系的重要作用，它将人体组成一个有机的整体。经络在中国传统医学体系中是一个重要的组成部分，它与脏腑学说密切相关、不可分割。
阴阳学说指出，人体外有阴阳、内有阴阳。在外，天为阳、地为阴，日为阳、月为阴，昼为阳、夜为阴，春夏为阳、秋冬为阴。五脏为阳，六腑为阴。五脏之中又分阴阳，如脾有脾阴和脾阳，肾有肾阴和肾阳，并且相互依存、消长、转化及调节，以保持脏腑之内和脏腑之间的功能活动及相对平衡。
脏腑学说提出，人体内脏腑机能的变化，决定着它属阴或属阳，而不是阴阳发生了变化，才使脏腑机能引起变化。
脏腑学说应用，有两方面第一，诊治上的应用，中医诊病可以用十个字概括，即内外法、整体观及辨证论治；而脏腑学说则是强调整体观。
人体阴阳属性表
类别阳阴人体部分表
背
上部黑
腹
下部组织结构皮毛
六腑
气
卫筋骨
五脏
血
营病症表症
实症
热症里症
虚症
寒症脉象数脉
浮脉
滑脉
实脉迟脉
沉脉
涩脉
虚脉预防发病方面，所谓“正气存内，邪不可干；邪之所凑，其气必虚”。
《内经》中便提出在不同季节里，要适应外界环境的变化，采用不同的起居方式，以维护人体内脏腑的正常生理机能，达到抗御疾病的目的。
《内经·素问·四气调神大论》有云：“春三月，夜卧早起，广步于庭，逆之则伤肝；夏三月，夜卧早起，无厌于日，逆之则伤心；秋三月，早卧早起，与鸡俱兴，逆之则伤肺；冬三月，早卧晚起，必待日光，逆之则伤肾。”
中医学的理论体系中有“藏象学说”。“藏”，即指隐藏于人体内部的内脏；“象”就是人体脏腑的解剖形态及内脏的生理、病理反映于外的现象，只要通过望、闻、问、切四诊便可以知道。故“藏”为内，而“象”为外，两者密切关联。如通过观察筋、爪、目等的色泽形态、功能上的变化，可探测肝功能是否完好。
健康失常，首先出现的都是症状，都是机体在病邪作用下一种异于平常状态的反映。
中医所重视的是证，证不同于症状，证是人体在接受致病因子的作用下，脏腑功能、阴阳平衡协调的状态被破坏后的一种表现，是人体一种生理失常的状态，这可以从人体的症状、脉象、舌苔等方面表现出来。根据中国医学理论，可以分为六经辨证的太阳证、阳明证、少阳证、少阴证，或是温病辨证的卫生证、营分证、血分证；又或是脏腑证的阴虚证、温热证等等。