艾弗里的工作发表后，遭到了许多科学家的反对，他们不相信DNA能成为遗传信息的载体，怀疑艾弗里的实验手段不够严密，将少量的蛋白质带了进来，而恰恰就是这少量的蛋白质起了遗传作用。艾弗里本人也没能顶住传统观念的压力，只做出“DNA是个别细菌类型中特殊遗传性的携带者”的结论，并说：“可能不是核酸的自有性质，而是由于微量的附着于核酸上的其他物质起了遗传信息的作用。”
来自物理学的冲击
基因的奥秘最终被揭开，是物理学家、化学家、生物学家几路大军协同攻关的结果。
30年代，物理学正经历着一场革命——量子力学创立了。作为量子力学的旗手，著名的物理学家尼尔斯·玻尔把世界上一大批杰出的学者吸引到了丹麦的哥本哈根，他们不仅讨论物理问题，有时也涉及生物学问题，试图用刚问世的量子力学来解释基因突变等问题。
1932年，在哥本哈根举行的国际光疗会议上，玻尔作了《光和生命》的著名演讲。他有关物理学规律与生物学规律互补的哲学思想深深打动了一位年轻的物理学家，他就是德尔布吕克。
德尔布吕克1906年出生于德国柏林，大学时攻读的是原子物理学，曾担任过著名物理学家迈特纳的助手，并在玻尔实验室工作过。他被神秘的基因所吸引，深感这是解开生命奥秘的一把钥匙。因此，他决定放弃原子物理学研究，转向生物学研究。
1937年，德尔布吕克来到美国加利福尼亚工学院摩尔根的研究基地果蝇实验室，从事遗传学核心问题——基因复制的研究。那时一些生物学家已开始用大肠杆菌、噬菌体代替果蝇进行遗传学研究。这立即引起了他的重视。
噬菌体是一种病毒，比细菌小得多，它能够侵入细菌，在20分钟内就繁殖出数百个后代，致细菌于死地，因此人们叫他噬菌体。噬菌体的结构非常简单，只有一个蛋白质外壳，里边包着DNA，可以说是一个包着蛋白质外壳的自由基因组，因此是研究基因和遗传信息传递的最好材料。
德尔布吕克与从意大利来到美国的生物学家卢里亚、美国生物学家赫尔希建立了闻名世界的噬菌体研究小组。他们每年夏天都要在纽约附近的冷泉港举办“噬菌体”暑期讲习班，团结和培养了一批年轻有为的科学家，被人们称为遗传信息学派。他们应用噬菌体技术，进行了许多出色的工作，其中最重要的工作之一，就是确凿无疑地证明了DNA是基因的化学实体。
实验是由赫尔希和他的学生蔡斯做的。他们巧妙地应用同位素标记技术，使噬菌体内的DNA标记上放射性同位素磷，使噬菌体的蛋白质膜标记上放射性同位素硫，然而观察放射性磷和放射性硫的行踪，这样也就可以知道DNA和蛋白质的行踪了。
他们让标记过的噬菌体去感染大肠杆菌，结果发现，噬菌体在进入大肠杆菌时，先来了个金蝉脱壳，把蛋白质外壳留在了大肠杆菌的外边，只有DNA分子进入大肠杆菌，而正是这个DNA分子，在大肠杆菌中繁殖出许多新的噬菌体。这就清楚地表明了，噬菌体的遗传物质是在DNA上，它不仅包括了DNA自我复制的信息，而且还包括指导外壳蛋白合成的信息。
这个实验一公布，立即得到了人们的公认。一旦认定了DNA的作用，一场全力以赴搞清DNA的结构，揭示遗传之谜的竞赛就在世界上许多个实验室中激烈地开展起来了。
德尔布吕克、卢里亚、赫尔希因从事噬菌体研究，对创立分子生物学作出的贡献，1969年共获诺贝尔生理学或医学奖。
在谈到物理学家对生物学的影响时，还必须提到的另一位科学家就是量子力学的创始人之一薛定谔。他在1944年出版了著名的《生命是什么》一书，提出染色体是由化学成分相同而结构不同的单体组成的。单体严格、精确排列，构成了遗传密码，就像莫尔斯的电报用点和线（·—）排列，构成大量信息一样。这本书启发了人们用全新的物理思想和方法来研究生物学，吸引了一大批有才华的年轻物理学家转向生物学研究，叩开了分子生物的大门。
发现DNA双螺旋结构既然DNA是遗传的关键物质，那么它一定有复杂的结构，以一定方式携带各种遗传密码，并使它们能一代代传递下去。
怎样才能知道DNA的分子结构呢？用光学显微镜可以看到细胞以及细胞中的染色体。可是要观察分子结构，光学显微镜就无能为力了。科学家们搬来了新武器，那就是X射线衍射技术。
X射线衍射技术是1912年由英国物理学家布拉格父子开创的。X射线的波长很短，和晶体内原子（或分子）间的距离相近。因此，当一束X光通过晶体时就会发生衍射，射线的强度在某些方向上加强，某些方向上减弱。分析这种衍射图样，就可以确定晶体内部原子间的排列和距离。
小布拉格的学生阿斯特伯里首先用X射线衍射法来测定核酸和蛋白质的结构。尽管他们拍出的照片质量不高，但是已经可以看出，核酸和蛋白质都是折叠的卷曲的长纤维。
50年代初，随着对DNA作用认识的深入，更多的科学家投入了对核酸结构的研究。其中有三个著名的小组，一个是英国皇家学院的晶体衍射专家维尔金斯和年轻的女科学家弗兰克林。
他们制成了高度定向DNA纤维，拍摄到了非常清晰的DNA X射线衍射照片。正是这张照片为DNA双螺旋结构的发现提供了极其重要的依据。
另一个是美国加州工学院著名的结构化学家鲍林。在此之前，他已经建立了蛋白质以肽链为骨架的α螺旋结构，他对DNA结构提出了三链模型。
而最后捷足先登，发现DNA双螺旋结构的是在英国卡文迪什实验室工作的美国年轻生物学家沃森和英国物理学家克里克。
沃森1928年出生于美国芝加哥，大学时在美国芝加哥大学学习动物学，后获博士学位。还在学生时代，他就被薛定谔的《生命是什么》一书迷住了，这本书决定了他一生的道路，那就是揭开生命之谜。
大学毕业后，他来到著名的遗传信息学派卢里亚的研究所，专门进行噬菌体研究。1951年，23岁的年轻有为的沃森被派到英国剑桥大学卡文迪什实验室深造。
在卡文迪什，沃森遇到了英国伦敦大学毕业的物理学家克里克。克里克比沃森年长12岁，他也是被薛定谔的《生命是什么》一书打动，转向生物学研究的。他曾和著名的结构派佩鲁茨等人一起从事过血红蛋白的X射线结晶学研究，在研究X射线衍射照片方面有很高的造诣。
沃森与克里克一见如故，他们发现彼此都对基因分子感兴趣。一个生物学家，一个物理学家，一个遗传信息学派，一个结构学派，组成了理想的搭档，开始了揭开基因奥秘这一生物学史上激动人心的合作。
当时的DNA射线衍射照片表明，DNA很可能具有螺旋形几何形状。沃森和克里克先建立了一个三链的模型，但很快就被指出是错误的。由于没有清晰的高质量照片做实验依据，他们的研究进展甚微。
1953年2月，当沃森参观皇家学院实验室时，看到了威尔金斯和弗兰克林拍摄到的那张非常出色的DNA的照片。威尔金斯小组认为照片排除了双链的可能性，可是照片中央那小小十字架图样却牢牢吸引住了沃森，他敏锐地意识到，DNA分子很可能是双链结构。
他和克里克立即投入了建立双链模型的研究。沃森后来这样形容他们这一点的工作：兴趣盎然、个人摩擦、令人沮丧的失败和突如其来的灵感交错在一起。
他们建立的双螺旋结构是以核苷酸中的糖和磷酸为骨架，碱基两两相联夹于螺旋链之间。DNA有4种碱基：腺嘌呤（A）、脑腺嘧啶（T）、鸟嘌呤（G）、胞嘧啶（C），起先他们让相同的碱基配对，如A基与A基配对，T基与T基配对。但是这种对称式配对方式却使两条链发生扭曲。
正当他们伤脑筋时，美国生化学家查哥夫对DNA的研究成果给了他们很大帮助。查哥夫发现，在他分析的每个DNA标本中，A和T的数目相等，G和C的数目相等，而A、T与G、C的比例则随生物物种的不同而变化。
经过深入研究思考，沃森和克里克终于找到了答案，那就是让A基和T基配对，G基和C基配对，DNA的双螺旋结构被发现了！
其实，当时已接近发现DNA双螺旋结构的不止沃森和克里克。鲍林由于陷入了三迭链的错误设想中而功亏一匮，威尔金斯和弗兰克林又没有能跳出蛋白质的单螺旋结构而错失良机。年轻的沃森和克里克既没有鲍林那样丰富的学识和经验，又没有像威尔金斯和弗兰克林首先掌握了第一手资料，他们为什么能战胜对手，捷足先登呢？这不仅仅是因为他们个人的智慧和想象力，两个人知识互补、相互配合，而且因为他们善于博采众长，集思广益，他们吸收了鲍林提出的氢键结合概念，从查哥夫那里知道了正确的碱基比，接受了同办公室化学家多诺休对他们模型提出的意见，争取到了数学家格里费思的帮助……正是在众人工作的基础上，最后才别出心裁地提出碱基互补的DNA双螺旋模型。不难看出，揭开基因奥秘并非一二个科学家的功劳，而是众多科学家众擎齐举的结果。
沃森和克里克的研究结果与威尔金斯小组提供的X射线衍射照片，一起发表于1953年4月份的英国《自然》杂志上。由于这一成就，沃森、克里克、威尔金斯三人共同获得了1962年的诺贝尔生理学或医学奖。
DNA双螺旋结构的发现被认为是20世纪最伟大的发现之一。
它使人们对千百年来迷惑不解的遗传之谜有了本质的了解，解释了生命为什么能一代又一代自我复制。
就在DNA双螺旋问世不久，遗传密码也被破译了。每三个碱基组成一个密码，这样一共有64个密码子，其中61个密码子与组成蛋白质的20种氨基酸相关，其余3个密码子则在制造某种氨基酸中起起动、停止等“标点符号”的作用。
UCACU苯丙氨酸丝氨酸酪氨酸〖〗半胱氨酸U苯丙氨酸丝氨酸酪氨酸半胱氨酸C亮氨酸丝氨酸终止号终止号A亮氨酸丝氨酸终止号色氨酸GC亮氨酸脯氨酸组氨酸精氨酸U亮氨酸脯氨酸组氨酸精氨酸C亮氨酸脯氨酸谷氨酰胺精氨酸A亮氨酸脯氨酸谷氨酰胺精氨酸GA异亮氨酸苏氨酸天门冬酰氨丝氨酸U异亮氨酸苏氨酸天门冬酰氨丝氨酸C异亮氨酸苏氨酸赖氨酸精氨酸A甲硫氨酸苏氨酸赖氨酸精氨酸GG缬氨酸丙氨酸天门冬氨酸甘氨酸〖〗U缬氨酸丙氨酸天门冬氨酸甘氨酸C缬氨酸丙氨酸谷氨酸甘氨酸A缬氨酸丙氨酸谷氨酸甘氨酸GDNA双螺旋结构的发现，还使人们对种种生命现象有了更深刻的认识。各种先天性遗传病，就是由于基因的异常引起的，而癌症的发生则与基因的变异、调控失灵有关……由于DNA双螺旋结构的发现，还导致了一门新的学科——遗传工程的诞生。人们可以把一个物种的遗传基因转移到另一个物种中，从而创造新的物种；还可以用正常的基因来代替修补缺损的基因等。这不仅在生物学研究中有重要意义，而且在农业、医学、环保、资源利用、发展新一代生物计算机等方面有着广阔的应用前景。
DNA双螺旋结构的发现带来了分子生物学的突飞猛进，它深刻地影响到人类生活的方方面面，使人们迎来了一个新的时代，那就是分子生物学称雄的时代。