3.生态危机说
玛雅文明虽然属于城市文明，但却建立在玉米农业的根基之上。自古以来，玛雅农民采用一种非常原始的耕作法：他们先把树木统统砍光，过一段时间干燥以后，在雨季到来之前放火焚毁，以草木灰作肥料，覆盖住贫瘠的雨林土壤。烧一次种一茬，其后要休耕1－3年，有的地方甚至要长达6年，等到草木长得比较茂盛之后再烧再种。当古典期文明繁盛、人口大大增加时，农业的压力也就随之越来越大了，于是玛雅人更多地毁林开荒，同时把休耕时间尽量缩短。这样一来，就导致了土壤肥力逐渐下降，玉米产量也随之越来越少。玛雅文明在人口大发展之后，面临着生态环境恶化、生活资源枯竭等严重问题，社会状况一落千丈。更为严重的是，在神权政治的体制下，玛雅王族和祭司将这种种“衰败之象”都归结为神灵的不满，所以他们更大规模地修建神庙，更频繁、更隆重地祭祀祈祷，期望能借神力扭转乾坤。当然，这样做的结果是浪费了更多的人力和已经贫乏殆尽的资源，直至陷入不可救药的恶性循环。随着农业生产供应的严重匮乏，玛雅古典时期高度发达的文明也开始崩溃。当城市周围贫瘠的荒地连成一片，饥饿就迫使玛雅人弃城而去了。经过百年衰败动荡之后，中央低地各城邦就都湮没在热带丛莽之中了。
4.太阳周期说
美国佛罗里达州大学地质学家戴维·霍德尔在最近的研究中发现，玛雅地区发生的旱灾具有明显的周期性，大旱灾每隔208年就会发生一次。因此，戴维·霍德尔提出了一个新的见解：玛雅文明的消失与太阳的周期性活动增强有关。霍德尔主持的这项研究，是从墨西哥南部的奇昌卡纳布湖湖底的沉积物开始的。他们在湖底钻孔，取得了1.9米的沉积岩岩芯样本，然后对样本中的碳酸钙浓度进行了研究。由于干旱年份湖水的蒸发量比较大，相对时期沉积物中碳酸钙的浓度也就比较高。碳酸钙浓度高的岩层，对应的年份就一定发生过旱灾。最后的研究结果是惊人的。沉积岩中的碳酸钙浓度，在年代上表现出了明显的周期性。每208年，湖底的沉积物中就有高浓碳酸钙层出现，换句话说，每隔208年，当地就会发生一次旱灾。最严重的一次发生在公元750年至850年，这正是玛雅文明消失的年代。而208年这个周期，与目前太阳活动每206年就有一次增强的周期正好吻合。很多专家也认为，这两个周期的吻合，决不是偶然的巧合。霍德尔在地质学上的研究，为解决一个历史之谜带来了新的突破。一些学者还猜测，在三大印第安文明中，玛雅文明尤其以天文历法和宗教体系而著称于世，这可能也和旱灾的发生有关。或许早在1000多年前，玛雅人就已经发现，天体的运动和他们的生活息息相关，所以他们才会以一种古代印第安人中少见的热情和执着，来观察各类天体的运动。
5.等级划分说
有学者认为，严格的等级划分是导致后古典时期文明衰落之后，玛雅文明销声匿迹的最主要原因。玛雅高深的知识和文明只掌握在极少数贵族和祭司的手中，占玛雅人口绝大多数的下层劳动者完全是文盲。这些养尊处优的贵族知识分子，在繁华殆尽后难以生存，乃至很快消失，从而也带走了辉煌无比的玛雅文明。留下来只是那些普通玛雅农民，他们自然无法读懂那些本来就一无所知的文字和史书了。
6.内战说
玛雅文明消失的原因也可能是争夺财富及权势的血腥内战，因自相残杀而毁灭的。一些学者认为，玛雅人并不是传说中那样热爱和平的民族，恰恰相反，在公元300年至700年这个全盛期，毗邻城邦的玛雅贵族们一直在进行着恐怖的争权夺利的战争。玛雅人的战争仿佛一场恐怖的体育竞赛：战卒们用矛和棒作兵器，袭击其他城市，其目的是抓获俘虏，并把他们交给己方祭司，作为向神献祭的礼品。这种祭祀正是玛雅社会崇拜神灵的标志。玛雅社会一度相当繁荣，农业、手工业以及商业贸易都非常发达，但自公元7世纪中期开始，玛雅社会衰落了。战争无止无休，生灵涂炭，贸易中断，城毁乡灭，最后只有10%的人幸存下来。
7.太空移民说
在布兰科“铭文神殿”中，曾发现一个很奇怪的皇家坟墓。它中间停放着一具巨大的石棺，里面躺着一位玛雅国王的遗骨。目前一般认为他曾是布兰科一位极受尊敬的国王，名字叫太阳陛下帕卡尔。这个布兰科的石棺是用一块巨大的木兰花色石灰石制成的，大约有5吨重，面积超过7平方米。石棺上盖有一个雕刻很复杂，上面刻画的是一个蜷曲的几乎处于W形状的玛雅人形。周围环绕他的是一些奇怪的图案。位于中心的人物看起来像是浮在那里一样。瑞士作家艾瑞兹·温·达尼肯于20世纪60年代在他的名著《神之战车》里提到，在棺盖中心处蜷着身子的那个人实际是一个宇航员，他正在控制自己那艘正在起飞的飞船。有些人甚至因此推测玛雅人突然消失的原因是他们跟随外星人的宇宙飞船一同离去了。当然，这只是一种猜测。不过，玛雅人对天文如此了如指掌，他们创造了奇迹般的玛雅文明，然后又神秘地消失了，或许他们真是外星人与人类的后裔，被先进的另一个星球的“祖先”给接走了。
8.沉入大海说
据有关资料显示，在大西洋中曾有一个大西洲，它经济繁荣，文化发达，可是在10000多年前的某一天，它一夜之间沉入了大海，从此毁灭了。翻开地图就可以发现，大西洲的位置离犹卡坦半岛很近。德国科学家莫克认为，玛雅人在公元前8499年6月5日13时开始了他们的******。在玛雅人中间流传着这样一句话：“世界由5个太阳主宰，一个太阳代表一个纪元”。如果以上材料真实可靠的话，那么，或许玛雅人会是幸存的大西洲人和美洲当地人的后代，他们深知祖先的毁灭，他们认为在公元后的某一天，又一个纪元将灭亡，所以集体向北迁移，并在之后的某一天，集体跳入大西洋，逃避世界的灭亡。当然，这一说法还有待论证。
9.内部暴乱说
据考古研究，在阿兹特克人到达陶帝华康城（Tonuhuacan）时，这座古城已经荒废了。考古学家认为大概是那里发生了推翻僧侣神权统治的暴动，其现存的神像统统被砍去脑袋，祭祀神庙也遭捣毁的事实，也暗示了这一点。据此，我们推测，或许玛雅文明消失原因也是如此。大量祭祀和压迫使得人民起来反抗，于是玛雅统治世界发生了大暴乱，从而导致了玛雅文明的灭亡。
10.祭祀杀人过多说
古玛雅人与阿兹特克人有许多相似之处。他们认为太阳将走向毁灭，他们认为自己的行为能延续太阳存在的时间，他们必须通过做一些自我牺牲来保留太阳的光芒四射，阻止它走向灭亡。他们这种认识导致了以人心和血来喂养太阳的做法。玛雅人以被用做祭祀为荣，奴隶主把奴隶的心脏挖出来献给太阳，于是为此死亡的人越来越多。据说，16世纪西班牙人曾在祭祀头颅架上发现过136000具头骨！当时，为了庆祝特偌提兰大金字塔的落成，在四天的祭祀中，奴隶主竟然杀死了36万人！我们认为，用于祭祀的人大多是族中身体健康的人。频繁的祭祀，使被杀的人越来越多。玛雅人大量减少，大概是造成玛雅文明消失的原因吧。
关于玛雅文明消失的原因，历来众说纷纭，大多数人倾向于相信当时玛雅人遭受地震、飓风的侵袭，加上人口爆炸、粮食不足、农民暴动和异族入侵（西班牙殖民者入侵）等多方面的原因，才造成了玛雅文明的衰亡。但是，确实的答案还没有出现，这个谜团的破解，目前不过刚刚开始。
玛雅预言解读
一、玛雅预言被发现
公元16世纪以前，在中美洲土地上，生活着许多原始的部落——玛雅人，他们过着刀耕火种的原始生活，几乎没有什么文化知识而言。然而现代考古却惊奇地发现，在这样一个极端落后的原始部族生活过的地方，却拥有很多超越我们现代文明的遗迹。
1582年，西班牙殖民者来到这片土地上。玛雅人派译者佳觉去进行联络，并向西班牙人介绍了自己民族的文明。西班牙随军主教迭戈德·郎达听完之后，大惊失色，他被玛雅典籍中所记载的历史吓得瞠目结舌，认为那是“魔鬼干的事情”。在向上天祈祷后，他竟残忍地下令将记载玛雅历史文明的、用象形文字书写的珍贵文献全部烧毁了，并将掌握玛雅文字的僧侣全部杀死。经过这场浩劫后，玛雅人留下的遗产就只剩下了《德累斯顿手稿》、《巴黎手稿》、《马德里手稿》、《格罗里耶手稿》等四种原始文献和一些石碑、雕刻。然而就是这一点点遗产，几百年来却使得专家和学者们伤透了脑筋，至今人们仍然无法读懂这些天书般的文献。
20世纪50年代后，为了更深入地研究玛雅文化，美国和前苏联都投入了大量的人力和物力，使用了先进的仪器包括电子计算机在内的各种破译方法及手段，同时结合石刻和印第安人的传说，但也仅仅破译出了其中的1/3。
在奎瑞瓜山顶有一块刻有象形文字的玛雅石碑，考古学家们根据已经辨认出的玛雅文字，意外地破译出这是一部玛雅人的编年史，内容记载的是公元前4亿至9000万年之间发生的事情。这一发现犹如石破天惊一般，科学家们无不惊诧万分。是啊！谁都知道，地球上的古猿是在100万年前出现的，人类的文明也仅有5000年。4亿年前，还处于中生代的地球留下了谁的印迹？玛雅编年史究竟记载了谁的历史？是史前文明社会还是外星人？难怪西班牙殖民者们认为那是“魔鬼干的事情”。
持“重复文明”观点的学者们推测：在地球50亿年的演化过程中，地球上的生物经历了5次大灭绝，生生死死，死死生生，周而复始，循环往复，因而地球上出现过多次高级文明社会，玛雅人就是其中之一。
二、玛雅人的世界末日预言
“地球并非人类所有，人类却是属于地球所有”
——引自《玛雅预言》
玛雅历法说，根据玛雅预言所示，现在我们所生存的地球，已经处在所谓的“第5太阳纪”。到目前为止，地球已经过了四个“太阳纪”，而在每一纪结束时，都会上演一幕惊心动魄的毁灭剧情。
第一个太阳纪是马特拉克堤利MATLACTIL ART（根达亚文明）。根达亚文明是一种超能力文明，人的身高只有1米左右，男人有第三只眼，翡翠色，功能各有不同，有具有预测力的，有具有杀伤力的等等。女人没有第三只眼，所以女人害怕男人。但是女人的子宫具有通神的能力，女人怀孕前会与天上要投生的神联系，谈好了，女人才会要孩子。根达亚文明毁灭于大陆沉没，但是很少有资料提到过根达亚文明，所以没有什么现代理论依据。
第二个太阳纪是伊厄科特尔Ehecatl（美索不达米亚文明）。美索不达米亚文明是根达亚文明的逃亡者的延续。但是人们把以前的事都忘记了，超能力也逐渐消失了。在根达亚文明里面，男人有第三只眼睛，可是到了美索不达米亚文明，男人的第三只眼逐渐消失了。他们对饮食特别偏好，发展出各色各样的专家，所以又被称为饮食文明。美索不达米亚文明发生在南极大陆，毁灭于地球磁极转换。但以上只有少数资料曾经提到过，也没有什么现代理论依据。
第三个太阳纪是奎雅维洛Tleyquiyahuillo（穆里亚文明）。这是玛雅人所推测的地球上的第三次文明，也称生物能文明。是美索布达米亚文明的逃亡者的延续。米索不达亚文明的先祖开始注意到植物在发芽时能产生能量，这种能量非常巨大。他们经过一个世纪的改良，终于发明了利用植物能的机器，这个机器可以放大能量。穆里亚文明毁灭于大陆沉没。但以上只有少数资料曾经提到过，也没有什么现代理论依据。
第四个太阳纪是宗德里里克Tzontlilic（亚特兰蒂斯文明）。亚特兰蒂斯是来自猎户座的殖民者。他们拥有光的能力，是在火雨的肆虐下导致了大地覆灭。早在穆里亚文明时期，亚特兰蒂斯就已经建立了。后来这两个文明还打过核战争。
不过，这四个太阳纪都因为证据不足而无法得到证实与合理解释。