在洪水、暴雨等灾害发生时，饮用水时常会受到污染。这时饮用水的选择就显得至关重要。
洪灾过后，往往引发各种疾病的传播和流行。这些常见的疾病有：伤寒、肝炎、霍乱、痢疾、感染性腹泻等肠道传染病；疟疾、乙型脑炎等因蚊虫叮咬而传播的疾病；流行性出血热、钩端螺旋体病；食用霉变食物而引起的食物中毒；与患有疾病的家畜如牛、马、羊、猪的接触机会增多，可能传播给人；长江中下游血吸虫流行区，洪水时钉螺面积扩大，接触阳性螺区疫水，易发生血吸虫病急性感染。这些疾病的临床表现分别是：
1.伤寒：持续性高热、全身中毒症状、肝脾肿大、白细胞减少、相对缓脉(脉搏与体温不成比例)、皮肤玫瑰疹；还可有肠出血，肠穿孔等并发症。
2.霍乱：以剧烈无痛性泻吐，米泔样大便，严重脱水，肌肉痛性痉挛及周围循环衰竭等为主要特征。
3.痢疾：以腹痛、里急后重、脓血便，便次频为主要特征。
4.疟疾：俗名“打摆子”、“冷热病”，多在夏秋季发病，病人大都突然发冷、发抖，面色苍白，口唇与指甲发紫。发冷停止后继发高热、头痛，接着就是全身大汗，体温又恢复正常。如此症状可间隔一到两天反复周期性发作。
5.乙型脑炎：一般起病急，临床表现为突然发热，恶心、呕吐、嗜睡，头痛。2～3天后出现昏迷、抽搐，颈项发硬，不及时抢救可导致死亡。
6.流行性出血热：起病较急，发热是本病的首发和必有的症状。体温可高达39℃-40℃之间，热程多数为3-7天，有的可长达10天以上。一般体温越高，热程越长，则病情越重。多数患者在发热末期或热退的同时出现血压下降，持续约1～3天后，患者可出现肾脏损伤症状。
7.血吸虫病：起病较急，有畏寒、发热、腹痛、腹泻、食欲不振和肝脾轻度肿大。反复多次感染血吸虫，大多表现为慢性血吸虫病。轻者无自觉症状；重者常腹痛、腹泻和粘液血便，并有不同程度贫血、消瘦、营养不良、肝脾肿大；晚期病人出现肝硬化、腹水及门静脉高压症；病人常因肝功能损害和上消化道大出血而死亡。
灾区群众如果出现以上疾病的症状，应尽快到专业医疗机构接受治疗，并及时向相关卫生防疫部门报告。
要做到灾后无大疫，饮水消毒是关键。
饮水消毒最常用的方法是氯化消毒和煮沸消毒。煮沸是十分有效的灭菌方法。在有条件时可采用过滤方法。但在洪涝灾害期间，最主要的饮用水消毒方法是采用消毒剂消毒。下面介绍两种常用的水源氯化消毒方法：
缸水消毒：先将水缸中的水自然沉淀或用明矾澄清，然后将漂白粉精片碾碎用冷水调成糊状，按每100斤水加1片漂白粉精片或10％漂白粉澄清液1汤匙。储存的缸水用完后应及时清除沉淀物。
受淹水井消毒：应在水退后立即抽干被污染的井水，清淘出污物，对自然渗水进行一次重消毒(加氯量20—30PPm)后，方可正常使用，并且一定要坚持经常性的为井水消毒。
灾后水源的选择与保护也是维持人体安全的重要方面。应在洪水上游或内涝地区污染较少的水域选择饮用水水源取水点，并划出一定范围，严禁在此区域内排放粪便、污水与垃圾。有条件的地区宜在取水点设码头，以便离岸边一定距离处取水。
无自来水的地区，尽可能利用井水为饮用水水源。水井应有井台、井栏、井盖，井的周围30m内禁止设有厕所猪圈以及其他可能污染地下水的设施。取水应有专用的取水桶。有条件的地区可延伸现有的自来水供水管线。
加强供水设施消毒。被洪水淹没过的水源或供水设施重新启用前必须清理消毒，检查细菌学指标合格后方能启用。经水淹的井必须进行清淤、冲洗与消毒。先将水井掏干，清除淤泥，用清水冲洗井壁、井底，再掏尽污水，待水井自然渗水到正常水位后，投加漂白粉浸泡12～24小时之后，抽出井水，待自然渗水到正常水位后，按正常消毒方法消毒，一般一吨水加漂白粉4克，如污染较重加漂白粉8克/吨，即可投入正常使用。
洪灾时饮用水源或供水系统遭到严重的污染或破坏；洪水退后，动、植物体的腐烂，大小水体的存在等造成蝇、蚊的大量孳生。因此，洪灾后认真搞好消毒工作与媒介生物的控制是防止灾后出现大疫的重要卫生防疫措施之一。
粪便处理不好，极易污染水源，孳生蝇类。灾民安置点设临时厕所，不随地大小便。粪便消毒采用10份粪水加1份漂白粉，搅拌，2小时后倒在指定地点掩埋。肠道传染病人的粪便，按5份与漂白粉1份的比例，或加等量生石灰，搅匀2－4小时后，倒在指定地点掩埋。
对洪灾造成的动物尸体，要及时进行消毒、深埋在1.5～2米以下。掩埋点须选在地势高、远离水源处。尸体选用10％漂白粉澄清液，按200毫升／平方米用量喷雾，1～2小时后掩埋，掩埋时再用漂白粉干粉20～40克／平方米的量洒盖于尸体上，然后覆土掩埋。运输车辆、使用的工具，用1－2％的漂白粉澄清夜喷雾，1小时后方可作他用。
正确选择灾后饮用水和灾后的检验检疫及消毒是灾后的重要措施，一旦选择错误或操作不当，就会对人类造成难以估量的损失。