参与“大舜”号轮打捞和善后处理工作的单位有100多个，从隶属关系看，上有国务院直属单位，下到区和乡镇、村；从单位驻地看，既有山东的单位，也有外省的单位；从单位的性质看，既有烟台预备役部队，又有武警和公安干警，还有机关、企事业单位的职工，可以说整个打捞和善后处理工作是一个多部门、多单位参加的大合唱。总的看，各级各部门各单位以对党和人民的事业、对每一个遇难者家属和车货主高度负责的态度，密切配合，团结协作，认真细致地做好每一项工作，表现了高度的政治责任感和顾全大局、顽强拼搏、无私奉献的良好精神风貌。烟台救捞局、上海救捞局在交通部救捞局的统一领导下，从外省的打捞工作现场调来性能先进的救捞船和施工设施，组织了强有力的打捞施工队伍，克服各种困难，连续作战，圆满完成了打捞施工任务。省直交通、公安、民政、环保、渔政、宣传等部门按照省委、省政府的要求和各自的职责分工，认真研究制定工作方案，积极参与协调工作。省交通厅、省航运集团及烟大轮渡公司的有关领导同志在可能要为事故承担责任的压力下，能够放下包袱，正确对待，认真负责地做好各项打捞和善后处理工作。烟台市委、市政府对“大舜”号轮打捞打捞出水后的“大舜”号轮主操作台。和善后处理工作高度重视，成立了专门的工作班子，市委、市政府分管领导多次召开会议研究协调打捞工作，承担了大量具体繁杂的任务。
“大舜”号轮在汽车舱起火后电缆被烧毁的情形。在整个打捞和善后处理工作期间，烟台市各有关部门和牟平区做出了无私奉献。烟台市交通委主要负责同志亲自参加打捞协调工作，还安排专人在现场指挥工作办公室值班服务。市公安局抽调大批警力，组成了7个专门工作组，加强打捞现场的安全保卫和社会秩序控制，认真细致地做好遇难者遗体遗物的清理、检验、辨认等工作，协助国务院事故调查处理领导小组对“大舜”号轮进行全面清理勘查，为维护社会稳定，保证打捞和善后处理工作顺利进行做出了重要贡献。民政部门承担了遇难者遗体的清理、包装、运输、火化及骨灰、遗物保管等任务，他们工作认真负责，一丝不苟，使每一个遇难者的遗体都得到了妥善处理。卫生防疫部门先后两次对“大舜”号轮进行全面消毒，有效地防止了疫病传染，保证了现场工作人员的安全。环保部门以严谨科学的态度，积极协助打捞单位完善防污方案，落实防污措施，加强打这部分“大舜”号轮用于固定汽车的系固索具并未被使用。捞现场的监视、监测，并具体承担了岸上防污工作，为防止污染做了大量工作。渔政、公安边防部门出动巡逻艇，维护打捞现场秩序，为“大舜”号轮拖航护航，保证了打捞工作的顺利进行。在这次善后处理工作中，烟台市有51个单位参与了遇难者家属和车货主的接待，这些单位以大局为重，不讲条件，勇于奉献，用热情周到的服务，为打捞和善后处理工作创造了良好的环境，赢得了来烟人员的普遍好评。牟平区委、区政府积极做好打捞现场周围村庄群众的思想工作，广大干部群众对打捞工作给予了充分理解和支持，表现了较高的思想觉悟。烟台市海事局一直密切关注打捞工作，千方百计为“大舜”号轮打捞创造条件，提供方便，他们4次发布航行通告，克服各种困难，在较短的时间内设置了3座作业浮标，派出专人进驻打捞现场监督落实各项安全和防污措施，在沉船扳正、起浮、拖航过程中，多次派出船只帮助清理油污和护航，体现了海上执法部门高度的责任心和良好的职业道德。山东省和烟台市气象台在沉船打捞期间，每天3次将海上的气象预报发给打捞施工单位，为打捞施工提供了良好服务。烟台港务局、烟台地方港务局在沉船清理、拖航的关键时刻，组织人员和设备协助做好有关工作，给予了有力支持。负责打捞协调和服务保障工作的同志，坚持到打捞第一线跟踪服务，一打捞出水的“大舜”号轮被拖往威海船厂。方面为打捞单位及时提供相关技术资料，同时加强与有关部门的衔接，科学调度运输船舶，保障了海上作业的交通需要。驻烟部队、武警官兵发扬不怕牺牲、连续作战的精神，哪有艰苦哪里上，主动为地方政府排忧解难，树立了人民子弟兵的良好形象。